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生命機能科学研究センター フィジカルバイオロジー研究チーム

チームリーダー 柴田 達夫(Ph.D.)

研究概要

柴田 達夫 (Ph.D.)

個体はたくさんの種類の細胞から構成される多細胞システムです。1つの細胞が分裂を繰り返して個体ができあがる過程を理解するためには、遺伝子や分子から細胞へ、細胞から組織へ、組織から組織の集合へと、階層を一歩ずつ上がっていく必要があります。そのためには、最新の技術による生命現象の定量的な計測と、物理学や数学を基礎にした計算モデルやコンピュータシミュレーションが不可欠です。私たちの研究室では理論的アプローチと実験データ解析のアプローチを組み合わせて、細胞の情報処理、細胞の運動、細胞集団の協調的運動、遺伝子ネットワークの研究を進めています。

キーワード

  • 極性形成
  • 軸形成
  • 走化性
  • 細胞運動
  • 集団運動

主要論文

  • 1. Hörning, M., & Shibata, T.:
    "Three-Dimensional Cell Geometry Controls Excitable Membrane Signaling in Dictyostelium Cells."
    Biophysical Journal, 116 (2), 372-382. (2019) 10.1016/j.bpj.2018.12.012
  • 2. Sekine, R., Shibata, T., & Ebisuya, M.:
    "Synthetic mammalian pattern formation driven by differential diffusivity of Nodal and Lefty."
    Nature Communications, 9 (1), 5456. (2018) 10.1038/s41467-018-07847-x
  • 3. Namba, T., & Shibata, T.:
    "Propagation of regulatory fluctuations induces coordinated switching of flagellar motors in chemotaxis signaling pathway of single bacteria."
    Journal of Theoretical Biology, 454, 367-375. (2018) 10.1016/j.jtbi.2018.06.023
  • 4. Yosuke Ogura, Fu-Lai Wen, Mustafa M. Sami, Tatsuo Shibata, and Shigeo Hayashi.:
    "A Switch-like Activation Relay of EGFR-ERK Signaling Regulates a Wave of Cellular Contractility for Epithelial Invagination"
    Developmental Cell, 46 (2), 162-172 (2018) 10.1016/j.devcel.2018.06.004
  • 5. Hiraiwa T, Kuranaga E, Shibata T.:
    "Wave Propagation of Junctional Remodeling in Collective Cell Movement of Epithelial Tissue: Numerical Simulation Study."
    Front Cell Dev Biol. ;5:66. 10.3389/fcell.2017.00066
  • 6. Wen F-L, Wang Y-C, Shibata T.:
    "Epithelial Folding Driven by Apical or Basal-Lateral Modulation: Geometric Features, Mechanical Inference, and Boundary Effects."
    Biophys J. 112(12):2683-2695. (2017) 10.1016/j.bpj.2017.05.012
  • 7. Sato K, Hiraiwa T, Maekawa E, Isomura A, Shibata T, Kuranaga E.:
    "Left-right asymmetric planar cell polarity and junction remodelling induce collective cell migration during epithelial morphogenesis"
    Nature Communication, 6 10074. (2015) 10.1038/ncomms10074
  • 8. Sato K, Hiraiwa T, Shibata T.:
    "Cell chirality induces collective cell migration in epithelial sheet"
    Physical Review Letters, 115, 188102 (2015) 10.1103/PhysRevLett.115.188102
  • 9. Nishikawa M, Hörning M, Ueda M, and Shibata T.:
    "Excitable signal transduction induces both spontaneous and directional cell asymmetries in the Phosphatidylinositol Lipid Signaling System for Eukaryotic Chemotaxis"
    Biophysical Journal 106: 723-734 (2014) 10.1016/j.bpj.2013.12.023
  • 10. Inomata H, Shibata T, Haraguchi T and Sasai Y.:
    "Scaling of dorsal-ventral patterning by embryo size-dependent degradation of Spemann's organizer signals"
    Cell 153: 1296-1311 (2013) 10.1016/j.cell.2013.05.004

研究成果(プレスリリース)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

柴田 達夫
チームリーダー

メンバー

仲矢 由紀子
研究員
TARAMA Sonja
研究員
多羅間 充輔
基礎科学特別研究員
早川 雅之
訪問研究員

採用情報

募集職種 応募締切
研究員募集(PB1901) ポストが決まり次第

お問い合わせ先

〒650-0047 兵庫県神戸市中央区港島南町2-2-3
Email: tatsuo.shibata [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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