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環境資源科学研究センター ケミカルバイオロジー・生合成研究チーム

チームリーダー 淡川 孝義（Ph.D.）

研究概要

淡川 孝義

当研究室では、ケミカルバイオロジー・生合成の手法を用いた活性化合物創出に関する研究を通じて、資源の減少、枯渇といった社会課題の解決に貢献し、環境資源科学研究を進展することを目指しています。活性化合物の生合成機構を解析し、微生物などのホストにおける物質生産システムを構築します。物質生産系における生合成経路、酵素機能の改変によって非天然型化合物を創出します。生理、生物化合物の作用機構を解析し、ケミカルバイオロジーにおける新規知見の取得を目指します。

研究主分野

  • 複合領域

研究関連分野

  • 化学
  • 農学
  • 生物学
  • 医歯薬学
  • ケミカルバイオロジー
  • 生物分子化学
  • 天然資源系薬学

キーワード

  • ケミカルバイオロジー
  • 生理活性化合物
  • 合成生物学
  • 生合成機構改変

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. Meng, L.-H., Awakawa, T., Li, X.-M., Quan, Z., Yang, .S-Q., Wang, B.-G., Abe, I.:
    "Discovery of (±)-Penindolenes Reveals an Unusual Indole Ring Cleavage Pathway Catalyzed by P450 Monooxygenase."
    Angew Chem Int Ed, 63, e202403963-e202403971(2024)
  • 2. Awakawa, T., Mori ,T., Barra L., Ahmed, Y., Ushimaru R., Gao, Y., Adachi, N., Senda, T., Terada, T., Tantillo, D. J., Abe, I.:
    "The structural basis of pyridoxal 5’-phosphate dependent β-NAD alkylating enzymes"
    Nature Catalysis, 7, 1099–1108 (2024)
  • 3. Zhou, L., Awakawa ,T., Ushimaru, R., Kanaida, M., Abe, I.:
    "Characterization of Aziridine-Forming α‑Ketoglutarate-Dependent Oxygenase in l‑Isovaline Biosynthesis"
    Org. Lett, 26, 724–727(2024)
  • 4. Awakawa, T., Mori, T., Ushimaru, R., Abe, I.:
    "Structure-based engineering of α-ketoglutarate dependent oxygenases in fungal meroterpenoid biosynthesis"
    Nat. Prod. Rep, 40, 46-61(2023)
  • 5. *Barra, L., Awakawa, T., Shirai, K., Hu, Z., Bashiri, G., Abe, I.:
    "β-NAD as a Building Block in Natural Product Biosynthesis."
    Nature (2021) 600, 754–758 (2021).
  • 6. *Li, X., Awakawa, T., Mori, T., Ling, M., Hu, D., Wu, B., Abe, I.:
    "Heterodimeric non-heme iron enzymes in fungal meroterpenoid biosynthesis."
    J. Am. Chem. Soc. 143, 21425-21432 (2021).
  • 7. *Bunno, R., Awakawa, T., Mori, T., Abe, I.:
    "Aziridine formation by a Fe(II)/α-ketoglutarate dependent oxygenase and 2-aminoisobutyrate biosynthesis in fungi"
    Angew. Chem. Int. Ed. 60, 15827-15831 (2021).
  • 8. *Song, X.-J., Lv, J.-M., Cao, Z.-Q., Huang, H.-Y., Chen, G.-D., Awakawa, T., Hu, D., Gao, H., Abe, I., Yao, X.-S.:
    "Extensive expanding the chemical diversity of fusidane-type antibiotics using a stochastic combinational strategy."
    Acta Pharm. Sinica B, 11, 1676-1685 (2021)
  • 9. *Kudo, Y., Awakawa, T., Du, Y.-L., Jordan, P. A., Creamer, K. E., Jensen, P. R., Linington, R. G., Ryan, K. S., Moore, B. S.:
    "Expansion of gamma-butyrolactone signaling molecule biosynthesis to phosphotriester natural products."
    ACS Chem. Biol. 15, 3253–3261 (2020).
  • 10. *Hu, Z., Awakawa, T., Ma, Z., Abe, I.:
    "Aminoacyl sulfonamide assembly in SB-203208 biosynthesis."
    Nature Commun. 10, Article number: 184 (2019).

研究成果（プレスリリース）

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

淡川 孝義
チームリーダー

メンバー

全 智揚
研究員
程 文姣（Cheng Wenjiao)
理研スチューデント・リサーチャーM

お問い合わせ先

〒351-0198 埼玉県和光市広沢2-1
ケミカルバイオロジー研究棟302号室
Email: takayoshi.awakawa＠riken.jp

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