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環境資源科学研究センター バイオ生産情報研究チーム

チームリーダー 持田 恵一(Ph.D.)

研究概要

持田 恵一 (Ph.D.)

草本系のセルロースバイオマスの量的・質的な生産性を向上させた植物の開発を目指しています。草本モデル植物を用いて植物の高生産性、環境ストレス耐性などの有用形質を付与するための遺伝子探索を進めます。また、バイオマス資源用植物への応用研究を大学や研究機関との連携研究で推進します。

研究主分野

  • 生物学

研究関連分野

  • 情報学
  • 農学

キーワード

  • ゲノム
  • バイオインフォマティクス
  • 植物バイオマスの増産
  • 草本植物
  • ゲノムの倍数性

主要論文

  • 1. Yusuke Kouzai, Minami Shimizu, Komaki Inoue, Yukiko Uehara-Yamaguchi, Kotaro Takahagi, Risa Nakayama, Takakazu Matsuura, Izumi C Mori, Takashi Hirayama,Sobhy S H Abdelsalam, Yoshiteru Noutoshi, Keiichi Mochida.:
    "BdWRKY38 is required for the incompatible interaction of Brachypodium distachyon with the necrotrophic fungus Rhizoctonia solani."
    The Plant J.(2020)
  • 2. Keiichi Mochida, Alexander E Lipka, Takashi Hirayama.:
    "Exploration of Life-Course Factors Influencing Phenotypic Outcomes in Crops."
    Plant Cell Physiol 61,1381.(2020)
  • 3. Keiichi Mochida, Ryuei Nishii, Takashi Hirayama.:
    Decoding Plant-Environment Interactions That Influence Crop Agronomic Traits.
    Plant Cell Physiol 61,1408.(2020)
  • 4. Toshihisa Nomura, Komaki Inoue, Yukiko Uehara-Yamaguchi, Koji Yamada, Osamu Iwata, Kengo Suzuki, Keiichi Mochida.:
    "Highly efficient transgene-free targeted mutagenesis and single-stranded oligodeoxynucleotide-mediated precise knock-in in the industrial microalga Euglena gracilis using Cas9 ribonucleoproteins."
    Plant Biotechnol.J 17,2032.(2019)
  • 5. Onda Y, Inoue K, Sawada Y, Shimizu M, Takahagi K, Uehara-Yamaguchi Y, Hirai MY, Garvin DF, Mochida K.:
    "Genetic Variation for Seed Metabolite Levels in Brachypodium distachyon."
    Int. J. Mol. Sci 20,9.(2019)
  • 6. Mochida K, Koda S, Inoue K, Hirayama T, Tanaka S, Nishii R, Melgani F.:
    "Computer vision-based phenotyping for improvement of plant productivity: a machine learning perspective."
    Gigascience 1;8(1). (2019)
  • 7. Mochida K, Koda S, Inoue K, Nishii R.:
    "Statistical and Machine Learning Approaches to Predict Gene Regulatory Networks From Transcriptome Datasets."
    Front Plant Sci 29;9:1770.(2018)
  • 8. Kouzai Y, Noutoshi Y, Inoue K, Shimizu M, Onda Y, Mochida K.:
    "Benzothiadiazole, a plant defense inducer, negatively regulates sheath blight resistance in Brachypodium distachyon."
    Sci Rep 26;8(1):17358.(2018)
  • 9. Takahagi K, Inoue K, Mochida K.:
    "Gene Co-expression Network Analysis Suggests the Existence of Transcriptional Modules Containing a High Proportion of Transcriptionally Differentiated Homoeologs in Hexaploid Wheat."
    Front Plant Sci 8;9:1163.(2018)
  • 10. Onda Y, Takahagi K, Shimizu M, Inoue K, Mochida K.:
    "Multiplex PCR Targeted Amplicon Sequencing (MTA-Seq): Simple, Flexible, and Versatile SNP Genotyping by Highly Multiplexed PCR Amplicon Sequencing."
    Front Plant Sci 23;9:201.(2018)

研究成果(プレスリリース)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

持田 恵一
チームリーダー

メンバー

野村 俊尚
研究員
香西 雄介
研究員
清水 みなみ
テクニカルスタッフⅡ
上原 由紀子
テクニカルスタッフⅡ
金谷 麻加
テクニカルスタッフⅡ

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22 E804
Fax: 045-503-9182

交通アクセス

Email: keiichi.mochida [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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