研究紹介

ライフサイエンス技術基盤研究センター

細胞機能変換技術研究チーム

チームリーダー 鈴木 治和 (Ph.D.)
鈴木 治和 (Ph.D.)

再生医療には様々な有用細胞を得る必要がありますが、iPS細胞のように受精卵に近い状態に戻してから再分化させるのみならず、分化細胞から直接変換することも可能です。こういった細胞機能変換を目指して、細胞の転写状態、転写制御ネットワーク、エピゲノム、ノンコーディングRNAの知識を統合して、ゲノム領域特異的なエピゲノム修飾変換法を含む新たな技術開発を行います。こうした技術は幹細胞の分化や安全性の研究や、疾患治療にも応用が期待されます。

研究主分野

生物学 & 生化学

研究関連分野

分子生物 & 遺伝学

研究テーマ

  • 細胞機能変換技術の開発
  • 哺乳動物における転写制御ネットワーク解析
  • 薬物作用のプロモーター解析

主要論文

  1. Hon CC, Ramilowski JA, Harshbarger J, Bertin N, Rackham OJ, Gough J, Denisenko E, Schmeier S, Poulsen TM, Severin J, Lizio M, Kawaji H, Kasukawa T, Itoh M, Burroughs AM, Noma S, Djebali S, Alam T, Medvedeva YA, Testa AC, Lipovich L, Yip CW, Abugessaisa I, Mendez M, Hasegawa A, Tang D, Lassmann T, Heutink P, Babina M, Wells CA, Kojima S, Nakamura Y, Suzuki H, Daub CO, de Hoon MJ, Arner E, Hayashizaki Y, Carninci P, Forrest AR.
    "An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5' ends."
    Nature. 543(7644):199-204 (2017)
  2. Li JR, Suzuki T, Nishimura H, Kishima M, Maeda S, Suzuki H.
    "Asymmetric Regulation of Peripheral Genes by Two Transcriptional Regulatory Networks."
    PLoS One. 11(8):e0160459 (2016)
  3. Rackham OJ, Firas J, Fang H, Oates ME, Holmes ML, Knaupp AS; FANTOM Consortium, Suzuki H, Nefzger CM, Daub CO, Shin JW, Petretto E, Forrest AR, Hayashizaki Y, Polo JM, Gough J.
    "A predictive computational framework for direct reprogramming between human cell types."
    Nat Genet. 48(3):331-5 (2016)
  4. Murakawa Y, Yoshihara M, Kawaji H, Nishikawa M, Zayed H, Suzuki H, Fantom Consortium, Hayashizaki Y.
    "Enhanced Identification of Transcriptional Enhancers Provides Mechanistic Insights into Diseases."
    Trends Genet. 32(2):76-88 (2016)
  5. S. Roy, R. Guler, S.P. Parihar, S. Schmeier, B. Kaczkowski, H. Nishimura, J.W. Shin, Y. Negishi, M. Ozturk, R. Hurdayal, A. Kubosaki, Y. Kimura, M.J.L. de Hoon, Y. Hayashizaki, F. Brombacher, H. Suzuki.
    "Batf2/Irf1 induces inflammatory responses in classically activated macrophages, LPS and mycobacterial infection."
    J Immunol. 194(12):6035-44 (2015)
  6. Arner E, Daub CO, Vitting-Seerup K, Andersson R, Lilje B, Drablos F, Lennartsson A, Rönnerblad M, Hrydziuszko O, Vitezic M, Freeman TC, Alhendi A, Arner P, Axton R, Baillie JK, Beckhouse A, Bodega B, Briggs J, Brombacher F, Davis M, Detmar M, Ehrlund A, Endoh M, Eslami A, Fagiolini M, Fairbairn L, Faulkner GJ, Ferrai C, Fisher ME, Forrester L, Goldowitz D, Guler R, Ha T, Hara M, Herlyn M, Ikawa T, Kai C, Kawamoto H, Khachigian L, Klinken PS, Kojima S, Koseki H, Klein S, Mejhert N, Miyaguchi K, Mizuno Y, Morimoto M, Morris KJ, Mummery C, Nakachi Y, Ogishima S, Okada-Hatakeyama M, Okazaki Y, Orlando V, Ovchinnikov D, Passier R, Patrikakis M, Pombo A, Qin XY, Roy S, Sato H, Savvi S, Saxena A, Schwegmann A, Sugiyama D, Swoboda R, Tanaka H, Tomoiu A, Winteringham LN, Wolvetang E, Yanagi-Mizuochi C, Yoneda M, Zabierowski S, Zhang P, Abugessaisa I, Bertin N, Diehl AD, Fukuda S, Furuno M, Harshbarger J, Hasegawa A, Hori F, Ishikawa-Kato S, Ishizu Y, Itoh M, Kawashima T, Kojima M, Kondo N, Lizio M, Meehan TF, Mungall CJ, Murata M, Nishiyori-Sueki H, Sahin S, Sato-Nagao S, Severin J, de Hoon MJ, Kawai J, Kasukawa T, Lassmann T, Suzuki H, Kawaji H, Summers KM, Wells C; FANTOM Consortium, Hume DA, Forrest AR, Sandelin A, Carninci P, Hayashizaki Y.
    "Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells."
    Science. 347(6225):1010-4 (2015)
  7. Tomaru Y, Hasegawa R, Suzuki T, Sato T, Kubosaki A, Suzuki M, Kawaji H, Forrest AR, Hayashizaki Y; FANTOM Consortium, Shin JW, Suzuki H.
    "A transient disruption of fibroblastic transcriptional regulatory network facilitates trans-differentiation."
    Nucleic Acids Res. 42(14):8905-13 (2014)
  8. Andersson R, Gebhard C, Miguel-Escalada I, Hoof I, Bornholdt J, Boyd M, Chen Y, Zhao X, Schmidl C, Suzuki T, Ntini E, Arner E, Valen E, Li K, Schwarzfischer L, Glatz D, Raithel J, Lilje B, Rapin N, Bagger FO, Jørgensen M, Andersen PR, Bertin N, Rackham O, Burroughs AM, Baillie JK, Ishizu Y, Shimizu Y, Furuhata E, Maeda S, Negishi Y, Mungall CJ, Meehan TF, Lassmann T, Itoh M, Kawaji H, Kondo N, Kawai J, Lennartsson A, Daub CO, Heutink P, Hume DA, Jensen TH, Suzuki H, Hayashizaki Y, Müller F; FANTOM Consortium, Forrest AR, Carninci P, Rehli M, Sandelin A.
    "An atlas of active enhancers across human cell types and tissues."
    Nature. 507(7493):455-61 (2014)
  9. The FANTOM Consortium and the RIKEN PMI and CLST (DGT)
    "A promoter-level mammalian expression atlas."
    Nature. 507(7493):462-70 (2014)
  10. Kajiyama K, Okada-Hatakeyama M, Hayashizaki H, Kawaji H, Suzuki H.
    "Capturing drug responses by quantitative promoter activity profiling."
    CPT: Pharmacometrics & Systems Pharmacology, 2:e77 (2013)

メンバーリスト

主宰者

鈴木 治和
チームリーダー

メンバー

古野 正朗
上級研究員
LI Jing-Ru
特別研究員
藪上 春香
テクニカルスタッフⅠ

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22

Harukazu [at] gsc.riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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