東京大学大学院 理学系研究科の半場 悠 博士課程大学院生（研究当時。現在、理化学研究所 生命医科学研究センター リサーチアソシエイト）・角田 達彦 教授（新領域創成科学研究科 教授・理化学研究所 生命医科学研究センター チームリーダー）らによる研究グループは、人の組織での長鎖遺伝子間非翻訳RNA（lincRNA）の発現と染色体のトポロジカルドメイン（TAD）のデータを用い、lincRNAの遺伝子座がタンパク質コード遺伝子（PCG）に比べてTADの内側の領域に著しく局在することや、TAD内のlincRNAはTAD外のlincRNAよりも発現の組織特異性が高いことを明らかにしました。そしてこれらに基づき、lincRNAを指標として転写状態を解釈するための解析フレームワークを提案しました。これを肥大型心筋症のデータに適用し、TADレベルのケラチンの異常発現、LINC00881の発現低下に伴うE2F1転写因子による筋細胞分化関連遺伝子の発現の抑制解除という、肥大型心筋症に特有の転写制御を発見しました。本成果により、将来的にゲノムの立体構造に依存したlincRNAの機能や制御が理解され、その医学的応用が可能になります。
詳細は東京大学 大学院理学系研究科・理学部のホームページをご覧ください。
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理化学研究所 広報室 報道担当
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