研究紹介

生命機能科学研究センター

細胞システム制御学研究ユニット

ユニットリーダー 谷口 雄一 (Ph.D.)
谷口 雄一 (Ph.D.)

当研究室では、1細胞レベルでの網羅的な遺伝子発現動態解析を通じてシステムバイオロジー研究を展開することを目的として研究を行います。最先端の1細胞内1分子遺伝子発現解析技術や、ハイスループット解析技術、MEMS技術、バイオインフォマティクス技術、細胞株ライブラリ技術などを融合することにより、1細胞レベルでの包括的な生命理解と網羅的な生物情報収集のための新しいテクノロジーを開発します。そしてこれらを用いて、1細胞レベルからの分化・発生等の生命過程を解析してその原理を追及すると共に、1細胞内の複雑な分子細胞状態を理解するための新しい概念とモデルを構築することを課題としています。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

総合理工

キーワード

  • 1細胞解析
  • 1分子・超解像顕微鏡
  • ゲノム構造
  • セントラルドグマ
  • システムワイド解析

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。
  1. Leclerc, S., Arntz, Y., Taniguchi, Y.:
    "Proteome-wide quantification of labeling homogeneity at the single molecule level"
    J. Vis. Exp. 146, e59199 (2019).
  2. Yoshida, Y., Taniguchi, Y.:
    "Simultaneous single-cell measurements demonstrate a positive correlation between RNA copy number for
    mitochondrial division and fusion genes and mitochondrial fragmentation"
    Cytologia 84, 15-23 (2019)
  3. Ohno M, Ando T, Priest D.G., et.al.:
    "Sub-nucleosomal genome structure reveals distinct nucleosome folding motifs"
    Cell (2019) doi: 10.1016/j.cell.2018.12.014
  4. Leclerc S, Arntz Y, Taniguchi Y.:
    "Extending Single Molecule Imaging to Proteome Analysis by Quantitation of Fluorescent Labeling Homogeneity in Complex Protein Samples"
    Bioconjugate Chemistry (2018) doi: 10.1021/acs.bioconjchem.8b00226
  5. Ohno M, Priest DG, Taniguchi Y.:
    "Nucleosome-level 3D organization of the genome"
    Biochemical Society Transactions (2018) doi: 10.1042/BST20170388
  6. Priest D, Tanaka N, Tanaka Y, Taniguchi Y.:
    "Micro-patterned agarose gel devices for single-cell high-throughput microscopy of E. coli cells"
    Scientific Reports 7. 17750 (2017) doi: 10.1038/s41598-017-17544-2
  7. Taniguchi Y.:
    "Autofluorescence imaging of tissue samples using super-high sensitivity fluorescence microscopy"
    Global Imaging Insights 2. 1-2 (2017) doi: 10.15761/GII.1000135
  8. Taniguchi, Y.:
    "Genome-Wide Analysis of Protein and mRNA Copy Numbers in Single Escherichia coli Cells with Single-Molecule Sensitivity"
    Methods Mol. Biol. 1346, 55-67 (2015)
  9. Ohno, M., Karagiannis, P. & Taniguchi, Y.:
    "Protein Expression Analyses at the Single Cell Level"
    Molecules 19, 13932-13947 (2014)
  10. *Taniguchi, Y., Choi, P. J., Li, G., Chen, H., Babu, M., et al.:
    "Quantifying E-coli Proteome and Transcriptome with Single-Molecule Sensitivity in Single Cells"
    Science 329, 533-538 (2010)

メンバーリスト

主宰者

谷口 雄一
ユニットリーダー

メンバー

城村 雅恵
研究員
KIM Soo Yeon
基礎科学特別研究員
KUMAR Vipin
リサーチアソシエイト
沖田 喜樹
大学院生リサーチ・アソシエイト
LATIEFA Binti Kamarulzaman
研修生
石田 真弓
テクニカルスタッフⅠ
大原 祥子
事務パートタイマーⅡ
WANG Yue
研究パートタイマーⅡ
奥田 ゆり子
アシスタント