研究紹介

生命医科学研究センター

がんゲノム研究チーム

チームリーダー 中川 英刀 (M.D., Ph.D)
中川 英刀 (M.D., Ph.D)

次世代DNAシークエンス技術の驚異的な進歩により、個人の全ゲノム解読が安価で迅速に行えるようになりつつあります。がんはゲノムの異常に基づく病気であり、がんのゲノム異常を標的とした様々な分子標的薬が開発され、また、ゲノムの変異や多型に応じてがん発症のリスク予想も行われつつあり、治療・診断・予防といった点で個別化が進められようとしています。我々のチームでは、最新の次世代シークエンサーとその応用技術を駆使して、がんや遺伝性疾患などの様々なヒトの病気に関わるゲノム解析(全ゲノム、全エクソーム、RNAシークエンス)を大規模に行っており、遺伝子多型や変異と病気・薬剤反応性の関連を明らかにするためのゲノム基盤情報を構築し、それらの生物学的・免疫学的・臨床的意義の機能的解析も行っています。さらには、国際共同プロジェクトである国際がんゲノムコンソーシアム(ICGC)に参画して、がんとゲノムに関わるゲノムデータベースの構築にも携わっており、ゲノム情報を用いたがんの個別化医療の実現を目指しています。

研究主分野

医歯薬学

研究関連分野

情報学 / 総合生物 / 生物学

キーワード

  • がんゲノム
  • ゲノム医療
  • 次世代シークエンサー
  • がん免疫ゲノム

主要論文

  1. Furuta M, Ueno M, Fujimoto A, Hayami S, Yasukawa S, Kojima F, Arihiro K, Kawakami Y, Wardell CP, Shiraishi Y, Tanaka H, Nakano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Tokunaga N, Boroevich KA, Abe T, Aikata H, Ohdan H, Gotoh K, Kubo M, Tsunoda T, Miyano S, Chayama K, Yamaue H, and Nakagawa H.:
    "Whole genome sequencing discriminates hepatocellular carcinoma with intrahepatic metastasis from multi-centric tumors"
    J Hepatol 66: 363-373 (2017)
  2. Alexandrov LB, Ju Y, Haase K, Van Loo P, Martincorena I, Nik-Zainal S, Totoki Y, Fujimoto A, Nakagawa H, Shibata T, Campbell PJ, Vineis P, Phillips DH, and Stratton MR.:
    "Mutational signatures associated with tobacco smoking in human cancer"
    Science 354:618-622 (2016)
  3. Fujimoto A, Furuta M, Totoki Y, Tsunoda T, Kato M, Shiraishi Y, Tanaka H, Taniguchi H, Kawakami Y, Ueno M, Gotoh K, Ariizumi S, Wardell CP, Hayami S, Nakamura T, Aikata H, Arihiro K, Boroevich KA, Abe T, Nakano N, Maejima K, Sasaki-Oku A, Ohsawa A, Shibuya T, Nakamura H, Hama N, Hosoda F, Arai Y, Ohashi S, Urushidate T, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Ojima H, Hiraoka N, Okusaka T, Kubo M, Marubashi S, Yamada T, Hirano S, Yamamoto M, Ohdan H, Shimada K, Ishikawa O, Yamaue H, Chayama K, Miyano S, Aburatani H, Shibata T, and Nakagawa H.:
    "Whole genome mutational landscape and characterization of non-coding and structural mutations in liver cancer"
    Nature Genetics 48: 500-509 (2016)
  4. Tyler S, Alioto TS, Buchhalter I, Derdak S, Hutter B, Eldridge MD, Hovig E, Heisler LE, Beck TA, Simpson JT, Tonon J, Sertier S, Patch AS, Jäger N, Ginsbach P, Drews R, Paramasivam N, Kabbe R, Chotewutmontri S, Diessl N, Previti C, Schmidt S, Brors B, Feuerbach L, Heinold, Gröbner S, Korshunov A, Tarpey PS, Butler AP, Hinton J, Jones D, Menzies A, Raine K, Shepherd R, Stebbings L, Teague JW, Ribeca P, Giner FC, Beltran S, Raineri E, Dabad M, Heath SC, Gut M, Denroche RE, Harding NJ, Yamaguchi TN, Fujimoto A, Nakagawa H, Quesada V, Valdés-Mas R, Nakken S, Vodák D, Bower L, Lynch A, Anderson CL, Waddell N, Pearson JV, Grimmond SM, Peto M, Spellman P, He M, Kandoth C, Lee S, Zhang J, Létourneau L, Ma S, Seth S, Torrents D, Xi L, Wheeler DA, López-Otín C, Campo E, Campbell PJ, Boutros PC, Puente XS, Gerhard DS, Pfister SM, McPherson JD, Hudson TJ, Schlesner M, Lichter P, Eils P, Jones DTW, and Gut IG.:
