研究紹介

主任研究員研究室

関植物エピゲノム制御研究室

主任研究員 関 原明 (Ph.D.)
関 原明 (Ph.D.)

当研究室は、エピゲノム制御ネットワークの解明に基づいて植物の生命現象を理解することを目指して研究を進めています。ヒストンの翻訳後修飾および非翻訳型RNAは、遺伝子の発現制御やクロマチンの構造変化・安定性などに重要な役割を持っています。モデル植物を用いてこれらの分子機構を明らかにして、植物の生長制御、環境適応など様々な生命機能における役割を理解しようとしています。

研究主分野

化学 / 総合生物 / 農学

研究関連分野

生物学

キーワード

  • 環境ストレス適応
  • エピゲノム制御
  • RNA制御
  • 化学制御
  • 有用キャッサバの分子育種

主要論文

  1. Nakaminami, K., Okamoto, M., Higuchi-Takeuchi, M., Yoshizumi, T., Yamaguchi, Y., Fukao, Y., Shimizu, M., Ohashi, C., Tanaka, M., Matsui, M., Shinozaki, K., Seki, M.* and Hanada, K.*.:
    ”AtPep3 is a hormone-like peptide that plays a role in salinity stress tolerance of plants.”
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115, 5810-5815 (2018).
  2. Ueda, M., Matsui, A., Tanaka, M., Nakamura, T., Abe, T., Sako, K., Sasaki, T., Kim, J.M., Ito, A., Nishino, N., Shimada, H., Yoshida, M. and Seki, M.:
    “The distinct role of RPD3-like histone deacetylases between class I and II in salinity stress response” Plant Physiol. 175:1760-1773 (2017).
  3. Matsui, A., Iida, K., Tanaka, M., Yamaguchi, K., Mizunashi, K., Kim, J.M., Takahashi, S., Kobayashi, N., Shigenobu, S., Shinozaki, K. and Seki, M.:
    “Novel stress-inducible antisense RNAs of protein-coding loci are synthesized by Arabidopsis RDRs”
    Plant Physiol. 175: 457-472 (2017).
  4. Nguyen, H.M., Sako, K., Matsui, A., Suzuki, Y., Mostofa, M.G., Ha, C.V., Tanaka, M., Tran, L.S.P., Habu, Y. and Seki, M.:
    “Ethanol enhances high-salinity stress tolerance by detoxifying reactive oxygen species in Arabidopsis thaliana and rice”
    Front. Plant Sci. 8: 1001 (2017).
  5. Kim, J.M., To, K.T., Matsui, A., Tanoi, K., Kobayashi, N.I., Matsuda, F., Habu, Y., Ogawa, D., Sakamoto, T., Matsunaga, S., Bashir, K., Rasheed, S., Ando, M., Takeda, H., Kawaura, K., Kusano, M., Fukushima, A., Endo, A.T., Kuromori, T., Ishida, J., Morosawa, T., Tanaka, M., Torii, C., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Ogihara, Y., Saito, K., Shinozaki, K., Devoto, A. and Seki, M.:
    “Acetate-mediated novel survival strategy against drought in plants”
    Nature Plants 3: 17097 (2017).
  6. Sako, K., Kim, J.M., Matsui, A., Nakamura, K., Tanaka, M., Kobayashi, M., Saito, K., Nishino, N., Kusano, M., Taji, T., Yoshida, M. and Seki, M.:
    “Ky-2, a histone deacetylase inhibitor, enhances high-salinity stress tolerance in Arabidopsis thaliana”
    Plant Cell Physiol. 57:776-783 (2016)
  7. To, T.K., Kim, J.M., Matsui, A., Kurihara, Y., Morosawa, T., Ishida, J., Tanaka, M., Endo, T., Kakutani, T., Toyoda, T., Kimura, H., Yokoyama, S., Shinozaki, K. and Seki, M.:
    “Arabidopsis HDA6 regulates locus-directed heterochromatin silencing in cooperation with MET1”
    PLoS Genet. 7:e1002055 (2011).
  8. Kurihara, Y., Matsui, A., Hanada, K., Kawashima, M., Ishida, J., Morosawa, T., Tanaka, M., Kaminuma, E., Mochizuki, Y., Matsushima, A., Toyoda, T., Shinozaki, K. and Seki, M.:
    “Genome-wide suppression of aberrant mRNA-like noncoding RNAs by NMD in Arabidopsis”
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106:2453-2458 (2009).
  9. Matsui, A., Ishida, J., Morosawa, T., Mochizuki, Y., Kaminuma, E., Endo, T.A., Okamoto, M., Nambara, E., Nakajima, M., Kawashima, M., Satou, M., Kim, J.M., Kobayashi, N., Toyoda, T., Shinozaki, K. and Seki, M.: “Arabidopsis Transcriptome Analysis under Drought, Cold, High-Salinity and ABA Treatment Conditions using a Tiling Array”
    Plant Cell Physiol. 49: 1135-1149 (2008).
  10. Seki, M., Narusaka, M., Kamiya, A., Ishida, J., Satou, M., Sakurai, T., Nakajima, M., Enju, A., Akiyama, K., Oono, Y., Muramatsu, M., Hayashizaki, Y., Kawai, J., Carninci, P., Itoh, M., Ishii, Y., Arakawa, T., Shibata, K., Shinagawa, A. and Shinozaki, K.:
    “Functional annotation of a full-length Arabidopsis cDNA collection”
    Science 296: 141-145 (2002).