本データは精密工学会外観検査アルゴリズムコンテスト2010年で用いた入力画像とそのトラッキング結果です。
教育・研究目的での使用に限ります。また、各Dataの使用にあたってはCopyright.txtに御留意ください。


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(*):データの説明：
東北大学 福田光則 先生提供のメラノサイトにおけるメラノソーム輸送の明視野顕微鏡観察画像です。
動態パターンの自動認識・解析が求められています。福田先生には定量解析の学術意義として下記説明文を頂きました。

---福田先生による説明---
メラノサイトにおけるメラノソームの動態：
メラノソームはメラニン色素を含むため、明視野顕微鏡での観察が可能であり、一つ一つの動きを追跡する事が出来ます。
これまでの研究では細胞骨格に沿ったメラノソームの移動速度として計測される事が一般的です。
例えば文献[Wu et al. J. Cell Biol (1998) 143:1899-1918]ではメラノサイトの細胞内に存在する一部のメラノソームを追跡しその動きをトレースするとともに、移動速度を測定しています。
メラノソームの輸送障害はヒトやマウスの色素異常を引き起こす事が知られており、病態発症の理解という観点からも(正常細胞と病態細胞における)メラノソーム輸送動態の解析は分子・細胞生物学分野における重要な研究課題です。

参考文献：
   [1]: Kuroda, T. S., Ariga, H. and Fukuda, M. (2003) The actin-binding domain of Slac2-a/melanophilin is required for melanosome distribution in melanocytes, Mol. Cell. Biol. 23, 5245-5255.
   [2]: Kuroda, T. S. and Fukuda, M. (2004) Rab27A-binding protein Slp2-a is required for peripheral melanosome distribution and elongated cell shape in melanocytes, Nature Cell Biol. 6, 1195-1203.

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(*):データ数: 全２０セット
   うち１４setが正常細胞（Normal）、６setがグリセリ症候群の細胞(Gricell)です。
   各データの詳細については、DataInfo.xlsxをご参照下さい。

(*):フォルダ構成（全体）
     Normal ____ set01 ________ LabeledImage
               |          |____ OriginalImage
               |          |____ TrackingAnswer
               |
               |
               /
               略
               /
               |
               |_ set14 _______ LabeledImage
                          |____ OriginalImage
                          |____ TrackingAnswer

     Gricell ____ set01 _______ LabeledImage
               |          |____ OriginalImage
               |          |____ TrackingAnswer
               |
               |
               /
               略
               /
               |
               |_ set06 _______ LabeledImage
                          |____ OriginalImage
                          |____ TrackingAnswer


(*):フォルダー構成(詳細）

(1):OriginalImage:入力の元画像(BMP)であり、拡張子の前の数字が時刻を表しています。

(2):LabeledImage:トラッキング対象のメラノソーム領域をマニュアルで塗りつぶした画像です。対象毎に色が違い、同色のメラノソームは時相間で対応しています。
   拡張子の前の数字はOriginalImage下の画像の数字と対応しています。XXXX_info.txtには色とメラノソームのIDの対応が書いてあります。

(3):TrackingAnswer:トラッキング結果の座標値、半径が各テキストファイルに記載されています。
    各テキストファイルのフォーマットは以下の仕様です。拡張子 (.txt)の前の数字がメラノソームのIDに対応しており､LabeledImage内のXXXX_info.txtに色との対応が書いてあります。
(3-1):座標の原点:左上のピクセルのピクセル中心を(0,0)とし､x軸の正方向を右、y軸の正方向を下とします。１ピクセルのピッチは1:1で一辺の長さは１です。
　　　例えば一番左上のピクセルの四つ角の座標値は、左上(-0.5,-0.5)、右上(0.5,- 0.5)、左下(-0.5,0.5)、右下(0.5,0.5)です。
(3-2):一行目: 時相の数(Integer)
(3-3):二行目以降の各行に各時相に対応する座標値(x,y)と時刻、半径がスペー ス区切りで記載されています。
　　　x座標(Float) y座標(Float) 時刻(Integer) 半径(Float)
　　　の順番です。時刻はゼロから始まり、今回は20時相なので19までです。
　　　(x,y)の座標値はメラノソームの領域重心で、半径は同一メラノソーム内で重心から最も遠いピクセルの角の座標までの距離です。
　　　つまり重心を中心とした半径の円内に領域抽出されたメラノソームのピクセル群が全て入っています。
　　　そのため、実際には２つのメラノソームが隣接しているだけで重なりがない場合でも、座標値及び半径から構成される２つの円は重なりあう場合があります。

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論文やHPなどで使用する場合は、下記Copyrightにしたがって福田研究室(東北大)と画像処理研究チーム(理研)をacknowledgeください。
Copyright (c) Mitsunori Fukuda (Tohoku University) and Image Processing Research Team (RIKEN), 2013.


 The input data OriginalImage folders are courtesy of Mitsunori Fukuda (Tohoku University, Japan). 
The tracking results are manually given by Image Processing Research Team of RIKEN, Japan.

All rights reserved by prof. Fukuda and Image Processing Research Team (RIKEN). 
This data is only allowed for educational and research purposes. 


(*):If you use only OriginalImage data then Prof. Mitsunori Fukuda should be mentioned in your paper when you use the data for research publication. 
Also you may cite the papers:
   (*): Kuroda, T. S., Ariga, H. and Fukuda, M. (2003) The actin-binding domain of Slac2-a/melanophilin is required for melanosome distribution in melanocytes, Mol. Cell. Biol. 23, 5245-5255.
   (*): Kuroda, T. S. and Fukuda, M. (2004) Rab27A-binding protein Slp2-a is required for peripheral melanosome distribution and elongated cell shape in melanocytes, Nature Cell Biol. 6, 1195-1203.


For the commercial use of the data, please contact Prof. Fukuda:
http://www.biology.tohoku.ac.jp/lab-www/fukuda_lab/home-en.html

(*): If you use both OriginalImage data and tracking results then Prof. Mitsunori Fukuda and Image Processing Research Team (RIKEN) should be mentioned in your paper when you use the both data for research publication.  

For the commercial use of the both data, please contact Image Processing Research Team, RIKEN, Japan:
http://www.riken.jp/brict/index_e.html

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