研究紹介

イノベーション推進センター

理研-HMC臨床オミックス特別ユニット

ユニットリーダー 村川 泰裕 (M.D., Ph.D.)
村川 泰裕 (M.D., Ph.D.)

オミックスとは、体の中にある分子全体を網羅的に調べる学問であり、生命現象を分子レベルのシステムとして理解することを目指しています。とりわけ、次世代シークエンサーによるゲノム配列の超高速解読は、医学・生命科学分野において革命的な進歩をもたらしました。本研究ユニットでは、このオミックス技術を希少性疾患や家族性疾患に応用します。得られた知見をもとに、病気の本質に迫り、新しい治療や診断技術の開発につなげ、人類の健康の増進に貢献します。

[連携先:ハマッド病院]

研究主分野

医歯薬学

研究関連分野

生物学

キーワード

  • オミックス科学
  • 希少性疾患
  • 遺伝学
  • 次世代シークエンス
  • バイオテクノロジー

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。
  1. Murakawa, Y.(#)(*), Yoshihara, M. (#), Kawaji H., Nishikawa M., Zayed H., Suzuki H., Fantom Consortium, Hayashizaki Y.: (* corresponding author ; # equally contributing first author)
    "Enhanced identification of transcriptinal enhancers provides mechanistic insights into diseases"
    Trends in Genetics 32, 76-88 (2016)
  2. *Hasler D., Lehmann G., Murakawa Y., Klironomos F., Jakob L., Grässer F., Rajewsky N., Landthaler M., Meister G.:
    "The Lupus autoantigen La prevents mis-channeling of tRNA fragments into the human microRNA pathway"
    Molecular Cell 63, 110-24 (2016)
  3. *Murakawa, Y., Hinz, M., Mothes, J., Schuetz, A., Yasuda, T., Mastrobuoni, G., Friedel, C.C., Dölken, L., Kempa, S., Schmidt-Supprian, M., Heinemann, U., Wolf, J, Scheidereit, C., Landthaler, M.:
    "RC3H1 represses the IKK/NF-κB negative feedback regulator A20 by binding to a 3’UTR composite structure-sequence element"
    Nature Communications 6, 7367 (2015)
  4. *Mino, T., Murakawa, Y., Fukao, A., Vandenbon, A., Wessels, H., Ori, D., Uehata, T., Tartey, S., Akira, S., Suzuki, Y., Vinueesa, GG., Ohler, U., Standley, DM., Landthaler, M., Fujiwara, T., Takeuchi, O.:
    "Regnase-1 and Roquin Regulate a Common Element in Inflammatory mRNAs by Spatiotemporally Distinct Mechanisms"
    Cell 161, 1058-1073 (2015)
  5. *Rybak-Wolf, A. (#), Jens, M. (#), Murakawa, Y. (#), Herzog, M., Landthaler, M., Rajewsky, N.: (#equally contributing first author)
    "A variety of Dicer substrates in human and C.elegans"
    Cell 159, 1153-1167 (2014)
  6. *Schuetz, A., Murakawa, Y., Rosenbaum, E., Landthaler, M., Heinemann, U.:
    "Roquin binding to stem-loop mRNAs induces protein dimerization and involves a winged helix-turn-helix motif"
    Nature Communications 5, 5701 (2014)
  7. *Baltz, AG., Munschauer, M., Schwanhäusser, B., Vasile, A., Murakawa, Y., Schueler, M., Youngs, N., Penfold-Brown, D., Drew, K., Milek, M., Wyler, E., Bonneau, R., Selbach, M., Dieterich, C., Landthaler, M.:
    "The mRNA-bound proteome and its global occupancy profile on protein-coding transcripts"
    Molecular Cell 46, 674-690 (2012)
  8. *Murakawa, Y., Miyagawa-Hayashino, A., Ogura, Y., Egawa, H., Okamoto, S., Soejima, Y., Kurosawa, M., Sumiyoshi, S., Uemoto, S., and Haga, H.:
    "Liver transplantation for severe hepatitis in patients with common variable immunodeficiency"
    Pediatric Transplantation 16, E210-216 (2012)
  9. *Murakawa, Y., Sonoda, E., Barber, L.J., Zeng, W., Yokomori, K., Kimura, H., Niimi, A., Lehmann, A., Zhao, G.Y., Hochegger, H., Boulton, SJ., Takeda, S.:
    "Inhibitors of the proteasome suppress homologous DNA recombination in mammalian cells"
    Cancer Research 67, 8536-8543 (2007)
  10. *Zhao, G.Y., Sonoda, E., Barber, L.J., Oka, H., Murakawa, Y., Yamada, K., Ikura, T., Wang, X., Kobayashi, M., Yamamoto, K., Boulton, S.J., Takeda, S.:
    "A critical role for the ubiquitin-conjugating enzyme Ubc13 in initiating homologous recombination"
    Molecular Cell 25, 663-675 (2007)

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