研究紹介

生命医科学研究センター

予防医療迅速診断システム開発ユニット

開発ユニットリーダー 臼井 健悟 (Ph.D.)
臼井 健悟 (Ph.D.)

我々は、当センターの核酸診断技術開発ユニットで開発した、SmartAmp法やEprobeを元に、医療現場で使用可能な遺伝子診断技術への応用を目指しています。実際の医療機関との連携を図り、我々の技術を用いた臨床研究を推進し、検出キットとしての評価、改善を行っています。また体外診断薬としての遺伝子診断技術の現実化を図るため、企業への技術導出に必要なデータの整備を行っています。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

医歯薬学

キーワード

  • 遺伝子診断
  • 核酸増幅法
  • 感染症検出技術
  • SNPジェノタイピング
  • 体細胞変異検出

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。
  1. *Takase, Y., Usui, K., Shimizu, K., Kimura, Y., Ichihara, T., Ohkawa, T., Atsumi, J., Enokida, Y., Nakazawa, S., Obayashi, K., Ohtaki, Y., Nagashima, T., Mitani, Y., and Takeyoshi, I.:
    "Highly sensitive detection of a HER2 12-base pair duplicated insertion mutation in lung cancer using the Eprobe-PCR method."
    PLoS One. 12, e0171225 (2017).
  2. *Enokida, Y., Shimizu, K., Atsumi, J., Kakegawa, S., Takase, Y., Kaira, K., Yashima, H., Araki, T., Nakazawa, S., Ohtaki, Y., Nagashima, T., Alexander, L., Usui, K., Ishikawa, T., Hayashizaki, Y., and Takeyoshi, I.:
    "Prognostic potential of the MDM2 309T>G polymorphism in stage I lung adenocarcinoma."
    Cancer Med. 5, 1791-801 (2016).
  3. *Kimura, Y., Soma, T., Kasahara, N., Delobel, D., Hanami, T., Tanaka, Y., de Hoon, MJ., Hayashizaki, Y., Usui, K., and Harbers, M.:
    "Edesign: Primer and Enhanced Internal Probe Design Tool for Quantitative PCR Experiments and Genotyping Assays."
    PLoS One. 11, e0146950 (2016).
  4. *Atsumi, J., Hanami, T., Enokida, Y., Ogawa, H., Delobel, D., Mitani, Y., Kimura, Y., Soma, T., Tagami, M., Takase, Y., Ichihara, T., Takeyoshi, I., Usui, K., Hayashizaki, Y., and Shimizu K.:
    "Eprobe-mediated screening system for somatic mutations in the KRAS locus."
    Oncol Rep. 33, 2719-2727 (2015).
  5. *Enokida, Y., Shimizu, K., Kakegawa, S., Atsumi, J., Takase, Y., Miyamae, Y., Nagashima, T., Ohtaki, Y., Kaira, K., Sunaga, N., Yanagitani, N., Yoshino, R., Tsunekawa, K., Igai, H., Kamiyoshihara, M., Usui, K., Lezhava, A., Tomizawa, Y., Ishikawa, T., Murakami, M., Hayashizaki, Y., and Takeyoshi I.:
    "Single-nucleotide polymorphism (c.309T>G) in the MDM2 gene and lung cancer risk."
    Biomed Rep. 2, 719-724 (2014).
  6. *Hanami, T., Delobel, D., Kanamori, H., Tanaka, Y., Kimura, Y., Nakasone, A., Soma, T., Hayashizaki, Y., Usui, K., and Harbers, M.:
    "Eprobe mediated real-time PCR monitoring and melting curve analysis."
    PLoS One. 8, e70942 (2013).
  7. *Enokida, Y., Shimizu, K., Atsumi, J., Lezhava, A., Tanaka, Y., Kimura, Y,, Soma, T., Hanami, T., Kawai, Y., Usui, K., Okano, Y., Kakegawa, S., Ogawa, H., Miyamae, Y., Miyagi, Y., Nakayama, H., Ishikawa, T., Hayashizaki, Y., and Takeyoshi I.:
    "Rapid detection of SNP (c.309T>G) in the MDM2 gene by the Duplex SmartAmp method."
    PLoS One. 8, e60151 (2013).
  8. *Kimura, Y., Hanami, T., Tanaka, Y., De Hoon, MJ., Soma, T., Harbers, M., Lezhava, A., Hayashizaki, Y., and Usui, K.:
    "Effect of thiazole orage double-labeled thymidine on DNA duplex formation."
    Biochemistry, 51, 6056-6067 (2012).
  9. *Kawai, Y., Kimura, Y., Lezhava, A., Kanamori, H., Usui, K., Hanami, T., Soma, T., Morlighem, JÉ., Saga, S., Ishizu, Y., Aoki, S., Endo, R., Oguchi-Katayama, A., Kogo, Y., Mitani, Y., Ishidao, T., Kawakami, C., Kurata, H., Furuya, Y., Saito, T., Okazaki, N., Chikahira, M., Hayashi, E., Tsuruoka, S., Toguchi, T., Saito, Y., Ban, T., Izumi, S., Uryu, H., Kudo, K., Sakai-Tagawa, Y., Kawaoka, Y., Hirai, A., Hayashizaki, Y., and Ishikawa, T.:
    "One-step detection of the 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus by the RT-SmartAmp assay and its clinical validation."
    PLoS One, 7, e30236 (2012).
  10. *Tanaka, Y., Kimura, Y., Mitani, Y., Kawai, Y., Lezhava, A., Noma, S., Tagami, M., Kawai, J., Hayashizaki, Y., and Usui, K.:
    "Effects of the turn-back primer on intermediate product generation in isothermal DNA amplification."
    Biotechniques. 49, 888-892 (2010).

メンバーリスト

主宰者

臼井 健悟
開発ユニットリーダー

メンバー

田中 佑治
研究員