研究紹介

生命機能科学研究センター

転写制御構造生物学研究チーム

チームリーダー 関根 俊一 (Ph.D.)
関根 俊一 (Ph.D.)

細胞の中では、タンパク質等の生体高分子が複数集まってできた巨大分子複合体がはたらいています。当チームは、巨大分子複合体の調製法を確立するとともに、SPring-8/SACLAの放射光やクライオ電子顕微鏡を駆使して、RNAポリメラーゼと転写因子との複合体に代表される巨大複合体を解析し、生命を支える生体分子の動作原理やネットワークを立体構造のレベルで解明します。また、細菌やウイルスが持つ複製・転写系タンパク質は阻害剤のターゲットとして重要であることから、それらの立体構造解析により、創薬研究への貢献が期待できます。

研究関連分野

生物学

キーワード

  • 転写
  • RNAポリメラーゼ
  • ウイルス
  • クライオ電子顕微鏡
  • X線結晶構造解析

主要論文

  1. Ehara, H., Yokoyama, T., Shigematsu, H., Yokoyama, S., Shirouzu, M. and Sekine, S.:
    "Structure of the complete elongation complex of RNA polymerase II with basal factors"
    Science 2017.
  2. Shimizu, H., Miyazaki, H., Ohsawa, N., Shoji, S., Ishizuka-Katsura, Y., Tosaki, A., Oyama, F. Terada, T., Sakamoto, K., Shirouzu, M., Sekine, S., Nukina, N. and Yokoyama, S.
    "Structure-based site-directed photo-crosslinking analyses of multimeric cell-adhesive interactions of voltage-gated sodium channel β subunits."
    Sci Rep. 6:26618. 2016.
  3. Sekine, S., Murayama, Y., Svetlov, V., Nudler, E. and Yokoyama, S.:
    "The ratcheted and ratchetable structural states of RNA polymerase underlie multiple transcriptional functions"
    Mol Cell. 57, 408-421. 2015.
  4. Sekine, S., Murayama, Y., Svetlov, V., Nudler, E. and Yokoyama, S.:
    "Ratcheting of RNA polymerase toward structural principles of RNA polymerase operations"
    Transcription 6, 56-60. 2015.
  5. Antonopoulos, I.H., Murayama, Y., Warner, B.A., Sekine, S., Yokoyama, S. and Carey, P.R.:
    "Time-resolved Raman and polyacrylamide gel electrophoresis observations of nucleotide incorporation and misincorporation in RNA within a bacterial RNA polymerase crystal"
    Biochemistry 54, 652-665. 2015.
  6. Higo, T., Suka, N., Ehara, H., Wakamori, M., Sato, S., Maeda, H., Sekine, S., Umehara, T., Yokoyama, S.:
    "Development of a hexahistidine-3×FLAG-tandem affinity purification method for endogenous protein complexes in Pichia pastoris"
    J. Struct. Funct. Genomics. 15, 191-199. 2014.
  7. Naganuma, M., Sekine, S., Chong, Y.E., Guo, M., Yang, X.L., Gamper, H., Hou, Y.M., Schimmel, P. and Yokoyama, S.:
    "The selective tRNA aminoacylation mechanism based on a single G•U pair"
    Nature 510, 507-511. 2014.
  8. Tagami, S., Sekine, S., Minakhin, L., Esyunina, D., Akasaka, R., Shirouzu, M., Kulbachinskiy, A., Severinov, K. and Yokoyama, S.:
    "Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor"
    Genes Dev. 28, 521-531. 2014.
  9. Murayama, Y., Sekine, S. and Yokoyama, S.:
    "Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analyses of Thermus thermophilus backtracked RNA polymerase"
    Acta Cryst. F69, 174-177. 2013.
  10. Sekine, S., Tagami, S. and Yokoyama, S.:
    "Structural basis of transcription by bacterial and eukaryotic RNA polymerases"
    Curr. Opin. Struct. Biol., 22, 110-118. 2012.

メンバーリスト

主宰者

関根 俊一
チームリーダー

メンバー

清水 英明
研究員
上島 珠美
研究員
村山 祐子
研究員
江原 晴彦
研究員

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Tel: 045-503-9257
Fax: 045-503-9201

shunichi.sekine [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

関連リンク

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