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環境資源科学研究センター 化合物リソース開発研究ユニット

ユニットリーダー 長田 裕之(D.Agr.)

研究概要

長田 裕之 (D.Agr.)

化合物ライブラリーは、ケミカルバイオロジーの研究手法を用いて生物機能制御研究、医農薬研究を推進する上で、欠くことの出来ない研究ツールです。当ユニットは化合物ライブラリーの有効活用を目的として化合物ライブラリー基盤をベースとした連携研究を推進します。化合物ライブラリーおよび化合物情報の提供などを通じて、資源科学研究、ケミカルバイオロジー研究をサポートし、当該分野での連携をプロモートします。また、ケミカルバイオロジー研究グループ、生合成研究ユニット等と連携して化合物ライブラリーの充実を図ります。

研究主分野

  • 複合領域

研究関連分野

  • 情報学
  • 総合生物
  • 農学
  • 医歯薬学

キーワード

  • ケミカルバイオロジー
  • 天然化合物バンク
  • 化学生物情報学
  • 化合物ライブラリー

主要論文

  • 1.Piotrowski JS, Li SC, Deshpande R, Simpkins SW, Nelson J, Yashiroda Y, Barber JM, Safizadeh H, Wilso E, Okada H, Gebre AA, Kubo K, Torres NP, LeBlanc MA, Andrusiak K, Okamoto R, Yoshimura M, Leeuwen Jv, Shirahige K, Baryshnikova A, Brown GW, Hirano H, Costanzo M, Andrews B, Ohya Y, Osada H, Yoshida M, Myers CL & Boone C.
    "Functional annotation of chemical libraries across diverse biological processes."
    Nat. Chem. Biol., in press (2017).
  • 2.Noguchi T, Oishi S, Honda K, Kondoh Y, Saito T, Ohno H, Osada H & Fujii N:
    "Screening of a virtual mirror-image library of natural products."
    Chem. Commun., 52, 7653-7656 (2016).
  • 3.Kunii M, Ohara-Imaizumi M, Takahashi N, Kobayashi M, Kawakami R, Kondoh Y, Shimizu T, Simizu S, Lin B, Nunomura K, Aoyagi K, Ohno M, Ohmuraya M, Sato T, Yoshimura SI, Sato K, Harada R, Kim YJ, Osada H, Nemoto T, Kasai H, Kitamura T, Nagamatsu S, & Harada A:
    "Opposing roles for SNAP23 in secretion in exocrine and endocrine pancreatic cells."
    J. Cell Biol., 215, 121-138 (2016).
  • 4.Hashimoto M, Bhuyan F, Hiyoshi M, Noyori O, Nasser H, Miyazaki M, Saito T, Kondoh Y, Osada H, Kimura S, Hase K, Ohno H & Suzu S:
    "Potential Role of the Formation of Tunneling Nanotubes in HIV-1 Spread in Macrophages."
    J. Immunol., 196: 1832-1841 (2016).
  • 5.Hagiwara K, Ishii H, Murakami T, Takeshima SN, Chutiwitoonchai N, Kodama EN, Kawaji K, Kondoh Y, Honda K, Osada H, Tsunetsugu-Yokota Y, Suzuki M & Aida Y:
    "Synthesis of a Vpr-Binding Derivative for Use as a Novel HIV-1 Inhibitor."
    PLoS One, 10: e0145573 (2015).
  • 6.Soeda Y, Yoshikawa M, Almeida OF, Sumioka A, Maeda S, Osada H, Kondoh Y, Saito A, Miyasaka T, Kimura T, Suzuki M, Koyama H, Yoshiike Y, Sugimoto H, Ihara Y & Takashima A:
    "Toxic tau oligomer formation blocked by capping of cysteine residues with 1,2-dihydroxybenzene groups."
    Nat. Commun., 6: 10216 (2015).
  • 7.Kakisaka M, Sasaki Y, Yamada K, Kondoh Y, Hikono H, Osada H, Tomii K, Saito T & Aida Y:
    "A Novel Antiviral Target Structure Involved in the RNA Binding, Dimerization, and Nuclear Export Functions of the Influenza A Virus Nucleoprotein."
    PLoS Pathog., 11: e1005062 (2015).
  • 8.Jang JP, Nogawa T, Uramoto M, Okano A, Futamura Y, Shimizu T, Takahashi S, Jang JH, Ahn JS & Osada H:
    "RK-270A-C, new oxindole derivatives isolated from a microbial metabolites fraction library of Streptomyces sp. RK85-270."
    J. Antibiot., 68: 293-295 (2015).
  • 9.Choi SB, Choong YS, Saito A, Wahab HA, Najimudin N, Watanabe N, Osada H & Ong EBB:
    "In silico investigation of a HIV-1 Vpr inhibitor binding site: potential for virtual screening and anti-HIV drug design."
    Mol. Inform., 11: 742-748 (2014).
  • 10.Maeda K, Nakajima Y, Motoyama T, Kitou Y, Kosaki T, Saito T, Nishiuchi T, Kanamaru K, Osada H, Kobayashi T & Kimura M:
    "Effects of acivicin on growth, mycotoxin production and virulence of phytopathogenic fungi."
    Lett. Appl. Microbiol., 59: 377-383 (2014).

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

長田 裕之
ユニットリーダー

メンバー

近藤 恭光
専任研究員
渡邉 信元
上級研究員
平野 弘之
テクニカルスタッフⅠ
岩井 祐太
テクニカルスタッフⅠ

お問い合わせ先

〒351-0198 埼玉県和光市広沢2-1
ケミカルバイオロジー研究棟
Tel: 048-467-4839
Fax: 048-462-1353

交通アクセス

Email: npdepo [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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