生命機能科学研究センター 細胞システム制御学研究チーム
チームリーダー 谷口 雄一(Ph.D.)
研究概要

当研究室では、1細胞レベルでの網羅的な遺伝子発現動態解析を通じてシステムバイオロジー研究を展開することを目的として研究を行います。最先端の1細胞内1分子遺伝子発現解析技術や、ハイスループット解析技術、MEMS技術、バイオインフォマティクス技術、細胞株ライブラリ技術などを融合することにより、1細胞レベルでの包括的な生命理解と網羅的な生物情報収集のための新しいテクノロジーを開発します。そしてこれらを用いて、1細胞レベルからの分化・発生等の生命過程を解析してその原理を追及すると共に、1細胞内の複雑な分子細胞状態を理解するための新しい概念とモデルを構築することを課題としています。
研究主分野
- 総合生物
研究関連分野
- 総合理工
キーワード
- 1細胞解析
- 1分子・超解像顕微鏡
- ゲノム構造
- セントラルドグマ
- システムワイド解析
主要論文
「*」は、理研外のみでの成果です。
- 1.Leclerc, S., Arntz, Y., Taniguchi, Y.:
"Proteome-wide quantification of labeling homogeneity at the single molecule level"
J. Vis. Exp. 146, e59199 (2019). - 2.Yoshida, Y., Taniguchi, Y.:
"Simultaneous single-cell measurements demonstrate a positive correlation between RNA copy number for
mitochondrial division and fusion genes and mitochondrial fragmentation"
Cytologia 84, 15-23 (2019) - 3.Ohno M, Ando T, Priest D.G., et.al.:
"Sub-nucleosomal genome structure reveals distinct nucleosome folding motifs"
Cell (2019) doi: 10.1016/j.cell.2018.12.014 - 4.Leclerc S, Arntz Y, Taniguchi Y.:
"Extending Single Molecule Imaging to Proteome Analysis by Quantitation of Fluorescent Labeling Homogeneity in Complex Protein Samples"
Bioconjugate Chemistry (2018) doi: 10.1021/acs.bioconjchem.8b00226 - 5.Ohno M, Priest DG, Taniguchi Y.:
"Nucleosome-level 3D organization of the genome"
Biochemical Society Transactions (2018) doi: 10.1042/BST20170388 - 6.Priest D, Tanaka N, Tanaka Y, Taniguchi Y.:
"Micro-patterned agarose gel devices for single-cell high-throughput microscopy of E. coli cells"
Scientific Reports 7. 17750 (2017) doi: 10.1038/s41598-017-17544-2 - 7.Taniguchi Y.:
"Autofluorescence imaging of tissue samples using super-high sensitivity fluorescence microscopy"
Global Imaging Insights 2. 1-2 (2017) doi: 10.15761/GII.1000135 - 8.Taniguchi, Y.:
"Genome-Wide Analysis of Protein and mRNA Copy Numbers in Single Escherichia coli Cells with Single-Molecule Sensitivity"
Methods Mol. Biol. 1346, 55-67 (2015) - 9.Ohno, M., Karagiannis, P. & Taniguchi, Y.:
"Protein Expression Analyses at the Single Cell Level"
Molecules 19, 13932-13947 (2014) - 10.*Taniguchi, Y., Choi, P. J., Li, G., Chen, H., Babu, M., et al.:
"Quantifying E-coli Proteome and Transcriptome with Single-Molecule Sensitivity in Single Cells"
Science 329, 533-538 (2010)
研究成果(プレスリリース)
2021年6月1日
最も詳細な解像度でゲノムDNAの3次元構造を導く技術2020年8月7日
ゲノムの動きをシミュレーションする新手法2020年2月3日
機械学習によるゲノム構造の特徴抽出2019年1月18日
世界最高分解能で全ゲノムの3次元構造を解明2018年7月31日
細胞中のタンパク質を全部光らせる
関連リンク
メンバーリスト
主宰者
- 谷口 雄一
- チームリーダー
メンバー
- 大野(城村) 雅恵
- 客員研究員
- KIM Soo Yeon
- 基礎科学特別研究員
- 石田 真弓
- テクニカルスタッフⅠ
- 辻村 香織
- テクニカルスタッフⅠ
- LATIEFA Binti Kamarulzaman
- 研修生
- 大原 祥子
- 事務パートタイマーⅡ
- 奥田 ゆり子
- アシスタント
採用情報
募集職種 | 応募締切 |
---|---|
研究員募集(CSC2105) | ポストが決まり次第 |
研究員募集(CSC2104) | ポストが決まり次第 |
お問い合わせ先
〒565-0874 大阪府吹田市古江台6-2-3
Email: taniguchi [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。