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環境資源科学研究センター細胞生産研究チーム

チームディレクター近藤昭彦（Ph.D.）

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研究概要

2012年度に発足した細胞生産研究チームでは、植物原料を用いて化学品の材料であるバイオモノマーを生産する微生物の最適な構築技術を開発します。さらに、産業界との連携を強化し、それらバイオモノマーについて草本バイオマスや木質バイオマスなどの植物原料から合成する技術を開発します。

研究主分野

工学

研究関連分野

農学
情報学
生物学
バイオテクノロジー
バイオインフォマティクス

キーワード

合成生物学
代謝工学
バイオものづくり
代謝設計
酵素工学

主要論文

1. Mitsui, R., Kondo, A, Shirai, T.:
"Production of (R)-citramalate by engineered Saccharomyces cerevisiae."
Metabolic Engineering Communications, 19, e00247. (2024).
2. Noda, S., Mori, Y., Ogawa, Y., Fujiwara, R., Dainin, M., Shirai, T., Kondo, A.:
"Metabolic and enzymatic engineering approach for the production of 2-phenylethanol in engineered Escherichia coli."
Bioresource Technology, 406, 130927. (2024).
3. Vikromvarasiri, N., Noda, S., Shirai, T., Kondo, A.:
"Investigation of two metabolic engineering approaches for (R,R)-2,3-butanediol production from glycerol in Bacillus subtilis."
Journal Biological Engineering, 17, 3. (2023).
4. Tanaka, K., Shirai, T., Vavricka, C.J., Matsuda, M., Kondo, A., Hasunuma, T.:
"Dark accumulation of downstream glycolytic intermediates initiates robust photosynthesis in cyanobacteria"
Plant Physiology. 191, 2400-2413. (2023).
5. Shirai, T., Kondo, A.:
"In Silico Design Strategies for the Production of Target Chemical Compounds Using Iterative Single-Level Linear Programming Problems"
Biomolecules, 12, 620. (2022).
6. Vikromvarasiri, N., Shirai, T., Kondo, A.:
"Metabolic engineering design to enhance (R,R)-2,3-butanediol production from glycerol in Bacillus subtilis based on flux balance analysis"
Microbial Cell Factory. 20, 196. (2021).
7. Noda, S., Mori, Y., Fujiwara, R., Shirai, T., Tanaka, T., Kondo, A.
"Reprogramming Escherichia coli pyruvate-forming reaction towards chorismate derivatives production"
Metabolic Engineering 67, 1-10. (2021).
8. Mori, Y., Noda, S., Shirai, T., Kondo, A.:
"Direct 1,3-butadiene biosynthesis in Escherichia coli via a tailored ferulic acid decarboxylase mutant"
Nature Communications, 12, 2195. (2021).
9. Noda, S., Shirai, T., Mori, Y., Oyama, S., Kondo, A.:
"Engineering a synthetic pathway for maleate in Escherichia coli"
Nature Communications. 8, 1153. (2017).
10. Shirai, T., Osanai, T., Kondo, A.:
"Designing intracellular metabolism for production of target compounds by introducing a heterologous metabolic reaction based on a Synechosystis sp. 6803 genome-scale model"
Microbial Cell Factory, 15, 13. (2016).