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生命機能科学研究センター細胞システム制御学研究チーム

チームリーダー谷口雄一（Ph.D.）

English Page

研究概要

当研究室では、１細胞レベルでの網羅的な遺伝子発現動態解析を通じてシステムバイオロジー研究を展開することを目的として研究を行います。最先端の1細胞内１分子遺伝子発現解析技術や、ハイスループット解析技術、MEMS技術、バイオインフォマティクス技術、細胞株ライブラリ技術などを融合することにより、１細胞レベルでの包括的な生命理解と網羅的な生物情報収集のための新しいテクノロジーを開発します。そしてこれらを用いて、１細胞レベルからの分化・発生等の生命過程を解析してその原理を追及すると共に、１細胞内の複雑な分子細胞状態を理解するための新しい概念とモデルを構築することを課題としています。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

総合理工

キーワード

1細胞解析
1分子・超解像顕微鏡
ゲノム構造
セントラルドグマ
システムワイド解析

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

1.Leclerc, S., Arntz, Y., Taniguchi, Y.:
"Proteome-wide quantification of labeling homogeneity at the single molecule level"
J. Vis. Exp. 146, e59199 (2019).
2.Yoshida, Y., Taniguchi, Y.:
"Simultaneous single-cell measurements demonstrate a positive correlation between RNA copy number for
mitochondrial division and fusion genes and mitochondrial fragmentation"
Cytologia 84, 15-23 (2019)
3.Ohno M, Ando T, Priest D.G., et.al.:
"Sub-nucleosomal genome structure reveals distinct nucleosome folding motifs"
Cell (2019) doi: 10.1016/j.cell.2018.12.014
4.Leclerc S, Arntz Y, Taniguchi Y.:
"Extending Single Molecule Imaging to Proteome Analysis by Quantitation of Fluorescent Labeling Homogeneity in Complex Protein Samples"
Bioconjugate Chemistry (2018) doi: 10.1021/acs.bioconjchem.8b00226
5.Ohno M, Priest DG, Taniguchi Y.:
"Nucleosome-level 3D organization of the genome"
Biochemical Society Transactions (2018) doi: 10.1042/BST20170388
6.Priest D, Tanaka N, Tanaka Y, Taniguchi Y.:
"Micro-patterned agarose gel devices for single-cell high-throughput microscopy of E. coli cells"
Scientific Reports 7. 17750 (2017) doi: 10.1038/s41598-017-17544-2
7.Taniguchi Y.:
"Autofluorescence imaging of tissue samples using super-high sensitivity fluorescence microscopy"
Global Imaging Insights 2. 1-2 (2017) doi: 10.15761/GII.1000135
8.Taniguchi, Y.:
"Genome-Wide Analysis of Protein and mRNA Copy Numbers in Single Escherichia coli Cells with Single-Molecule Sensitivity"
Methods Mol. Biol. 1346, 55-67 (2015)
9.Ohno, M., Karagiannis, P. & Taniguchi, Y.:
"Protein Expression Analyses at the Single Cell Level"
Molecules 19, 13932-13947 (2014)
10.*Taniguchi, Y., Choi, P. J., Li, G., Chen, H., Babu, M., et al.:
"Quantifying E-coli Proteome and Transcriptome with Single-Molecule Sensitivity in Single Cells"
Science 329, 533-538 (2010)