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計算科学研究センター 創薬化学AIアプリケーションユニット

ユニットリーダー 池田 和由(Ph.D.)

研究概要

池田 和由

創薬の各段階において、初期ヒットから動物モデルで薬効を示すリードに導く過程(ヒット to リード)は、臨床第二相試験と並ぶボトルネックとなっており、近年の低分子創薬の停滞の原因の一つとなっています。当ユニットは、ヒット to リード及びリード最適化の過程(いわゆる創薬化学プロセス)のAI による効率化を目的としています。創薬プロセスの時間とコストの増加の原因は、活性とADMET(薬物動態と毒性)を同時に最適化することが難しいことです。創薬プロセスを効率的に進めるために、京都大学およびLINC と共同で、新規構造発生、合成経路予測、活性/ ADMET 予測のためのAI モデルを構築しています。

研究主分野

  • コンピューター科学

研究関連分野

  • 化学
  • 薬学 & 毒物学

キーワード

  • インシリコスクリーニング
  • データベース
  • 人工知能
  • 深層学習
  • 中分子

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. Shimizu Y., Ohta M., Ishida S., Terayama K., Osawa M., Honma T., Ikeda K.:
    "AI-driven molecular generation of not-patented pharmaceutical compounds using world open patent data."
    J Cheminform. 2023, 15 (1), 120.
  • 2. *Ikeda K., Maezawa Y., Yonezawa T., Shimizu Y., Tashiro T., Kanai S., Sugaya N., Masuda Y., Inoue N., Niimi T., Masuya K., Mizuguchi K., Furuya T., Osawa M.:
    "DLiP-PPI library: An integrated chemical database of small-to-medium-sized molecules targeting protein–protein interactions."
    Frontiers in Chemistry 2023 10, 1090643.
  • 3. *Ikeda K., Kezuka Y., Nonaka T., Yonezawa T., Osawa M., Katoh E.:
    "Comprehensive Approach of 19F Nuclear Magnetic Resonance, Enzymatic, and In Silico Methods for Site-Specific Hit Selection and Validation of Fragment Molecules that Inhibit Methionine γ-Lyase Activity."
    J Med Chem. 2021, 64(19):14299-14310.

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

池田 和由
ユニットリーダー

メンバー

清水 祐吾
研究員
幸 瞳
技師
佐藤 朋広
研究員
渡邉 千鶴
研究員
神坂 紀久子
技師

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Email: kazuyoshi.ikeda@riken.jp

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