主任研究員研究室 鈴木地球・惑星生命科学研究室
主任研究員 鈴木 志野（Ph.D.）
研究概要
当研究室では、地下生命圏に生きる未知の微生物を理解し、活用することを目的として研究を行っています。地下圏微生物は、地球の構成要素の１つであり、かつ、太古の地球の生命の特性を色濃く残していると考えられますが、その全容は分かっていません。我々は、フィールドワーク、微生物培養、生理機能解析、バイオインフォマティクスを駆使し、自然界に生きる微生物の未知の生態や代謝機能を明らかにすることで、初期生命進化の理解、アストロバイオロジーへの展開、極限微生物の持つ高機能な遺伝子の探索と資源化に挑戦します。
研究主分野
- 総合生物
研究関連分野
- 農学
- 生物学
キーワード
- 地球微生物学
- バイオインフォマティクス
- 生命の起源と進化
- 未利用遺伝資源の利用
- アストロバイオロジー
主要論文
「*」は、理研外のみでの成果です。
- 1.
*M. K. Nobu, R. Nakai, S. Tamazawa, H. Mori, A. Toyoda, A. Ijiri, S. Suzuki, K. Kurokawa, Y. Kamagata, H. Tamaki.
"Unique H2-utilizing lithotrophy in serpentinite-hosted systems"
The ISME Journal volume 17, 95–104 (2023) - 2.
*L. J Bird, J.G. Kuenen, M. R. Osburn, N. Tomioka, S. Ishii, C. Barr, K. H. Nealson, S. Suzuki*.
"Serpentinimonas gen. nov., Serpentinimonas raichei sp. nov., Serpentinimonas barnesii sp. nov. and Serpentinimonas maccroryi sp. nov., hyperalkaliphilic and facultative autotrophic bacteria isolated from terrestrial serpentinizing springs"
IJSEM 71: 8 (2021) - 3.
*P. Fryer, C.G. Wheat, T. Williams, C. Kelley, K. Johnson, J. Ryan, W. Kurz, J. Shervais, E. Albers, B. Bekins, B. Debret, J. Deng, Y. Dong, P. Eickenbusch, E. Frery, Y. Ichiyama, R. Johnston, R. Kevorkian, V. Magalhaes, S. Mantovanelli, W. Menapace, C. Menzies, K. Michibayashi, C. Moyer, K. Mullane, J. Park, R. Price, O. Sissmann, S. Suzuki, K. Takai, B. Walter, R. Zhang, D. Amon, D. Glickson, S. Pomponi.
"Mariana serpentinite mud volcanism exhumes subducted seamount materials: implications for the origin of life."
Philosophical Transactions of the Royal Society A 278: 2165 (2020) - 4.
*S. Suzuki*, K.H. Nealson, S. Ishii.
"Genomic and in-situ transcriptomic characterization of the candidate phylum NPL-UPL2 from highly-alkaline highly-reducing serpentinized groundwater."
Frontier in Microbiology 9: 3141. (2020) - 5.
*S. Ishii#*, S. Suzuki#, A. Tenney, K. H. Nealson and O. Bretschger.
"Comparative metatranscriptomics reveals extracellular electron transfer pathways conferring microbial adaptivity to surface redox potential changes"
The ISME Journal volume 12, 2844–2863 (2018) - 6.
*S. Suzuki#*, S. Ishii#*, T. Hoshino, A. Rietze, A. Tenney, P. L Morrill, F. Inagaki, J. G. Kuenen, K. H Nealson.
"Unusual metabolic diversity of hyperalkaliphilic microbial communities associated with subterranean serpentinization at The Cedars."
The ISME Journal 11: 2584-2598. (2017) - 7.
*S. Suzuki*, J. G. Kuenen, K. Schipper, S. van der Velde, S. Ishii, A. Wu, D. Y. Sorokin, A. Tenney, X.Y. Meng, P. L. Morrill, Y. Kamagata, G. Muyzer, K. H. Nealson.
"Physiological and genomic features of highly alkaliphilic hydrogen-utilizing Betaproteobacteria from a continental serpentinizing site"
Nature Communications 5: 3900. (2014) - 8.
*S. Suzuki*, S. Ishii, A. Wu, A. Cheung, G. Wanger, A. Tenney, J. G. Kuenen, and K. H. Nealson.
"Microbial diversity in The Cedars, an ultra-basic, ultra-reducing and low salinity serpentinizing ecosystem."
Proc Ntrl Acad Sci USA. 110: 15336-41. (2013) - 9.
*S. Ishii#*, S. Suzuki#, T. M. Norden-Krichmar, A. Tenney, P. S. G. Chain, M. B. Scholz, K. H. Nealson and O. Bretschger.
"A novel metatranscriptomic approach to identify gene expression dynamics during extracellular electron transfer."
Nature Communications 4: 1601. (2013) - 10.
*S. Suzuki, T. Aono, K.B.Lee, T. Suzuki, C. T. Liu, H. Miwa, S. Wakao, T. Iki and H. Oyaizu.
"Rhizobial Factors Required for Stem Nodule Maturation and Maintenance in Sesbania rostrata-Azorhizobium caulinodans ORS571 Symbiosis"
Applied and Environmental Microbiology 73:6650-6659 (2007)
メンバーリスト
主宰者
- 鈴木 志野
- 主任研究員
お問い合わせ先
〒351-0198 埼玉県和光市広沢2-1
生物科学研究棟
Email: shino.suzuki [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。