主任研究員研究室 川口生体非平衡物理学研究室
主任研究員 川口 喬吾(Ph.D.)
研究概要

私たちは生物物理学の研究グループです。実験と理論の両面から、相転移、形態形成、進化、クロマチン物理といったテーマに取り組んでいます。非平衡物理学や機械学習、また細胞から一分子観察までさまざまな実験技術を融合させ、独自の視点から生物学のいろいろな問題に取り組んでいます。
研究主分野
- 数物系科学
研究関連分野
- 複合領域
- 総合生物
- 生物学
- 生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
- 数理物理および物性基礎関連
キーワード
- 非平衡
- 細胞集団運動
- 形態進化
- クロマチン
主要論文
「*」は、理研外のみでの成果です。
- 1.
Cerbus, R.T., Hiratani, I., and Kawaguchi, K.:
"Homeotic and non-homeotic patterns in the tetrapod vertebral formula"
PNAS 121, 2411421121 (2024). - 2.
Adachi, K., and Kawaguchi, K.:
"Predicting heteropolymer interactions: Demixing and hypermixing of disordered protein sequences"
Phys Rev X 14, 031011 (2024). - 3.
Lubana, E.S., Kawaguchi, K., Dick, R.P., and Tanaka, H.:
"A percolation model of emergence: Analyzing transformers trained on a formal language"
Accepted at ICML (2025). - 4.
Fukai, Y., and Kawaguchi, K.:
"LapTrack: Linear assignment particle tracking with tunable metrics"
Bioinformatics, 39, btac799 (2022). - 5.
Yamamoto, T., Cockburn, K., Greco, V., and Kawaguchi, K.:
"Probing the rules of cell coordination in live tissues by interpretable machine learning based on graph neural networks"
PLOS Comp Biol 18, e1010477 (2022). - 6.
Adachi, K., Takasan, K., and Kawaguchi, K.:
"Activity-induced phase transition in a quantum many-body system"
Phys Rev Research 4, 013194 (2022). - 7.
Mesa, K.R., Kawaguchi, K., Cockburn, K., Gonzalez, D., Boucher, J., Xin, T., Klein, A.M., and Greco, V.:
"Homeostatic Epidermal Stem Cell Self-Renewal Is Driven by Local Differentiation"
Cell Stem Cell 23, 677 (2018). - 8.
*Kawaguchi, K., Kageyama, R., and Sano, M.:
"Topological defects control collective dynamics in neural progenitor cell cultures"
Nature 545, 327–331 (2017).
関連リンク
メンバーリスト
主宰者
- 川口 喬吾
- 主任研究員
お問い合わせ先
〒650-0047兵庫県神戸市中央区港島南町2-2-3
発生・再生研究棟C
Email: kyogo.kawaguchi@riken.jp