研究紹介

生命医科学研究センター

核酸診断技術開発ユニット

ユニットリーダー 臼井 健悟 (Ph.D.)
臼井 健悟 (Ph.D.)

特定の病気のなりやすさや薬に対する副作用の現れ方を予測したり、感染症における病原体の検出には、生物が持つ遺伝情報物質であるゲノムを調べるDNA検査が一般的になっています。一方、病気の細胞(例えば癌細胞)と通常の細胞とで遺伝子発現の違いをはっきり区別できるRNA(マーカーとして有用なRNAなど)の情報も、これからの個別化医療に有用です。
遺伝子の情報を得る為には、微量なDNAやRNAを増幅する「核酸増幅法」が重要です。我々は、一定の温度で加温するのみで迅速な核酸増幅を達成する「SmartAmp法」や、増幅した核酸から特異的なシグナルを得るための蛍光プローブである「Eprobe」を独自に開発しました。これ他の技術を応用し、DNAマーカーやRNAマーカーを数分間のうちに、簡便、高信頼性、かつ複雑な測定機器を必要としない試験法で迅速に同定する新たな遺伝子診断技術へと展開しています。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

医歯薬学

キーワード

  • 遺伝子診断
  • 核酸増幅法
  • 感染症検出技術
  • SNPジェノタイピング
  • 体細胞変異検出

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。
  1. *Takase, Y., Usui, K., Shimizu, K., Kimura, Y., Ichihara, T., Ohkawa, T., Atsumi, J., Enokida, Y., Nakazawa, S., Obayashi, K., Ohtaki, Y., Nagashima, T., Mitani, Y., and Takeyoshi, I.:
    "Highly sensitive detection of a HER2 12-base pair duplicated insertion mutation in lung cancer using the Eprobe-PCR method."
    PLoS One. 12, e0171225 (2017).
  2. *Enokida, Y., Shimizu, K., Atsumi, J., Kakegawa, S., Takase, Y., Kaira, K., Yashima, H., Araki, T., Nakazawa, S., Ohtaki, Y., Nagashima, T., Alexander, L., Usui, K., Ishikawa, T., Hayashizaki, Y., and Takeyoshi, I.:
    "Prognostic potential of the MDM2 309T>G polymorphism in stage I lung adenocarcinoma."
    Cancer Med. 5, 1791-801 (2016).
  3. *Kimura, Y., Soma, T., Kasahara, N., Delobel, D., Hanami, T., Tanaka, Y., de Hoon, MJ., Hayashizaki, Y., Usui, K., and Harbers, M.:
    "Edesign: Primer and Enhanced Internal Probe Design Tool for Quantitative PCR Experiments and Genotyping Assays."
    PLoS One. 11, e0146950 (2016).
  4. *Negishi, Y., Kawaji, H., Minoda, A., and Usui, K.:
    "Identification of chromatin marks at TERRA promoter and encoding region."
    Biochem Biophys Res Commun. 467, 1052-1057 (2015).
  5. *Atsumi, J., Hanami, T., Enokida, Y., Ogawa, H., Delobel, D., Mitani, Y., Kimura, Y., Soma, T., Tagami, M., Takase, Y., Ichihara, T., Takeyoshi, I., Usui, K., Hayashizaki, Y., and Shimizu K.:
    "Eprobe-mediated screening system for somatic mutations in the KRAS locus."
    Oncol Rep. 33, 2719-2727 (2015).
  6. *Enokida, Y., Shimizu, K., Kakegawa, S., Atsumi, J., Takase, Y., Miyamae, Y., Nagashima, T., Ohtaki, Y., Kaira, K., Sunaga, N., Yanagitani, N., Yoshino, R., Tsunekawa, K., Igai, H., Kamiyoshihara, M., Usui, K., Lezhava, A., Tomizawa, Y., Ishikawa, T., Murakami, M., Hayashizaki, Y., and Takeyoshi I.:
    "Single-nucleotide polymorphism (c.309T>G) in the MDM2 gene and lung cancer risk."
    Biomed Rep. 2, 719-724 (2014).
  7. *Hanami, T., Delobel, D., Kanamori, H., Tanaka, Y., Kimura, Y., Nakasone, A., Soma, T., Hayashizaki, Y., Usui, K., and Harbers, M.:
    "Eprobe mediated real-time PCR monitoring and melting curve analysis."
    PLoS One. 8, e70942 (2013).
  8. *Enokida, Y., Shimizu, K., Atsumi, J., Lezhava, A., Tanaka, Y., Kimura, Y,, Soma, T., Hanami, T., Kawai, Y., Usui, K., Okano, Y., Kakegawa, S., Ogawa, H., Miyamae, Y., Miyagi, Y., Nakayama, H., Ishikawa, T., Hayashizaki, Y., and Takeyoshi I.:
    "Rapid detection of SNP (c.309T>G) in the MDM2 gene by the Duplex SmartAmp method."
    PLoS One. 8, e60151 (2013).
  9. *Kimura, Y., Hanami, T., Tanaka, Y., De Hoon, MJ., Soma, T., Harbers, M., Lezhava, A., Hayashizaki, Y., and Usui, K.:
    "Effect of thiazole orage double-labeled thymidine on DNA duplex formation."
    Biochemistry, 51, 6056-6067 (2012).
  10. *Kawai, Y., Kimura, Y., Lezhava, A., Kanamori, H., Usui, K., Hanami, T., Soma, T., Morlighem, JÉ., Saga, S., Ishizu, Y., Aoki, S., Endo, R., Oguchi-Katayama, A., Kogo, Y., Mitani, Y., Ishidao, T., Kawakami, C., Kurata, H., Furuya, Y., Saito, T., Okazaki, N., Chikahira, M., Hayashi, E., Tsuruoka, S., Toguchi, T., Saito, Y., Ban, T., Izumi, S., Uryu, H., Kudo, K., Sakai-Tagawa, Y., Kawaoka, Y., Hirai, A., Hayashizaki, Y., and Ishikawa, T.:
    "One-step detection of the 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus by the RT-SmartAmp assay and its clinical validation."
    PLoS One, 7, e30236 (2012).

メンバーリスト

主宰者

臼井 健悟
ユニットリーダー

メンバー

花見 健志
研究員
田中 有希
研究員

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Tel: 045-503-9222
Fax: 045-503-9216

kengo.usui [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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