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放射光科学研究センター生物系ビームライン基盤グループ

グループディレクター山本雅貴（Ph.D.）

英語ページ

研究概要

SPring-8の高輝度放射光は、膜タンパク質等の高難度構造解析に大きな成果を上げています。生命機能の理解や創薬研究への応用を一段と強めていくため、生物系ビームライン基盤グループでは、タンパク質結晶構造解析や小角X線散乱（Bio-SAXS）など研究施設（SPring-8とSACLA）の高度化を進めます。さらに、これらの技術との組み合わせで構造生物学研究での相乗効果が期待できる低温電子顕微鏡（cryoEM）による構造解析も推進します。これらの最先端解析技術を組み合わせ、複雑な構造機能解析のための新しい構造生命科学に取組んでいます。

研究主分野

生物学

研究関連分野

化学
工学
総合生物
農学
医歯薬学
構造生物化学
生物物理学
創薬化学

キーワード

構造生命科学
構造生物学
相関構造解析
創薬科学
構造ダイナミクス研究

主要論文

1. Takizawa, N., Ogura, Y., Fujita, Y., Noda, T., Shigematsu, H., Hayashi, T., Kurokawa, K.:
"Local structural changes of the influenza A virus ribonucleoprotein complex by single mutations in the specific residues involved in efficient genome packaging"
Virology 531, 126-140, (2019)
2. Hanawa-Suetsugu, K., Itoh, Y., Ab Fatah, M., Nishimura, T., Takemura, K., Takeshita, K., Kubota, S., Miyazaki, N., Wan Mohamad Noor, WNI., Inaba, T., Nguyen, NTH., Hamada-Nakahara, S., Oono-Yakura, K., Tachikawa, M., Iwasaki, K., Kohda, D., Yamamoto, M., Kitao, A., Shimada, A. and Suetsugu, S.:
"Phagocytosis is mediated by two-dimensional assemblies of the F-BAR protein GAS7"
Nature Communications10, 4763 (2019)
3. Shigematsu, H., Imasaki, T., Doki, C., Sumi, T., Aoki, M., Uchikubo-Kamo, T., Sakamoto, A., Tokuraku, K., Shirouzu, M. and Nitta, R.:
"Structural insight into microtubule stabilization and kinesin inhibition by Tau family MAPs"
Journal of Cell Biology 217 (12), 4155-4163 (2018)
4. Yamamoto, M., Hirata, K., Yamashita, K., Hasegawa, K., Ueno, G., Ago, H., and Kumasaka, T.:
"Protein microcrystallography using synchrotron radiation"
IUCrJ 4 (5), 529-539 (2017)
5. M Suga, F Akita, M Sugahara, M Kubo, Y Nakajima, T Nakane, K Yamashita, Y Umena, M Nakabayashi, T Yamane, T Nakano, M Suzuk, T Masuda, S Inoue, T Kimura, T Nomura, S Yonekura, L-J Yu, T Sakamoto, T Motomura, J-H Chen, Y Kato1, T Noguchi, K Tono, Y Joti, T Kameshima, T Hatsui, E Nango, R Tanaka, H Naitow, Y Matsuura, A Yamashita, M Yamamoto, O Nureki, M Yabashi, T Ishikawa, S Iwata, J-R Shen.:
"Light-induced structural changes and the site of O=O bond formation in PSII caught by XFEL"
Nature 543(7643):131-135 (2017)
6. Matsumoto, S., Miyano, N., Baba, S., Liao, J., Kawamura, T., Tsuda, C., Takeda A,, Yamamoto, M., Kumasaka, T., Kataoka, T. and Shima, F.:
"Molecular Mechanism for Conformational Dynamics of Ras・GTP Elucidated from In-Situ Structural Transition in Crystal"
Scientific Report 6, 25931 (2016)
7. Deng, D, Sun, PC, Yan, CY, Ke, M, Jiang, X, Xiong, L, Ren, WL, Hirata, K, Yamamoto, M, Fan, SL and Yan, N.:
"Molecular basis of ligand recognition and transport by glucose transporters"
Nature 526 (7573), 391-396.(2015)
8. Tanabe, H, Fujii, Y, Okada-Iwabu, M, Iwabu, M, Nakamura, Y, Hosaka, T, Motoyama, K, Ikeda, M, Wakiyama, M, Terada, T, Ohsawa, N, Hato, M, Ogasawara, S, Hino, T, Murata, T, Iwata, S, Hirata, K, Kawano, Y, Yamamoto, M, Kimura-Someya, T, Shirouzu, M, Yamauchi, T, Kadowaki, T, and Yokoyama,S.:
"Crystal structures of the human adiponectin receptors"
Nature 520 (7547), 312-316 (2015)
9. Shima, F, Yoshikawa, Y., Ye, M., Araki, M, Matsumoto, S., Liao, JL., Hu, LZ., Sugimoto, T ., Ijiri, Y., Takeda, A., Nishiyama, Y., Sato, C., Muraoka, S.,Tamura, A., Osoda, T., Tsuda, K., Miyakawa, T., Fukunishi, H., Shimada, J., Kumasaka, T., Yamamoto, M., Kataoka, T.:
"In silico discovery of small-molecule Ras inhibitors that display antitumor activity by blocking the Ras-effector interaction"
Proc. Nat. Acad. Sci the USA 110, 8182-8187 (2013)
10. Smith, JL., Fischetti RF. and Yamamoto, M.:
"Micro-crystallography comes of age"
Current Opinion in Structural Biology 22, 602-612 (2012)