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生命医科学研究センター マイクロバイオーム研究チーム

チームリーダー 大野 博司(M.D., Ph.D)

研究概要

大野 博司(M.D., Ph.D)

マイクロバイオーム研究チームでは、ヒトを主体とする宿主と共生細菌叢との相互作用研究における微生物ゲノム解析・メタゲノム解析等を行うため、次世代シークエンサーを用いた微生物のゲノム配列解析からそのゲノム情報科学・生命情報科学的解析まで統合的に研究を推進します。

研究主分野

  • 総合生物

研究関連分野

  • 情報学
  • 総合生物
  • 生物学
  • 医歯薬学

キーワード

  • マイクロバイオーム
  • メタゲノム
  • 腸内細菌叢
  • 常在菌
  • 微生物ゲノム

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. Khasnobish A, Takayasu L, Watanabe KI, Nguyen TTT, Arakawa K, Hotta O, Joh K, Nakano A, Hosomi S, Hattori M, Suda W, Morita H.:
    "Dysbiosis in the Salivary Microbiome Associated with IgA Nephropathy-A Japanese Cohort Study"
    Microbes Environ. 36(2):ME21006 (2021).
  • 2. Takewaki D, Suda W, Sato W, Takayasu L, Kumar N, Kimura K, Kaga N, Mizuno T, Miyake S, Hattori M, Yamamura T.:
    "Alterations of the gut ecological and functional microenvironment in different stages of multiple sclerosis"
    Proc Natl Acad Sci U S A. 117:22402-22412 (2020).
  • 3. Miyauchi E, Kim SW, Suda W, Kawasumi M, Onawa S, Taguchi-Atarashi N, Morita H, Taylor TD, Hattori M, Ohno H.:
    "Gut microorganisms act together to exacerbate inflammation in spinal cords"
    Nature. 7823:102-106 (2020).
  • 4. Masuoka H, Suda W, Tomitsuka E, Shindo C, Takayasu L, Horwood P, Greenhill AR, Hattori M, Umezaki M, Hirayama K.:
    "The influences of low protein diet on the intestinal microbiota of mice."
    Sci Rep. 10:17077 (2020).
  • 5. Suzuki Y, Nishijima S, Furuta Y, Yoshimura J, Suda W, Oshima K, Hattori M, Morishita S.:
    "Long-read metagenomic exploration of extrachromosomal mobile genetic elements in the human gut."
    Microbiome 71:119(2019).
  • 6. *Atarashi K, Suda W, Luo C, Kawaguchi T, Motoo I, Narushima S, Kiguchi Y, Yasuma K, Watanabe E, Tanoue T, Thaiss CA, Sato M, Toyooka K, Said HS, Yamagami H, Rice SA, Gevers D, Johnson RC, Segre JA, Chen K, Kolls JK, Elinav E, Morita H, Xavier RJ, Hattori M, Honda K.:
    "Ectopic colonization of oral bacteria in the intestine drives TH1 cell induction and inflammation".
    Science. 358:359-365(2017).
  • 7. *Takayasu L, Suda W, Watanabe E, Fukuda S, Takanashi K, Ohno H, Takayasu M, Takayasu H, Hattori M.:
    "A 3-dimensional mathematical model of microbial proliferation that generates the characteristic cumulative relative abundance distributions in gut microbiomes."
    PLoS One. 12:e0180863 (2017).
  • 8. *Takayasu L, Suda W, Takanashi K, Iioka E, Kurokawa R, Shindo C, Hattori Y, Yamashita N, Nishijima S, Oshima K, Hattori M.:
    "Circadian oscillations of microbial and functional composition in the human salivary microbiome."
    DNA Res. 24:261-270 (2017).
  • 9. *Iwasawa K, Suda W, Tsunoda T, Oikawa-Kawamoto M, Umetsu S, Inui A, Fujisawa T, Morita H, Sogo T, Hattori M.:
    "Characterisation of the faecal microbiota in Japanese patients with paediatric-onset primary sclerosing cholangitis"
    Gut 66:1344-1346 (2017).
  • 10. *Nishijima S, Suda W, Oshima K, Kim SW, Hirose Y, Morita H, Hattori M.:
    "The gut microbiome of healthy Japanese and its microbial and functional uniqueness"
    DNA Res. 23:125-133 (2016).

メンバーリスト

主宰者

大野 博司
チームリーダー

メンバー

須田 亙
副チームリーダー
KUMAR Naveen
上級技師
緒方 勇亮
研究員
梅山 大地
研究員
上村 いつか
特別研究員
増岡 弘晃
特別研究員
柿原 知
大学院生リサーチ・アソシエイト
進藤 智絵
テクニカルスタッフⅠ
甲斐田 薫
テクニカルスタッフⅠ
田野倉 真紀
テクニカルスタッフⅠ
NOACK Joanna Christine
テクニカルスタッフⅡ

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22 西研究棟
Tel: 045-503-9302
Fax: 045-503-9613

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