Chemical Genetics Laboratory
吉田化学遺伝学研究室



吉田化学遺伝学研究室

研究室プロフィール

「化学遺伝学」とは古典遺伝学における「変異」を化学物質、特に細胞機能調節物質(バイオプローブ)に置き換え、それによって引き起こされるユニークな表現型を分子のレベルで解明することを目指した新しい分子遺伝学です。バイオプローブを用いた化学遺伝学的アプローチから真核細胞の環境応答、細胞周期制御、分子認識等における新たな知見が次々と得られつつあります。当研究室では、化学遺伝学を基盤にさらに微生物学、化学生物学やプロテオミクスなども駆使してバイオプローブの標的分子の機能解析を行うとともに、特にタンパク質の細胞内局在化機構とその制御、アセチル化、メチル化、ユビキチン化、SUMO化などのタンパク質翻訳後修飾とその相互ネットワークなどに焦点を当てて研究を行っています。究めることの楽しさを味わいながら新しい概念形成を目指した基礎・応用研究を進めていきたいと考えています。

 

説明: 説明: 説明: 吉田 稔
主任研究員
吉田 稔 (D.Agr.)
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研究テーマ

(1)

タンパク質アセチル化の機能解析

(2)

新しい生理活性物質の探索と分子標的に関する研究

(3)

分裂酵母のタンパク質修飾の網羅的解析

(4)

新しいタンパク質脱アセチル化酵素阻害剤の設計と評価

(5)

Localizomeを利用した核-細胞質間輸送タンパク質の網羅的解析

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主要論文

(1)

Bauer, F., Matsuyama, A., Candiracci, J., Dieu, M., Scheliga, J., Wolf, D. A., Yoshida, M., and Hermand, D.
Translational control of cell division by Elongator.
Cell Rep. in press 2012 
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(2)

Ito, T., Umehara, T., Sasaki, K., Nakamura, Y., Nishino, N., Terada, T., Shirouzu, M., Padmanabhan, B., Yokoyama, S., Ito, A., and Yoshida, M. 
Real-time imaging of histone H4K12-specific acetylation determines the modes of action of histone deacetylase and bromodomain inhibitors.
Chem. Biol. 2011 Apr 22;18(4):495-507. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

 

(3)

Arita, Y., Nishimura, S., Matsuyama, A., Yashiroda, Y., Usui, T., Boone, C., and Yoshida, M. 
Microarray-based target identification using drug hypersensitive fission yeast expressing ORFeome.Evaluation of functional groups on amino acids in cyclic tetrapeptides in histone deacetylase inhibition. 
Mol. BioSyst. 2011 May;7(5):1463-72. 
説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

 

(4)

Nishimura, S., Arita, Y., Honda, M., Iwamoto, K., Matsuyama, A., Shirai, A., Kawasaki, H., Kakeya, H., Kobayashi, T., Matsunaga, S., and Yoshida, M.
Marine antifungal theonellamides target 3b-hydroxysterol to activate Rho1 signaling. 
Nature Chem. Biol. 2010 Jul;6(7). 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

 

(5)

Schneider-Poetsch, T., Usui, T., Kaida, D., and Yoshida, M. 
Garbled messages and corrupted translations. 
Nat Chem Biol. 2010 Mar;6(3):189-198. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

 

(6)

Sasaki, K., Ito, T., Nishino, N., Khochbin, S., and Yoshida, M. 
Real-time imaging of histone H4 hyperacetylation in living cells. 
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009 Sep 22;106(38):16257-62. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

 

(7)

Ling F, Yoshida M, Shibata T. 
Heteroduplex joint formation free of net topological change by Mhr1, a mitochondrial recombinase.
J Biol Chem. 2009 Apr 3;284(14):9341-53. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

 

(8)

Shirai A, Matsuyama A, Yashiroda Y, Hashimoto A, Kawamura Y, Arai R, Komatsu Y, Horinouchi S, Yoshida M.

Global analysis of gel mobility of proteins and its use in target identification.
J Biol Chem. 2008 Apr 18;283(16):10745-52. Epub 2008 Feb 21. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

 

(9)

Kaida D, Motoyoshi H, Tashiro E, Nojima T, Hagiwara M, Ishigami K, Watanabe H, Kitahara T, Yoshida T, Nakajima H, Tani T, Horinouchi S, Yoshida M.
Spliceostatin A targets SF3b and inhibits both splicing and nuclear retention of pre-mRNA.
Nat Chem Biol. 2007 Sep;3(9):576-83. Epub 2007 Jul 22. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

(10)

Shimazu T, Horinouchi S, Yoshida M.
Multiple histone deacetylases and the CREB-binding protein regulate pre-mRNA 3'-end processing.
J Biol Chem. 2007 Feb 16;282(7):4470-8. Epub 2006 Dec 17. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

(11)

Matsuyama A, Arai R, Yashiroda Y, Shirai A, Kamata A, Sekido S, Kobayashi Y, Hashimoto A, Hamamoto M, Hiraoka Y, Horinouchi S, Yoshida M.
ORFeome cloning and global analysis of protein localization in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe.
Nat. Biotechnol. 2006 Jul;24(7):841-7. Epub 2006 Jun 25.説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

(12)

Shimazu T, Komatsu Y, Nakayama KI, Fukazawa H, Horinouchi S, Yoshida M.
Regulation of SV40 large T antigen stability by reversible acetylation.
Oncogene. 2006 Nov 30;25(56):7391-400. Epub 2006 Jun 12. 説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

(13)

Yashiroda Y, Yoshida M.
Nucleo-cytoplasmic transport of proteins as a target for therapeutic drugs.
Curr Med Chem. 2003 May;10(9): 741-8. 
Review.説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

(14)

Yoshida M, Matsuyama A, Komatsu Y, Nishino N.
From discovery to the coming generation of histone deacetylase inhibitors.
Curr Med Chem. 2003 Nov;10(22): 2351-8. 
Review.説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

(15)

Matsuyama A, Shimazu T, Sumida Y, Saito A, Yoshimatsu Y, Seigneurin-Berny D, Osada H, Komatsu Y, Nishino N, Khochbin S, Horinouchi S, Yoshida M.
In vivo destabilization of dynamic microtubules by HDAC6-mediated deacetylation.
EMBO J. 2002 Dec 16;21(24): 6820-31.
説明: 説明: 説明: http://www.riken.jp/SPD/ChemicalGeneticsLab/pubmed.png

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