研究紹介

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ライフサイエンス技術基盤研究センター

分子ネットワーク制御ゲノミクスユニット

ユニットリーダー ARNER Erik (Ph.D.)
ARNER Erik (Ph.D.)

独自のトランスクリプトーム解析技術を核とするオミックス解析技術を駆使して、最適の制御標的を探り、制御分子の機能を調べる研究を行います。具体的に は、1)シグナル伝達経路における最適な干渉部位を探索する技術の開発、2)制御分子の作用を細胞レベルで詳細に解析する技術の開発、3)単一細胞レベル で制御標的や制御分子を解析するための基盤技術の開発を行います。

研究主分野

分子生物 & 遺伝学

研究関連分野

生物学 & 生化学 / 薬学 & 毒物学 / 臨床医学 / コンピューター科学 / 学際研究

研究テーマ

  • プロモーターとエンハンサーによる転写調節
  • 薬物応答性に関する遺伝子発現プロファイル
  • 疾患の分子メカニズム

主要論文

  1. Arner E, Daub CO, Vitting-Seerup K, Andersson R et al.:
    "Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells."
    Science. 2015; 347(6225):1010-4.
  2. Andersson R, Gebhard C, Miguel-Escalada I, Hoof I, Bornholdt J, Boyd M, Chen Y, Zhao X, Schmidl C, Suzuki T, Ntini E, Arner E et al.:
    "An atlas of active enhancers across human cell types and tissues."
    Nature. 2014; 507(7493):455-61.
  3. Forrest ARR, Kawaji H, Rehli M, Baillie JK, de Hoon MJL, Haberle V, Lassmann T, Kulakovskiy IV, Lizio M, Itoh M, Andersson R, Mungall CJ, Meehan TF, Schmeier S, Bertin N, Jørgensen M, Dimont E, Arner E et al.:
    "A promoter level mammalian expression atlas."
    Nature. 2014; 507(7493):462-70.
  4. Rönnerblad M, Andersson R, Olofsson T, Douagi I, Karimi M, Lehmann S, Hoof I, Sandelin A, de Hoon M, Itoh M, Nago-Sato S, Kawaji H, Lassmann T, Carninci P, Hayashizaki Y, Forrest ARR, Ekwall K, Arner E, Lennartsson A.:
    "Analysis of the DNA methylome and transcriptome in granulopoiesis reveal timed changes and dynamic enhancer methylation."
    Blood. 2014; 123(17):e79-89.
  5. Prasad P, Rönnerblad M, Arner E, Itoh M, Kawaji H, Lassmann T, Daub C, Forrest ARR, Lennartsson A, Ekwall K.:
    "High-throughput transcription profiling identifies putative epigenetic regulators of hematopoiesis."
    Blood. 2014; 123(17):e46-57.
  6. Arner E, Forrest ARR, Ehrlund A, Mejhert N, Itoh M, Kawaji H, Lassmann T, Laurencikiene J, Rydén M, Arner P.:
    "Ceruloplasmin is a novel adipokine which is overexpressed in adipose tissue of obese subjects and in obesity-associated cancer cells."
    PLOS ONE. 2014; 9(3):e80274.
  7. Gao H, Mejhert N, Fretz JA, Arner E, Lorente-Cebrián S, Ehrlund A, Dahlman-Wright K, Gong X, Strömblad S, Douagi I, Laurencikiene J, Dahlman I, Daub CO, Rydén M, Horowitz MC, Arner P.:
    "Early B cell factor 1 regulates adipocyte morphology and lipolysis in white adipose tissue."
    Cell Metab. 2014; 19(6):981-92.
  8. Arner E, Mejhert N, Kulyté A, Balwierz PJ, Pachkov M, Cormont M, Lorente-Cebrián S, Ehrlund A, Laurencikiene J, Hedén P, Dahlman-Wright K, Tanti JF, Hayashizaki Y, Rydén M, Dahlman I, van Nimwegen E, Daub CO, Arner P.]
    "Adipose tissue microRNAs as regulators of CCL2 production in human obesity."
    Diabetes. 2012; 61(8):1986-93.
  9. Suzuki H, Forrest AR, van Nimwegen E, Daub CO, Balwierz PJ, Irvine KM, Lassmann T, Ravasi T, Hasegawa Y, de Hoon MJ, Katayama S, Schroder K, Carninci P, Tomaru Y, Kanamori-Katayama M, Kubosaki A, Akalin A, Ando Y, Arner E et al.:
    "The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line."
    Nat Genet. 2009; 41(5):553-62.
  10. Spalding KL, Arner E, Westermark PO, Bernard S, Buchholz BA, Bergmann O, Blomqvist L, Hoffstedt J, Näslund E, Britton T, Concha H, Hassan M, Rydén M, Frisén J, Arner P.:
    "Dynamics of fat cell turnover in humans."
    Nature. 2008; 453(7196):783-7.

メンバーリスト

主宰者

ARNER Erik
ユニットリーダー

メンバー

古野 正朗
上級研究員
KWON TaeJun
研究員
HUANG Yi
特別研究員
荒川 貴博
テクニカルスタッフⅠ

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