理研ECL研究チーム・理研ECL研究ユニット 横林エピゲノムダイナミクス理研ECL研究チーム
理研ECL研究チームリーダー 横林 しほり(Ph.D.)
研究概要
細胞のエピゲノム状態は個体の発生過程やその生涯を通じてダイナミックに制御されていますが、その確立や維持の過程においてどの程度の多様性(細胞間のばらつきや個体差など)を生じるのか、その実態はわかっていません。当研究室は、ヒトを含む哺乳類を用いた細胞・組織レベルの解析を通じて、エピゲノム多様性の分子基盤と、環境変化応答や細胞運命変化への影響を理解することを目指します。将来的には、疾患感受性などにおける個々の表現型多様性とエピゲノム多様性の関係性理解につなげていきたいと考えています。
研究主分野
- 生物学
研究関連分野
- 総合生物
- 医歯薬学
- 分子生物学関連
- 発生生物学関連
- ゲノム生物学関連
キーワード
- ヒト多能性幹細胞
- エピゲノム多様性
- ヘテロクロマチン
- 生殖細胞
- 哺乳類発生
主要論文
「*」は、理研外のみでの成果です。
- 1.
*Nagano M, Hu B, Yokobayashi S, Yamamura A, Umemura F, Coradin M, Ohta H, Yabuta Y, Ishikura Y, Okamoto I, Ikeda H, Kawahira N, Nosaka Y, Shimizu S, Kojima Y, Mizuta K, Kasahara T, Imoto Y, Meehan K, Stocsits R, Wutz G, Hiraoka Y, Murakawa Y, Yamamoto T, Tachibana K, Peters JM, Mirny L, Garcia B, Majewski J, Saitou M.
"Nucleome programming is required for the foundation of totipotency in mammalian germline development"
The EMBO Journal, 41: e110600 (2022) - 2.
*Yokobayashi S, Yabuta Y, Nakagawa M, Okita K, Hu B, Murase Y, Nakamura T, Bourque G, Majewski J, Yamamoto T, Saitou M.
"Inherent genomic properties underlie the epigenomic heterogeneity of human induced pluripotent stem cells"
Cell Reports, 37: 109909 (2021) - 3.
*Yamashiro C, Sasaki K, Yokobayashi S, Kojima Y, Saitou M.
"Generation of human oogonia from induced pluripotent stem cells in culture"
Nature Protocol, 15: 1560-1583 (2020) - 4.
*Yamashiro C, Sasaki K, Yabuta Y, Kojima Y, Nakamura T, Okamoto I, Yokobayashi S, Murase Y, Ishikura Y, Shirane K, Sasaki H, Yamamoto T, Saitou M.
"Generation of human oogonia from induced pluripotent stem cells in vitro"
Science, 362: 356-360 (2018) - 5.
*Kojima Y, Sasaki K, Yokobayashi S, Sakai Y, Nakamura T, Yabuta Y, Nakaki F, Nagaoka S, Woltjen K, Hotta A, Yamamoto T, Saitou M.
"Evolutionarily Distinctive Transcriptional and Signaling Programs Drive Human Germ Cell Lineage Specification from Pluripotent Stem Cells"
Cell Stem Cell, 21: 517-532 (2017) - 6.
*Yokobayashi S, Okita K, Nakagawa M, Nakamura T, Yabuta Y, Yamamoto T, Saitou M.
"Clonal variation of human induced pluripotent stem cells for induction into the germ cell fate"
Biology of Reproduction, 96: 1154-1166 (2017) - 7.
*Sasaki K, Yokobayashi S, Nakamura T, Okamoto I, Yabuta Y, Kurimoto K, Ohta H, Moritoki Y, Iwatani C, Tsuchiya H, Nakamura S, Sekiguchi K, Sakuma T, Yamamoto T, Mori T, Woltjen K, Nakagawa M, Yamamoto T, Takahashi K, Yamanaka S, Saitou M.
"Robust In Vitro Induction of Human Germ Cell Fate from Pluripotent Stem Cells"
Cell Stem Cell, 17: 178-94 (2015) - 8.
*Yokobayashi S, Liang CY, Kohler H, Nestorov P, Liu Z, Vidal M, van Lohuizen M, Roloff TC, Peters AH.
"PRC1 coordinates timing of sexual differentiation of female primordial germ cells"
Nature, 495: 236-40 (2013) - 9.
*Terranova R, Yokobayashi S, Stadler MB, Otte AP, van Lohuizen M, Orkin SH, Peters AHFM.
"Polycomb group proteins Ezh2 and Rnf2 direct genomic contraction and imprinted repression in early mouse embryos"
Developmental Cell, 15: 668-79 (2008) - 10.
*Yokobayashi S, Watanabe Y.
"The kinetochore protein Moa1 enables cohesion-mediated monopolar attachment at meiosis I"
Cell, 123: 803-17 (2005)
関連リンク
メンバーリスト
主宰者
- 横林 しほり
- 理研ECL研究チームリーダー
お問い合わせ先
〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Email: shihori.yokobayashi [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。