    "A comprehensive assessment of somatic mutation detection in cancer using whole genome sequencing"
    Nature Communications 6: 10001 (2015)
  5. Nakagawa H, Wardell CP, Furuta M, Taniguchi H, and Fujimoto A.:
    "Cancer whole genome sequencing: present and future"
    Oncogene 34: 5943-5950 (2015)
  6. Wang M, Takahashi A, Liu F, Ye D, Ding Q, Qin C, Yin C, Zhang Z, Matsuda K, Kubo M, Na R, Lin X, Jiang H, Ren S, Sun J, Zheng SL, Le Marchand L, Isaacs WB, Mo1 Z, Haiman CA, Sun Y, Nakagawa H, and Xu J.:
    "Large-scale association analysis in Asians identifies new susceptibility loci for prostate cancer"
    Nature Communications 6:8469 (2015)
  7. Ono A, Fujimoto A, Yamamoto Y, Akamatsu S, Hiraga N, Imamura M, Kawaoka T, Tsuge M, Abe H, Hayes CN, Miki D, Furuta M, Tsunoda T, Miyano S, Kubo M, Aikata H, Ochi H, Kawakami Y, Nakagawa H, and Chayama K.:
    "Circulating tumor DNA analysis for liver cancers and its usefulness as a liquid biopsy."
    Cell Mol Gastroenterol Hepatol 1: 516-534 (2015)
  8. Fujimoto A, Furuta M, Shiraishi Y, Gotoh K, Kawakami Y, Arihiro K, Nakamura T, Ueno M, Ariizumi S, Nguyen HH, Shigemizu D, Abe T, Boroevich KA, Nakano K, Sasaki A, Kitada R, Maejima K, Yamamoto Y, Tanaka H, Shibuya T, Shibata T, Ojima H, Shimada K, Hayami S, Shigekawa Y, Aikata H, Ohdan H, Marubashi S, Yamada T, Kubo K, Hirano S, Ishikawa O, Yamamoto M, Yamaue H, Chayama K, Miyano S, Tsunoda T, and Nakagawa H.:
    "Whole-genome mutational landscape of liver cancers displaying biliary phenotype reveals hepatitis impact and molecular diversity."
    Nature Communications 6: 6120 (2015)
  9. Al Olama AA, Kote-Jarai Z, Berndt SI, et al.:
    "A meta-analysis of 87,040 individuals identifies 23 new susceptibility loci for prostate cancer"
    Nature Genetics 46: 1103-1109 (2014)
  10. Fujimoto A, Totoki Y, Abe T, Boroevich KA, Hosoda F, Nguyen HH, Aoki M, Hosono N, Kubo M, Miya F, Arai Y, Takahashi H, Shirakihara T, Nagasaki M, Shibuya T, Nakano K, Watanabe-Makino K, Tanaka H, Nakamura H, Kusuda J, Ojima H, Shimada K, Okusaka T, Ueno M, Shigekawa Y, Kawakami Y, Arihiro K, Ohdan H, Gotoh K, Ishikawa O, Ariizumi S, Yamamoto M, Yamada T, Chayama K, Kosuge T, Yamaue H, Kamatani N, Miyano S, Nakagama H, Nakamura Y, Tsunoda T, Shibata T, and Nakagawa H.:
    "Whole genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators."
    Nature Genetics 44: 760-764 (2012)

メンバーリスト

主宰者

中川 英刀
チームリーダー

メンバー

藤田 征志
研究員
谷口 浩章
研究員
古田 繭子
研究員
中野 かおる
テクニカルスタッフⅡ
前嶋 和紘
テクニカルスタッフⅡ

お問い合わせ先

〒108-8639 東京都港区白金台4-6-1
東京大学医科学研究所内 総合研究棟6F
Tel: 03-5449-5785
Fax: 03-5449-5785

hidewaki [at] ims.u-tokyo.ac.jp
※[at]は@に置き換えてください。

関連リンク

最新の研究成果

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B型肝炎ウイルスのゲノム組み込みとがん化の関連を解明
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2017年12月14日: 報道発表資料
炎症性腸疾患からの発がん機構の解明
2016年11月24日: 報道発表資料
再発性と多発性肝臓がんのゲノム診断
2016年4月12日: 報道発表資料
肝臓がん300例の全ゲノムを解読