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光量子工学研究センター画像情報処理研究チーム

チームリーダー横田秀夫（D.Eng.）

English Page

研究概要

当チームでは、理化学研究所オリジナルな画像処理技術の開発、多次元の計測技術の開発により、科学技術に貢献することを目的とします。特に、新規の情報処理技術、画像処理技術の研究開発により、理化学研究所内外の研究者に向けた、生命現象を定量化する新規ツールを確立することにより、数理生物学、バイオメディカルシミュレーション、医療診断・治療技術の向上に貢献します。

研究主分野

工学

研究関連分野

情報学

キーワード

多次元画像処理
多次元イメージング
バイオエンジニアリング
画像解析
医用工学

主要論文

1.A. Sakane, S. Yoshizawa, M. Nishimura, Y. Tsuchiya, N. Matsushita, K. Miyake, K. Horikawa, I. Imoto, C. Mizuguchi, H. Saito, T. Ueno, S. Matsushita, H. Haga, S. Deguchi, K. Mizuguchi, H. Yokota, T. Sasaki,
"Conformational plasticity of JRAB/MICAL-L2 provides 'law and order' in collective cell migration",
Article in Molecular Biology of the Cell, 27, 3095-3108, August 2016, DOI: 10.1091/mbc.E16-05-0332
2.N. Yamashita, M. Morita, W. R. Legant, B.-C. Chen, E. Betzig, H. Yokota, and Y. Mimori-Kiyosue, "Three-dimensional tracking of plus-tips by lattice light-sheet microscopy permits the quantification of microtubule growth trajectories within the mitotic apparatus",
J. Biomedical Optics, 20(10):101206:1-18, 2015.
3.T. Ijiri, S. Yoshizawa, H. Yokota, and T. Igarashi,
"Flower Modeling via X-ray Computed Tomography",
ACM Transactions on Graphics, Vol. 33(4):48:1-10, (Proc. of SIGGRAPH'14), 2014.
4.M. Morita, T. Tawara, M. Nishimura, S. Yoshizawa, B. Chou, I. Kuroki, T. Ijiri, Y. Tsujimura, R. Himeno, and H. Yokota,
"Communication Platform for Image Analysis and Sharing in Biology",
International Journal of Networking and Computing, Vol. 4, No. 2, pp. 369-391, 2014.
5.E. A. Susaki, K. Tainaka, D. Perrin, F. Kishino, T. Tawara, T. M. Watanabe, C. Yokoyama, H. Onoe, M. Eguchi, S. Yamaguchi, T. Abe, H. Kiyonari, Y. Shimizu, A. Miyawaki, H. Yokota, and H. R. Ueda,
"Whole-Brain Imaging with Single-Cell Resolution Using Chemical Cocktails and Computational Analysis", Cell, Vol. 157(3), pp. 726-739, 2014.
6.T. Ijiri, S. Yoshizawa, Y. Sato, M. Ito, and H. Yokota:
"Bilateral Hermite Radial Basis Functions for Contour-based Volume Segmentation"
Computer Graphics Forum (Proc. of EUROGRAPHICS’13), Vo. 32(2), pp. 123-132, 2013.
7.S. Hihara, C.-G. Pack, K. Kaizu, T. Tani, T. Hanafusa, T. Nozaki, S. Takemoto, T. Yoshimi, H. Yokota, N. Imamoto, Y. Sako, M. Kinjo, K. Takahashi, T. Nagai, and K. Maeshima:
"Local Nucleosome Dynamics Facilitate Chromatin Accessibility in Living Mammalian Cells"
Cell Reports, Vol. 2(6), pp. 1645-1656, 2012.
8.S. Yoshizawa, A. Belyaev, and H. Yokota:
"Shape and Image Interrogation with Curvature Extremalities"
Journal for Geometry and Graphics, Vol. 16, No. 1, pp. 81-95, 2012.
9.Y. Okamura-Oho, K. Shimokawa, S. Takemoto, A. Hirakiyama, S. Nakamura, Y. Tsujimura, M. Nishimura, T. Kasukawa, K. Masumoto, I. Nikaido, Y. Shigeyoshi, H. Ueda, G. Song, J. Gee, R. Himeno, and H. Yokota:
"Transcriptome tomography for brain analysis in the web-accessible anatomical space"
PLOS ONE, Vol. 7(9), e45373:1-10, 2012.
10.T. Ijiri, T. Ashihara, N. Umetani, T. Igarashi, R. Haraguchi, H. Yokota, and K. Nakazawa:
"A Kinematic Approach for Efficient and Robust Simulation of the Cardiac Beating Motion"
PLoS ONE, Vol. 7(5), pp. e36706:1-9, 2012