研究紹介

ライフサイエンス技術基盤研究センター

核酸診断技術開発ユニット

ユニットリーダー 臼井 健悟 (Ph.D.)
臼井 健悟 (Ph.D.)

特定の病気に対するなりやすさや薬に対する副作用の現れ方を予測したり、感染症における病原体の検出には、生物が持つ遺伝情報物質であるゲノムを調べるDNA検査が一般的になっています。一方、病気の細胞(例えば癌細胞)と通常の細胞とで遺伝子発現の違いをはっきり区別できるRNA(マーカーとして有用なRNAなど)の情報も、これからの個別化医療に有用です。私たちは、DNAマーカーやRNAマーカーを数分間のうちに、簡便、高信頼性、かつ複雑な測定機器を必要としない試験法で迅速に同定する技術を開発しています。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

医歯薬学

研究テーマ

  • 核酸増幅法による遺伝子迅速診断法の開発
  • 薬剤耐性判定も可能とする高感度インフルエンザ検出系の構築
  • 生体試料からの迅速ゲノム抽出法開発

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。
  1. *Kimura, Y., Hanami, T., Tanaka, Y., De Hoon, MJ., Soma, T., Harbers, M., Lezhava, A., Hayashizaki, Y., and Usui, K.:
    "Effect of thiazole orage double-labeled thymidine on DNA duplex formation."
    Biochemistry, 51, 6056-6067 (2012).
  2. *Kawai, Y., Kimura, Y., Lezhava, A., Kanamori, H., Usui, K., Hanami, T., Soma, T., Morlighem, JÉ., Saga, S., Ishizu, Y., Aoki, S., Endo, R., Oguchi-Katayama, A., Kogo, Y., Mitani, Y., Ishidao, T., Kawakami, C., Kurata, H., Furuya, Y., Saito, T., Okazaki, N., Chikahira, M., Hayashi, E., Tsuruoka, S., Toguchi, T., Saito, Y., Ban, T., Izumi, S., Uryu, H., Kudo, K., Sakai-Tagawa, Y., Kawaoka, Y., Hirai, A., Hayashizaki, Y., and Ishikawa, T. :
    "One-step detection of the 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus by the RT-SmartAmp assay and its clinical validation."
    PLoS One, 7, e30236 (2012).
  3. *Tanaka, Y., Kimura, Y., Mitani, Y., Kawai, Y., Lezhava, A., Noma, S., Tagami, M., Kawai, J., Hayashizaki, Y., and Usui, K. :
    "Effect of the turn-back primer for intermediate product generation on isothermal DNA amplification."
    BioTechniques, 49, 888-892 (2010).
  4. *Xuan, HT., Bertin, N., Ninomiya, N., Fukuda, S., Usui, K., Kawai, J., Hayashizaki, Y., and Suzuki, H. :
    "Development of a high-throughput method for the systematic identification of human proteins nuclear translocation potential."
    BMC Cell Biol., 10: 69, 1-11 (2009).
  5. *Ogawa, C., Usui, K., Ito, F., Itoh, M., Hayashizaki, Y., and Suzuki H. :
    "Role of SMN protein components in snRNP assembly."
    J. Biol. Chem., 284, 14609-14617 (2009).
  6. *Ito, F., Usui, K., Kawahara, D., Suenaga, A., Maki, T., Kidoaki, S., Suzuki, H., Taiji, M., Itoh, M., Hayashizaki, Y., and T Matsuda. :
    "Reversible Hydrogel Formation Driven by Protein-Peptide-Specific Interaction and Chondrocyte Entrapment."
    Biomaterials, 31, 58-66 (2009).
  7. *Tatsumi, K., Mitani, Y., Watanabe, J., Takakura, H., Hoshi, K., Kawai, Y., Kikuchi, T., Kogo, Y., Katayama, A., Tomaru, Y., Kanamori, H., Baba, M., Ishidao, T., Usui, K., Itoh, M., Cizdziel, P., Lezhava, A., Ueda, M., Ichikawa, Y., Endo, I., Shimada, H., and Hayashizaki, Y. :
    "Rapid screening assay for KRAS mutations by the modified smart amplification process."
    J. Mol. Diagn., 10, 520-526 (2008).
  8. *Usui, K., Maki, T., Ito, F., Suenaga, A., Kidoaki, S., Itoh, M., Taiji, M., Matsuda, T., Hayashizaki, Y., and Suzuki, H. :
    "Nanoscale elongating control of the self-assembled protein filament with the cysteine-introduced building blocks."
    Protein Science, 18, 960-969 (2009).
  9. *Kawai, Y., Kikuchi, T., Mitani, Y., Kogo, Y., Itoh, M., Usui, K., Kanamori, H., Kaiho, A., Takakura, H., Hoshi, K., Cizdziel, P., and Hayashizaki, Y. :
    "Sensitive detection of EGFR mutations using a competitive probe to suppress background in the SMart Amplification process."
    Biologicals, 36, 234-238 (2008).
  10. *Watanabe, J., Mitani, Y., Kawai, Y., Kikuchi, T., Kogo, Y., Oguchi-Katayama, A., Kanamori, H., Usui, K., Itoh, M., Cizdziel, P., Lezhava, A., Tatsumi, K., Ichikawa, Y., Togo, S., Shimada, H., Hayashizaki, Y. :
    "Use of a competitive probe in assay design for genotyping of the UGT1A1*28 microsatellite polymorphism by the smart-amplification process."
    Biotechniques, 43, 479-484 (2007).

メンバーリスト

主宰者

臼井 健悟
ユニットリーダー

メンバー

花見 健志
研究員
田中 有希
研究員

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Tel: 045-503-9222
Fax: 045-503-9216

kusui [at] gsc.riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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