研究紹介

環境資源科学研究センター

合成ゲノミクス研究グループ

グループディレクター 松井 南 (D.Sci.)
松井 南 (D.Sci.)

近年のゲノム技術の進展によって、種々の生物の全ゲノム配列が次々と解読されています。これらの膨大な情報は、生命現象を解き明かすとともに、種々の生物の多様性を分子レベルで明らかにすることを可能にします。当研究グループでは、バイオプラスチック合成を始め、多様な生物の有用な遺伝子情報を利用することで、今までゲノム研究で培った知恵を新たな資源循環型社会実現のための基礎となる研究を行います。ソルガム、パラゴムノキ等の資源植物を用いることで、基礎研究で得られた研究成果の応用を進めます。

研究主分野

生物学

研究関連分野

化学 / 農学

キーワード

  • 植物バイオマス
  • 植物ゲノム
  • 環境応答

主要論文

  1. Makita Y., Ng KK.,Singham V.,Kawashima M., Hirakawa H., Sato S., Othman AS., Matsui M.:
    "Large-scale collection of full-length cDNA and transcriptome analysis in Hevea brasiliensis"
    DNA Res. 24 (2): 159-167 (2017).
  2. Ong, WD., Okubo-Kurihara, E., Kurihara, Y., Shimada, S., Makita, Y., Kawashima, M., Honda, K., Kondoh, Y., Watanabe, N., Osada, H., Cutler, SR., Sudesh, K., Matsui, M.:
    "Chemical-Induced Inhibition of Blue Light-Mediated Seedling Development Caused by Disruption of Upstream Signal Transduction Involving Cryptochromes in Arabidopsis thaliana."
    Plant Cell Physiol. 58 (1): 95-105 (2017)
  3. Lau, N. S., Makita, Y., Kawashima, M., Taylor, T. D., Kondo, S., Othman, A. S., Shu-Chien, A. C.and Matsui, M.:
    "The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis"
    Sci Rep, 6: 28594 (2016).
  4. Wang, Q., Zuo, Z., Wang, X., Gu, L., Yoshizumi, T., Yang, Z., Yang, L., Liu, Q., Liu, W., Han, Y. J., Kim, J. I., Liu, B., Wohlschlegel, J. A., Matsui, M., Oka, Y.and Lin, C.:
    "Photoactivation and inactivation of Arabidopsis cryptochrome 2"
    Science, 354: 343-347 (2016)
  5. Okubo-Kurihara, E., Ohtani, M., Kurihara, Y., Kakegawa, K., Kobayashi, M., Nagata, N., Komatsu, T., Kikuchi, J., Cutler, S., Demura, T.and Matsui, M.:
    "Modification of plant cell wall structure accompanied by enhancement of saccharification efficiency using a chemical, lasalocid sodium"
    Sci Rep, 6: 34602 (2016).
  6. Shimada, S., Makita, Y., Kuriyama-Kondou, T., Kawashima, M, Mochizuki, Y., Hirakawa, H., Sato, S., Toyoda, T. Matsui, M.: 
    "Functional and expression analyses of transcripts based on full-length cDNAs of Sorghum bicolor."
    DNA Res. 22, 485-93 (2015)
  7. Makita, Y.; Shimada, S.; Kawashima, M. Kondou-Kuriyama, T., Toyoda, T., and Matsui, M.: 
    "MOROKOSHI: Transcriptome Database in Sorghum bicolor"
    Plant and Cell Physiol. 56, e6(1–8) (2015)
  8. Shimada,S., Komatsu, T., Yamagami, A., Nakazawa, M., Matsui, M., Kawaide, H., Natsume, M., Osada, H., Asami, T., and Nakano, T.:
    "Formation and dissociation of BSS1 protein complex regulates plant development via brassinosteroid signaling."
    Plant Cell 27:375-90. (2015)
  9. Kurihara, Y. Okubo-Kurihara, E., Matsui, M.:
    "Polycistronic expression of RNA silencing suppressor protects its own mRNA from RNA silencing."
    Plant Biotechnol. 32, 1-7 (2015)
  10. Foong, C.P., Lau, N.S., Deguchi, S., Toyofuku, T., Taylor, T.D., Sudesh, S., Matsui, M.:
    "Whole genome amplification approach reveals novel polyhydroxyalkanoate synthases (PhaCs) from Japan Trench and Nankai Trough seawater Manuscript"
    BMC Microbiology 24;14(1):7(2015)

メンバーリスト

主宰者

松井 南
グループディレクター

メンバー

蒔田 由布子
研究員
栗原 志夫
研究員
嶋田 勢津子
研究員
栗原 恵美子
特別研究員
川島 美香
テクニカルスタッフⅠ
栗山 朋子
テクニカルスタッフⅠ