研究紹介

環境資源科学研究センター

植物ゲノム発現研究チーム

チームリーダー 関 原明 (Ph.D.)
関 原明 (Ph.D.)

最先端のゲノム科学的方法により、環境ストレス適応・馴化に関するエピジェネティック、RNA、ペプチドの制御機構を明らかにし、化合物などの活用により新たな有用植物資源の創出法の開発を目指します。キャッサバの統合オミックス解析により塊根生成制御ネットワークを明らかにし、生産性向上などの有用植物資源の創出法の開発を目指します。

研究主分野

生物学

研究関連分野

総合生物 / 農学

キーワード

  • 植物ゲノム発現制御
  • 環境ストレス適応
  • キャッサバ
  • エピジェネティック制御
  • RNA制御

主要論文

  1. Seki, M., Narusaka, M., Kamiya, A., Ishida, J., Satou, M., Sakurai, T., Nakajima, M., Enju, A., Akiyama, K., Oono, Y., Muramatsu, M., Hayashizaki, Y., Kawai, J., Carninci, P., Itoh, M., Ishii, Y., Arakawa, T., Shibata, K., Shinagawa, A. and Shinozaki, K.:
    "Functional annotation of a full-length Arabidopsis cDNA collection."
    Science 296, 141-145 (2002).
  2. Seki, M., Narusaka, M., Ishida, J., Nanjo, T., Fujita, M., Oono, Y., Kamiya, A., Nakajima, M., Enju, A., Sakurai, T., Satou, M., Akiyama, K., Taji, T., Yamaguchi-Shinozaki, K., Carninci, P., Kawai, J., Hayashizaki, Y. and Shinozaki, K.:
    "Monitoring the expression profiles of 7000 Arabidopsis genes under drought, cold, and high-salinity stresses using a full-length cDNA microarray."
    Plant J 31, 279-292 (2002).
  3. Matsui, A., Ishida, J., Morosawa, T., Mochizuki, Y., Kaminuma, E., Endo, T.A., Okamoto, M., Nambara, E., Nakajima, M., Kawashima, M., Satou, M., Kim, J.M., Kobayashi, N., Toyoda, T., Shinozaki, K. and Seki, M:
    "Arabidopsis transcriptome analysis under drought, cold, high-salinity and ABA treatment conditions using a tiling array."
    Plant Cell Physiol. 49, 1135-1149 (2008).
  4. Kurihara, Y., Matsui, A., Hanada, K., Kawashima, M., Ishida, J., Morosawa, T., Tanaka, M., Kaminuma, E., Mochizuki, Y., Matsushima, A., Toyoda, T., Shinozaki, K. and Seki, M.:
    "Genome-wide suppression of aberrant mRNA-like noncoding RNAs by NMD in Arabidopsis."
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106, 2453-2458 (2009).
  5. To, T.K., Kim, J.M., Matsui, A., Kurihara, Y., Morosawa, T., Ishida, J., Tanaka, M., Endo, T., Kakutani, T., Toyoda, T., Kimura, H., Yokoyama, S., Shinozaki, K. and Seki, M.:
    "Arabidopsis HDA6 regulates locus-directed heterochromatin silencing in cooperation with MET1."
    PLoS Genet. 7, e1002055 (2011).
  6. Sako, K., Kim, J.M., Matsui, A., Nakamura, K., Tanaka, M., Kobayashi, M., Saito, K., Nishino, N., Kusano, M., Taji, T., Yoshida, M. and Seki, M.:
    "Ky-2, a histone deacetylase inhibitor, enhances high-salinity stress tolerance in Arabidopsis thaliana."
    Plant Cell Physiol. 57, 776-783 (2016).
  7. Kim, J.M., To, K.T., Matsui, A., Tanoi, K., Kobayashi, N.I., Matsuda, F., Habu, Y., Ogawa, D., Sakamoto, T., Matsunaga, S., Bashir, K., Rasheed, S., Ando, M., Takeda, H., Kawaura, K., Kusano, M., Fukushima, A., Endo, A.T., Kuromori, T., Ishida, J., Morosawa, T., Tanaka, M., Torii, C., Takebayashi, Y., Sakakibara, H., Ogihara, Y., Saito, K., Shinozaki, K., Devoto, A. and Seki, M.:
    "Acetate-mediated novel survival strategy against drought in plants."
    Nature Plants 3: 17097 (2017).
  8. Nguyen, H.M., Sako, K., Matsui, A., Suzuki, Y., Mostofa, M.G., Ha, C.V., Tanaka, M., Tran, L.S.P., Habu, Y. and Seki, M.:
    "Ethanol enhances high-salinity stress tolerance by detoxifying reactive oxygen species in Arabidopsis thaliana and rice."
    Front. Plant Sci. 8: 1001 (2017).
  9. Matsui, A., Iida, K., Tanaka, M., Yamaguchi, K., Mizunashi, K., Kim, J.M., Takahashi, S., Kobayashi, N., Shigenobu, S., Shinozaki, K. and Seki, M.:
    "Novel stress-inducible antisense RNAs of protein-coding loci are synthesized by Arabidopsis RDRs."
    Plant Physiol. 175, 457-472 (2017).
  10. Ueda, M., Matsui, A., Tanaka, M., Nakamura, T., Abe, T., Sako, K., Sasaki, T., Kim, J.M., Ito, A., Nishino, N., Shimada, H., Yoshida, M. and Seki, M.:
    "The distinct role of RPD3-like histone deacetylases between class I and II in salinity stress response."
    Plant Physiol. (in press) (2017).

メンバーリスト

主宰者

関 原明
チームリーダー

メンバー

金 鍾明
研究員
松井 章浩
研究員
中南 健太郎
研究員
内海 好規
研究員
BASHIR Khurram
研究員
上田 実
研究員
徳永 浩樹
特別研究員
佐古 香織
特別研究員
HA Chien Van
特別研究員
田中 真帆
テクニカルスタッフⅠ
石田 順子
テクニカルスタッフⅠ
高橋 聡史
テクニカルスタッフⅠ
野村 聖子
テクニカルスタッフⅡ
内海 稚佳子
テクニカルスタッフⅡ
土田 博子
テクニカルスタッフⅡ