「第56回 理研イブニングセミナー」、開催のお知らせ

参加ご希望の方は、会社名、氏名、メールアドレスを記載の上、
件名を『12/5 理研イブニングセミナー参加申込』として、下記のメールアドレス宛にお申し込み下さい。
Email: evening-seminar[at]riken.jp ※[at]は@に置き換えてください。

〆切： 2018年11月28日

「創薬シミュレーション専用計算機「MDGRAPE-4A」の開発秘話」

分子動力学シミュレーションは、タンパク質の構造最適化、タンパク質と薬剤の結合自由エネルギー計算など、様々な形で創薬への応用が進んでいます。
タンパク質は生体内で大きく形を変えながら働いていますが、その変化はゆっくりとしており、1ミリ秒(1/1000秒)付近までの計算が望まれています。
しかし、京などの普通のスパコンでは、並列化の難しさのため、計算に１年以上の時間がかかってしまいます。この問題を解決するため、我々のグループでは、通常のスパコンに比べ10倍以上の加速を可能にする分子動力学計算専用計算機MDGRAPE-4Aの開発を進めています。このために専用のLSIの開発まで行いました。
現在はシステムの製造中で、2018年度中には完成させ、2019年度以降ユーザに提供する計画です。
講演ではシステム開発およびその応用可能性について紹介します。

発表者:泰地 真弘人(生命機能科学研究センター 計算分子設計研究チーム)