研究紹介

環境資源科学研究センター

生命分子解析ユニット

ユニットリーダー 堂前 直 (Ph.D.)
堂前 直 (Ph.D.)

われわれは、生命現象の解明に向け、生体成分構造解析法の開発や構造解析の応用研究を行っています。生体成分の中でも特にタンパク質は生命現象の源であり、さまざまな生物活性があります。そのタンパク質の構造を詳細に調べることで、 活性と遺伝子との対応、生物学的活性のメカニズムや活性の制御機構を解明しています。また、装置ならびに設備の設置や管理、解析方法に関する情報の整備をすることで研究支援を行っています。

研究主分野

生物学

研究関連分野

環境学 / 化学 / 総合生物 / 農学 / 医歯薬学

キーワード

  • 翻訳後修飾
  • プロテオミクス
  • 質量分析
  • エピゲノミクス
  • 構造解析

主要論文

  1. Saloura V, Vougiouklakis T, Zewde M, Deng X, Kiyotani K, Park JH, Matsuo Y, Lingen M, Suzuki T, Dohmae N, Hamamoto R, Nakamura Y
    "WHSC1L1-mediated EGFR mono-methylation enhances the cytoplasmic and nuclear oncogenic activity of EGFR in head and neck cancer."
    Sci Rep. 7:40664 (2017)
  2. Kwak HG, Dohmae N.:
    "Characterization of post-translational modifications on lysine 9 of histone H3 variants in mouse testis using matrix-assisted laser desorption/ionization-in source decay."
    Rapid Commun Mass Spectrom. 30(23): 2529–36 (2016)
  3. Shihoya W, Nishizawa T, Okuta A, Tani K, Dohmae N, Fujiyoshi Y, Nureki O, Doi T.:
    "Activation mechanism of endothelin ETB receptor by endothelin-1."
    Nature. 537(7620):363-68 (2016)
  4. Tsuchiya H, Doki S, Takemoto M, Ikuta T, Higuchi T, Fukui K, Usuda Y, Tabuchi E, Nagatoishi S, Tsumoto K, Nishizawa T, Ito K, Dohmae N, Ishitani R, Nureki O.:
    "Structural basis for amino acid export by DMT superfamily transporter YddG."
    Nature. 534:417–20 (2016)
  5. Yanagisawa T, Takahashi H, Suzuki T, Masuda A, Dohmae N, Yokoyama S.:
    "Neisseria meningitidis Translation Elongation Factor P and Its Active-Site Arginine Residue Are Essential for Cell Viability."
    PLoS ONE11, ;11(2):e0147907 (2016)
  6. Nakayama H, Yamauchi Y, Taoka M, Isobe T:
    "Direct identification of human cellular microRNAs by nanoflow liquid chromatography-high-resolution tandem mass spectrometry and database searching."
    Anal Chem. 87(5):2884-91 (2015)
  7. Huang C, Harada Y, Hosomi A, Masahara-Negishi Y, Seino J, Fujihira H, Funakoshi Y, Suzuki T, Dohmae N, Suzuki T.:
    "Endo-beta-N-acetylglucosaminidase forms N-GlcNAc protein aggregates during ER-associated degradation in Ngly1-defective cells."
    Proc Natl Acad Sci U S A112,1398-1403 (2015)
  8. Kumazaki K, Chiba S, Takemoto M, Furukawa A, Nishiyama K, Sugano Y, Mori T, Dohmae N, Hirata K, Nakada-Nakura Y, Maturana AD, Tanaka Y, Mori H, Sugita Y, Arisaka F, Ito K, Ishitani R, Tsukazaki T, Nureki O.:
    "Structural basis of Sec-independent membrane protein insertion by YidC."
    Nature509,516-520 (2014)
  9. Nishimasu H, Ran FA, Hsu PD, Konermann S, Shehata SI, Dohmae N, Ishitani R, Zhang F, Nureki O.:
    "Crystal structure of cas9 in complex with guide RNA and target DNA."
    Cell156,935-949 (2014)
  10. Masuda A, Dohmae N.:
    "Examination of an absolute quantity of less than a hundred nanograms of proteins by amino acid analysis."
    Anal Bioanal Chem405,8073-8081 (2013)

メンバーリスト

主宰者

堂前 直
ユニットリーダー

メンバー

中山 洋
専任研究員
渡邊 剛
専任技師
鈴木 健裕
専任技師
松浦 遼介
大学院生リサーチ・アソシエイト
小池 仁美
テクニカルスタッフⅠ
KWAK Hogeun
テクニカルスタッフⅠ