研究紹介

ライフサイエンス技術基盤研究センター

超分子構造解析研究チーム

チームリーダー 関根 俊一 (Ph.D.)
関根 俊一 (Ph.D.)

細胞の中では、タンパク質等の高分子が複数集まった巨大分子複合体がはたらいています。当チームは、巨大分子複合体の調製法を確立し、SPring-8/SACLAの放射光や分光学的手法を駆使した新たな解析技術基盤を構築します。これを用いてRNAポリメラーゼと転写因子との複合体に代表される巨大複合体を解析し、細胞内の遺伝子・RNA・タンパク質のネットワークの動作原理を立体構造のレベルで解明します。また、細菌やウイルスが持つ複製・転写系タンパク質は阻害剤のターゲットとして重要であることから、それらの立体構造解析により、創薬研究への貢献が期待できます。

研究関連分野

生物学

研究テーマ

  • RNAポリメラーゼによる転写および転写制御の基本原理の解明
  • 超分子複合体の調製・解析技術の開発および高度化
  • 細菌・ウイルスの複製・転写機構の解明と創薬への応用

主要論文

  1. Sekine, S., Murayama, Y., Svetlov, V., Nudler, E. and Yokoyama, S.:
    "The ratcheted and ratchetable structural states of RNA polymerase underlie multiple transcriptional functions"
    Mol Cell. 57, 408-421. 2015.
  2. Antonopoulos, I.H., Murayama, Y., Warner, B.A., Sekine, S., Yokoyama, S. and Carey, P.R.:
    "Time-resolved Raman and polyacrylamide gel electrophoresis observations of nucleotide incorporation and misincorporation in RNA within a bacterial RNA polymerase crystal"
    Biochemistry 54, 652-665. 2015.
  3. Higo, T., Suka, N., Ehara, H., Wakamori, M., Sato, S., Maeda, H., Sekine, S., Umehara, T., Yokoyama, S.:
    "Development of a hexahistidine-3×FLAG-tandem affinity purification method for endogenous protein complexes in Pichia pastoris"
    J. Struct. Funct. Genomics. 15, 191-199. 2014.
  4. Naganuma, M., Sekine, S., Chong, Y.E., Guo, M., Yang, X.L., Gamper, H., Hou, Y.M., Schimmel, P. and Yokoyama, S.:
    "The selective tRNA aminoacylation mechanism based on a single G•U pair"
    Nature 510, 507-511. 2014.
  5. Tagami, S., Sekine, S., Minakhin, L., Esyunina, D., Akasaka, R., Shirouzu, M., Kulbachinskiy, A., Severinov, K. and Yokoyama, S.:
    "Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor"
    Genes Dev. 28, 521-531. 2014.
  6. Itoh, Y., Bröcker, M.J., Sekine, S., Hammond, G., Suetsugu, S., Söll, D. and Yokoyama, S.:
    "The decameric SelA tRNASec ring structure reveals the mechanism of bacterial selenocysteine formation."
    Science. 340, 75-78. 2013.
  7. Murayama, Y., Sekine, S. and Yokoyama, S.:
    "Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analyses of Thermus thermophilus backtracked RNA polymerase"
    Acta Cryst. F69, 174-177. 2013.
  8. Sekine, S., Tagami, S. and Yokoyama, S.:
    "Structural basis of transcription by bacterial and eukaryotic RNA polymerases"
    Curr. Opin. Struct. Biol., 22, 110-118. 2012.

メンバーリスト

主宰者

関根 俊一
チームリーダー

メンバー

清水 英明
研究員
上島 珠美
研究員
村山 祐子
研究員
江原 晴彦
研究員

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Tel: 045-503-9204 (ext 3212)

shunichi.sekine [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

関連リンク

最新の研究成果