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生命医科学研究センター 理研-IFOMがんゲノミクス連携研究チーム

チームリーダー 村川 泰裕(M.D., Ph.D)

研究概要

村川 泰裕 (M.D., Ph.D)

当研究チームでは、がんの発生・維持の根源的な分子メカニズムの解明を目指したオミックス解析を行います。新しいオリジナルなオミックス手法論の開発を行い、従来法では見えてこなかった新しい生命現象や概念を明らかにすることを目標としています。さらに、得られたゲノムビッグデータをもとに、新たなゲノム創薬手法の開発や次世代のゲノム医療の実現を通して、我々の健康の増進に貢献します。

研究主分野

  • 医歯薬学

研究関連分野

  • 情報学
  • 複合領域
  • 生物学
  • ゲノム科学

キーワード

  • ゲノミクス
  • エンハンサー
  • バイオインフォマティクス
  • ゲノム医学
  • RNA生物学

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1.Hirabayashi S., Bhagat S., Matsuki Y., Takegami Y., Uehata T., Kanemaru A., Itoh M., Shirakawa K., Takaori-Kondo A., Takeuchi O., Carninci P., Katayama S., Hayashizaki Y., Kere J., Kawaji H., Murakawa Y.
    NET-CAGE Characterizes Dynamics and Topology of Human Transcribed Cis-regulatory Elements
    Nature Genetics, in press
  • 2.Yoshihara M., Araki A., Kasama Y., Sunayama M., Abe M., Nishida K., Kawaji H., Hayashizaki Y., Murakawa Y.
    Hotspots of de novo point mutations in induced pluripotent stem cells.
    Cell Reports, 21:308-315. (2017)
  • 3.Murakawa, Y., Yoshihara, M., Kawaji H., Nishikawa M., Zayed H., Suzuki H., Fantom Consortium, Hayashizaki Y.
    Enhanced identification of transcriptinal enhancers provides mechanistic insights into diseases.
    Trends in Genetics 32:76-88. (2016)
  • 4.*Murakawa, Y., Hinz, M., Mothes, J., Schuetz, A., Yasuda, T., Mastrobuoni, G., Friedel, C.C., Dolken, L., Kempa, S., Schmidt-Supprian, M., Heinemann, U., Wolf, J, Scheidereit, C., Landthaler, M.
    RC3H1 represses the IKK/NF-κB negative feedback regulator A20 by binding to a 3’UTR composite structure-sequence element.
    Nature Communications, 6:7367. (2015)
  • 5.*Mino, T., Murakawa, Y., Fukao, A., Vandenbon, A., Wessels, H., Ori, D., Uehata, T., Tartey, S., Akira, S., Suzuki, Y., Vinueesa, GG., Ohler, U., Standley, DM., Landthaler, M., Fujiwara, T., Takeuchi, O.
    Regnase-1 and Roquin Regulate a Common Element in Inflammatory mRNAs by Spatiotemporally Distinct Mechanisms.
    Cell, 161 1058-1073. (2015)
  • 6.*Rybak-Wolf, A. (#), Jens, M. (#), Murakawa, Y. (#), Herzog, M., Landthaler, M., Rajewsky, N.
    A variety of Dicer substrates in human and C.elegans.
    Cell, 159 1153-1167. (2014)
  • 7.*Schuetz, A., Murakawa, Y., Rosenbaum, E., Landthaler, M., Heinemann, U.
    Roquin binding to stem-loop mRNAs induces protein dimerization and involves a winged helix-turn-helix motif.
    Nature Communications, 5 5701. (2014)
  • 8.*Baltz, AG., Munschauer, M., Schwanhausser, B., Vasile, A., Murakawa, Y., Schueler, M., Youngs, N., Penfold-Brown, D., Drew, K., Milek, M., Wyler, E., Bonneau, R., Selbach, M., Dieterich, C., Landthaler, M.
    The mRNA-bound proteome and its global occupancy profile on protein-coding transcripts.
    Molecular Cell, 46 674-690. (2012)
  • 9.*Murakawa, Y., Sonoda, E., Barber, L.J., Zeng, W., Yokomori, K., Kimura, H., Niimi, A., Lehmann, A., Zhao, G.Y., Hochegger, H., Boulton, SJ., Takeda, S.
    Inhibitors of the proteasome suppress homologous DNA recombination in mammalian cells.
    Cancer research, 67, 8536-8543. (2007)
  • 10.*Zhao, G.Y., Sonoda, E., Barber, L.J., Oka, H., Murakawa, Y., Yamada, K., Ikura, T., Wang, X., Kobayashi, M., Yamamoto, K., Boulton, S.J., Takeda, S.
    A critical role for the ubiquitin-conjugating enzyme Ubc13 in initiating homologous recombination.
    Molecular Cell, 25, 663-675. (2007)

研究成果(プレスリリース)

メンバーリスト

主宰者

村川 泰裕
チームリーダー

採用情報

募集職種 応募締切
パートタイマー募集(Y20016) ポストが決まり次第
研究員、特別研究員、テクニカルスタッフⅠまたはテクニカルスタッフⅡ募集 (IMS114-2001) ポストが決まり次第
特別研究員・リサーチアソシエイト募集 (IMS114-1901) ポストが決まり次第

刊行物

お問い合わせ先

神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
西研究棟W407
Tel: 045-503-8246
Fax: 045-503-9323
Email: yasuhiro.murakawa [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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