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放射光科学研究センター 生物系ビームライン基盤グループ

グループディレクター 山本 雅貴(Ph.D.)

研究概要

山本 雅貴 (Ph.D.)

SPring-8の高輝度放射光は、膜タンパク質等の高難度構造解析に大きな成果を上げています。生命機能の理解や創薬研究への応用を一段と強めていくため、生物系ビームライン基盤グループでは、タンパク質結晶構造解析や小角X線散乱(Bio-SAXS)など研究施設(SPring-8とSACLA)の高度化を進めます。さらに、これらの技術との組み合わせで構造生物学研究での相乗効果が期待できる低温電子顕微鏡(cryoEM)による構造解析も推進します。これらの最先端解析技術を組み合わせ、複雑な構造機能解析のための新しい構造生命科学に取組んでいます。

研究主分野

  • 生物学

研究関連分野

  • 化学
  • 工学
  • 総合生物
  • 農学
  • 医歯薬学
  • 構造生物化学
  • 生物物理学
  • 創薬化学

キーワード

  • 構造生命科学
  • 構造生物学
  • 相関構造解析
  • 創薬科学
  • 構造ダイナミクス研究

主要論文

  • 1.Hideki Shigematsu, Tsuyoshi Imasaki, Chihiro Doki, Takuya Sumi, Mari Aoki, Tomomi Uchikubo-Kamo, Ayako Sakamoto, Kiyotaka Tokuraku, Mikako Shirouzu, and Ryo Nitta.:
    “Structural insight into microtubule stabilization and kinesin inhibition by Tau family MAPs”
    Journal of Cell Biology 217 (12), 4155?4163 (2018)
  • 2.Masaki Yamamoto, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Kazuya Hasegawa, Go Ueno, Hideo Ago, Takashi Kumasaka.:
    “Protein microcrystallography using synchrotron radiation”
    IUCrJ 4 (5), 529-539 (2017)
  • 3.M Suga, F Akita, M Sugahara, M Kubo, Y Nakajima, T Nakane, K Yamashita, Y Umena, M Nakabayashi, T Yamane, T Nakano, M Suzuk, T Masuda, S Inoue, T Kimura, T Nomura, S Yonekura, L-J Yu, T Sakamoto, T Motomura, J-H Chen, Y Kato1, T Noguchi, K Tono, Y Joti, T Kameshima, T Hatsui, E Nango, R Tanaka, H Naitow, Y Matsuura, A Yamashita, M Yamamoto, O Nureki, M Yabashi, T Ishikawa, S Iwata, J-R Shen.:
    “Light-induced structural changes and the site of O=O bond formation in PSII
    caught by XFEL”
    Nature 543(7643):131-135 (2017)
  • 4.Shigeyuki Matsumoto, Nao Miyano, Seiki Baba, Jingling Liao, Takashi Kawamura, Chiemi Tsuda, AzusaTakeda A, Masaki Yamamoto, Takashi Kumasaka, Toru Kataoka, Fumi Shima.:
    “Molecular Mechanism for Conformational Dynamics of Ras?GTP Elucidated from In-Situ Structural Transition in Crystal”
    Scientific Report 6, 25931 (2016)
  • 5.Deng, D, Sun, PC, Yan, CY, Ke, M, Jiang, X, Xiong, L, Ren, WL, Hirata, K, Yamamoto, M, Fan, SL and Yan, N.:
    “Molecular basis of ligand recognition and transport by glucose transporters”
    Nature 526 (7573), 391-396.(2015)
  • 6.Tanabe, H, Fujii, Y, Okada-Iwabu, M, Iwabu, M, Nakamura, Y, Hosaka, T, Motoyama, K, Ikeda, M, Wakiyama, M, Terada, T, Ohsawa, N, Hato, M, Ogasawara, S, Hino, T, Murata, T, Iwata, S, Hirata, K, Kawano, Y, Yamamoto, M, Kimura-Someya, T, Shirouzu, M, Yamauchi, T, Kadowaki, T, and Yokoyama,S.:
    “Crystal structures of the human adiponectin receptors”
    Nature 520 (7547), 312-316 (2015)
  • 7.Shima, F, Yoshikawa, Y., Ye, M., Araki, M, Matsumoto, S., Liao, JL., Hu, LZ., Sugimoto, T ., Ijiri, Y., Takeda, A., Nishiyama, Y., Sato, C., Muraoka, S.,Tamura, A., Osoda, T., Tsuda, K., Miyakawa, T., Fukunishi, H., Shimada, J., Kumasaka, T., Yamamoto, M., Kataoka, T.:
    “In silico discovery of small-molecule Ras inhibitors that display antitumor activity by blocking the Ras-effector interaction”
    Proc. Nat. Acad. Sci the USA 110, 8182-8187 (2013)
  • 8.Janet L Smith, Robert F Fischetti and Masaki Yamamoto.:
    “Micro-crystallography comes of age”
    Current Opinion in Structural Biology 22, 602?612 (2012)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

山本 雅貴
グループディレクター

お問い合わせ先

〒679-5148 兵庫県佐用郡佐用町光都1-1-1 構造生物学研究棟
Tel: 0791-58-2839
Fax: 0791-58-2834

yamamoto [at] riken.jp
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