研究紹介

環境資源科学研究センター

バイオマス研究基盤チーム

チームリーダー 篠崎 一雄 (D.Sci.)
篠崎 一雄 (D.Sci.)

植物や微生物等の関連リソースやゲノム情報等の基盤整備、メタボローム解析手法などに関わる研究開発が目的です。セルロースバイオマス増産研究のモデル植物として期待される「ブラキポディウム」におけるセルロース生産向上、生長や環境耐性の向上等に関わる遺伝子資源などのリソース整備を実施するとともに、シロアリ共生微生物群などを対象に、メタゲノム解析及びシングルセルでのゲノム解析を行います。

研究主分野

生物学

研究関連分野

農学

キーワード

  • 環境ストレス
  • バイオマス
  • 逆遺伝学
  • 比較ゲノム科学

主要論文

  1. Takahashi, F., Tilbrook, J., Trittermann, C., Berger, B., Roy, S. J., Seki, M., Shinozaki, K. and Tester, M. :
    "Comparison of Leaf Sheath Transcriptome Profiles with Physiological Traits of Bread Wheat Cultivars under Salinity Stress"
    PloS one, 10, e0133322. (2015)
  2. Yuki, M., Kuwahara, H., Shintani, M., Izawa, K., Sato, T., Starns, D., Hongoh, Y., Ohkuma, M. :
    "Dominant ectosymbiotic bacteria of cellulolytic protists in the termite gut also have the potential to digest lignocellulose"
    Environ Micobiol, 17, 4942-4963. (2015)
  3. Kakei, Y., Mochida, K., Sakurai, T., Yoshida, T., Shinozaki, K. and Shimada, Y. :
    "Transcriptome analysis of hormone-induced gene expression in Brachypodium distachyon"
    Sci Rep, 5, 14476. (2015)
  4. Takahashi, F., Mizoguchi, T., Yoshida, R., Ichimura, K ., and Shinozaki, K .:
    "Calmodulin-Dependent Activation of MAP Kinase for ROS Homeostasis in Arabidopsis"
    Molecular Cell 41, 649-660 (2011).
  5. Mochida, K ., and Shinozaki, K .:
    "Advances in Omics and Bioinformatics Tools for Systems Analyses of Plant Functions"
    Plant Cell Physiol. 52, 2017-2038 (2011).
  6. Kazama, Y, Ma, L, Hirano, T, Ohbu, S, Shirakawa, Y, Hatakeyama, S, Tanaka, S., and Abe, T.:
    "Rapid evaluation of effective linear energy transfer in heavy ion utagenesis of Arabidopsis thaliana"
    Plant Biotechnol. 29, 440-444 (2012).
  7. Otagiri, M, Lopez, CM, Kitamoto, K, Arioka, M, Kudo, T., and Moriya, S.:
    "Heterologous Expression and Characterization of a Glycoside Hydrolase Family 45 endo-β-1,4-Glucanase from a Symbiotic Protist of the Lower Termite"
    Reticulitermes speratus Appl Biochem Biotechnol., 169, 1910-1918 (2013).
  8. Mochida, K., Uehara-Yamaguchi, Y., Takahashi, F., Yoshida, T., Sakurai, T. and Shinozaki, K.:
    "Large-scale collection and analysis of full-length cDNAs from Brachypodium distachyon and integration with pooideae sequence resources."
    PloS one, 8: e75265. (2013).
  9. Himuro, Y., Ishiyama, K., Mori, F., Gondo, T., Takahashi, F., Shinozaki, K., Kobayashi, M. and Akashi, R.:
    "Arabidopsis galactinol synthase AtGolS2 improves drought tolerance in the monocot model Brachypodium distachyon"
    J plant physiol. 171, 1127-1131 (2014).
  10. Nakashima, K., Yamaguchi-Shinozaki, K. and Shinozaki, K.:
    "The transcriptional regulatory network in the drought response and its crosstalk in abiotic stress responses including drought, cold, and heat"
    Front Plant Sci., 5, 170 (2014).

メンバーリスト

主宰者

篠崎 一雄
チームリーダー

メンバー

守屋 繁春
専任研究員
小林 正智
上級研究員
阿部 知子
上級研究員
大熊 盛也
上級研究員
菊地 淳
上級研究員
小田切 正人
研究員
高橋 史憲
研究員
雪 真弘
研究員
小林 裕子
テクニカルスタッフⅡ

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22 東研究棟 8階E804室
Tel: 045-503-9582
Fax: 045-503-9580

〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1 研究棟(第二期) 3階314室
Tel: 029-836-4359
Fax: 029-836-9060

kazuo.shinozaki [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

関連リンク

最新の研究成果

2016年10月11日: 報道発表資料
植物の細胞壁を改変