研究紹介

生命機能科学研究センター

タンパク質機能・構造研究チーム

チームリーダー 白水 美香子 (Ph.D.)
白水 美香子 (Ph.D.)

個別化医療を実現する薬の開発においては、ターゲットとなる疾患に関与するタンパク質の機能と構造の情報の蓄積が一層重要となります。これまで解析が難しかった膜タンパク質をはじめとする高難度タンパク質の試料調製法や、生体分子複合体のクライオ電子顕微鏡による解析技術の開発を進めながら、創薬・医療等に貢献する構造解析技術の基盤を構築します。立体構造情報は、候補化合物のインシリコスクリーニングや動的構造計算に供され、創薬や細胞機能のシミュレーション研究へと発展することが期待されます。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

医歯薬学

キーワード

  • タンパク質調製
  • クライオ電子顕微鏡
  • X線結晶構造解析
  • 創薬

主要論文

  1. Ehara, H., Yokoyama, T., Shigematsu, H., Yokoyama, S., Shirouzu, M. and Sekine, S.
    "Structure of the complete elongation complex of RNA polymerase II with basal factors"
    Science, Epub ahead of print (2017).
  2. Hosaka, T., Okazaki, M., Kimura-Someya, T., Ishizuka-Katsura, Y., Ito, K., Yokoyama, S., Dodo, K., Sodeoka, M. and Shirouzu, M.:
    "Crystal structural characterization reveals novel oligomeric interactions of human voltage-dependent anion channel 1"
    Protein Sci., Epub ahead of print (2017).
  3. Shinoda, T., Shinya, N., Ito, K., Ohsawa, N., Terada, T., Hirata, K., Kawano, Y., Yamamoto, M., Kimura-Someya, T., Yokoyama, S. and Shirouzu, M.:
    "Structural basis for disruption of claudin assembly in tight junctions by an enterotoxin"
    Sci Rep., 6, 33632 (2016).
  4. Masuda, M., Uno, Y., Ohbayashi, N., Ohata, H., Mimata, A., Kukimoto-Niino, M., Moriyama, H., Kashimoto, S., Inoue, T., Goto, N., Okamoto, K., Shirouzu, M., Sawa, M. and Yamada, T.:
    "TNIK inhibition abrogates colorectal cancer stemness"
    Nat Commun., 7, 12586 (2016).
  5. Nango, E., Royant, A., Kubo, M., Nakane, T., Wickstrand, C., Kimura, T., Tanaka, T., Tono, K., Song, C., Tanaka, R., Arima, T., Yamashita, A., Kobayashi, J., Hosaka, T., Mizohata, E., Nogly, P., Sugahara, M., Nam, D., Nomura, T., Shimamura, T., Im, D., Fujiwara, T., Yamanaka, Y., Jeon, B., Nishizawa, T., Oda, K., Fukuda, M., Andersson, R., Båth, P., Dods, R., Davidsson, J., Matsuoka, S., Kawatake, S., Murata, M., Nureki, O., Owada, S., Kameshima, T., Hatsui, T., Joti, Y., Schertler, G., Yabashi, M., Bondar, AN., Standfuss, J., Neutze, R. and Iwata, S.:
    "A three-dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin"
    Science, 354 (6319), 1552-1557 (2016).
  6. Suzuki, K., Mizutani, K., Maruyama, S., Shimono, K., Imai, FL., Muneyuki, E., Kakinuma, Y., Ishizuka-Katsura, Y., Shirouzu, M., Yokoyama, S., Yamato, I. and Murata, T.:
    "Crystal structures of the ATP-binding and ADP-release dwells of the V1 rotary motor"
    Nat Commun., 7:13235 (2016).
  7. Shinoda, T., Shinya, N., Ito, K., Ishizuka-Katsura, Y., Ohsawa, N., Terada, T., Hirata, K., Kawano, Y., Yamamoto, M., Tomita, T., Ishibashi, Y., Hirabayashi, Y., Kimura-Someya, T., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.:
    "Cell-free methods to produce structurally intact mammalian membrane proteins"
    Sci Rep. 6, 30442 (2016).
  8. Hosaka, T., Yoshizawa, S., Nakajima, Y., Ohsawa, N., Hato, M., DeLong, E. F., Kogure, K., Yokoyama, S., Kimura-Someya, T., Iwasaki, W. and Shirouzu, M.:
    "Structural Mechanism for Light-driven Transport by a New Type of Chloride Ion Pump, Nonlabens marinus Rhodopsin-3"
    J. Biol. Chem., 291 (34), 17488-17495 (2016).
  9. Yamagishi, M., Shigematsu, H., Yokoyama, T., Kikkawa, M., Sugawa, M., Aoki, M., Shirouzu, M., Yajima, J. and Nitta, R.:
    "Structural Basis of Backwards Motion in Kinesin-1-Kinesin-14 Chimera: Implication for Kinesin-14 Motility"
    Structure, 24 (8), 1322-1334 (2016).
  10. Verba, K. A., Wang, R. Y., Arakawa, A., Liu, Y., Shirouzu, M., Yokoyama, S. and Agard, D. A.:
    "Atomic structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 reveals that Hsp90 traps and stabilizes an unfolded kinase"
    Science, 352 (6293), 1542-1547 (2016).