研究紹介

医科学イノベーションハブ推進プログラム

疾患データ統合グループ

グループディレクター 角田 達彦 (Ph.D.)
角田 達彦 (Ph.D.)

健康・医療分野において、電子カルテによる臨床診療データ、網羅的な分子データ(オミクスデータ)、ライフログデータなど、多種多様で大規模なデータが蓄積されています。これらのデータから病態メカニズムの解明、治療効果の予測、予防による健康増進を行うためには、健康・医療におけるデータ駆動型研究を加速する研究開発と情報基盤が必要です。当研究室では、複数の医療機関と連携し、各種データを統合して解析することで、予測と予防の個別化医療の実現に向けた革新的な診断法・治療法を開発することを目的とした研究を行っています。

研究主分野

医歯薬学

研究関連分野

数物系科学

生命・健康・医療情報学

キーワード

  • プレシジョン医療
  • 医科学数理
  • オミクス解析

主要論文

  1. Shigemizu, D., Iwase, T., Yoshimoto, M., Suzuki, Y., Miya, F., Boroevich, K.A., Katagiri, T., Zembutsu, H., and Tsunoda, T.:
    "The prediction models for postoperative overall survival and disease-free survival in patients with breast cancer"
    Cancer Medicine, 6, 1627-1638 (2017).
  2. Fujimoto, A.+, Furuta, M.+, Totoki, Y.+, Tsunoda, T.+, Kato, M.+ (+: co-first), Shiraishi, Y., Tanaka, H., Taniguchi, H., Kawakami, Y., Ueno, M., Gotoh, K., Ariizumi, S., Wardell, C.P., Hayami, S., Nakamura, T., Aikata, H., Arihiro, K., Boroevich, K.A., Abe, T., Nakano, K., Maejima, K., Sasaki-Oku, A., Ohsawa, A., Shibuya, T., Nakamura, H., Hama, N., Hosoda, F., Arai, Y., Ohashi, S., Urushidate, T., Nagae, G., Yamamoto, S., Ueda, H., Tatsuno, K., Ojima, H., Hiraoka, N., Okusaka, T., Kubo, M., Marubashi, S., Yamada, T., Hirano, S., Yamamoto, M., Ohdan, H., Shimada, K., Ishikawa, O., Yamaue, H., Chayama, K., Miyano, S., Aburatani, H., Shibata, T., and Nakagawa, H.:
    "Whole genome mutational landscape and characterization of non-coding and structural mutations in liver cancer"
    Nature Genetics, 48, 500-509 (2016).
  3. Fujimoto, A., Furuta, M., Shiraishi, Y., Gotoh, K., Kawakami, Y., Arihiro, K., Nakamura, T., Ueno, M., Ariizumi, S., Hai Nguyen, H., Shigemizu, D., Abe T., Boroevich, KA., Nakano, K., Sasaki, A., Kitada, R., Maejima, K., Yamamoto, Y., Tanaka, H., Shibuya, T., Shibata, T., Ojima, H., Shimada, K., Hayami, S., Shigekawa, Y., Aikata, H., Ohdan, H., Marubashi, S., Yamada, T., Kubo, M., Hirano, S., Ishikawa, O., Yamamoto, M., Yamaue, H., Chayama, K., Miyano, S., Tsunoda, T.*, and Nakagawa, H.*:
    "Whole-genome mutational landscape of liver cancers displaying biliary phenotype reveals hepatitis impact and molecular diversity"
    Nature Communications. 6, 6120 (2015).
  4. Fujimoto, A., Totoki, Y., Abe, T., Boroevich, K.A., Hosoda, F., Nguyen, H.H., Aoki, M., Hoshono, N., Kubo, M., Miya, F., Arai, Y., Takahashi, H., Shirakihara, T., Nagasaki, M., Shibuya, T., Nakano, K., Watanabe-Makino, K., Tanaka, H., Nakamura, H., Kusuda, J., Ojima, H., Shimada, K., Okusaka, T., Ueno, M., Shigekawa, Y., Kawakami, Y., Arihiro, K., Ohdan, H., Gotoh, K., Ishikawa, O., Ariizumi, S., Yamamoto, M., Yamada, T., Chayama, K., Kosuge, T., Yamaue, H., Kamatani, N., Miyano, S., Nakagama, H., Nakamura, Y., Tsunoda, T., Shibata, T., and Nakagawa, H.:
    "Whole Genome Sequencing of Liver Cancers Identifies Etiological Influences on Mutation Patterns and Recurrent Mutations in Chromatin Regulators"
    Nature Genetics, 44, 760-764 (2012).
  5. Fujimoto, A., Nakagawa, H., Hosono, N., Nakano, K., Abe, T., Boroevich, K.A., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Shibuya, T., Kubo, M., Miyano, S., Nakamura, Y., and Tsunoda, T.:
    "Whole genome sequencing and comprehensive variant analysis of a Japanese individual using massively parallel sequencing"
    Nature Genetics, 42, 931-936 (2010).
  6. The International Cancer Genome Consortium:
    "International network of cancer genome projects"
    Nature, 464, 993-998 (2010).
  7. Kato, M., Kawaguchi, T., Ishikawa, S., Umeda, T., Nakamichi, R., Shapero, M.H., Jones, K.W., Nakamura, Y., Aburatani, H., and Tsunoda, T.:
    "Population-genetic nature of copy number variations in the human genome"
    Human Molecular Genetics, 19, 761-773 (2010).
  8. The International HapMap Consortium:
    "A second generation human haplotype map of over 3.1 million SNPs"
    Nature, 449, 851-862 (2007).
  9. The International HapMap Consortium:
    "A haplotype map of the human genome"
    Nature, 437, 1299-1320 (2005).
  10. Tsunoda, T., Lathrop, G.M., Sekine, A., Yamada, R., Takahashi, A., Ohnishi, Y., Tanaka, T., and Nakamura, Y.:
    "Variation of gene-based SNPs and linkage disequilibrium patterns in the human genome"
    Human Molecular Genetics, 13, 1623-1632 (2004).

メンバーリスト

主宰者

角田 達彦
グループディレクター

メンバー

芦崎 晃一
技師
望月 芳樹
技師
森園 隆
テクニカルスタッフⅠ