募集研究室

情報統合本部 先端データサイエンスプロジェクト 医療データ数理推論チーム
（チームリーダー: 川上 英良）

研究室の概要

当研究室では、オミクスデータを中心とした網羅的測定データや臨床検査データ、ヘルスケアデータ、および様々なIoTデバイスやウェアラブルセンサーによって得られる実社会の測定データを活用し、ヒトの健康/疾患状態の変化を理解・予測するための研究を行っています。実社会のデータは項目間の制御メカニズムが明確でないことが多く、特定の仮説やプロセスモデルに依存せずに状態を表現し、個別性を考慮した予測を行う必要があります。当研究室では、機械学習、ネットワーク、統計といった様々な数理科学を柔軟に応用し、健康/疾患状態の理解と一人一人の特性に基づいた予測モデルの確立を目指します。

当研究室は、2023年度よりAMED-CREST「免疫記憶の理解とその制御に資する医療シーズの創出」に分担研究者として採択され、免疫記憶の中心を担うCD4⁺ 組織常在性記憶T（Tissue resident memory T: T_RM）細胞が炎症組織において安定的に長期間維持される分子・細胞機構を明らかにすることを目標として研究を進めています。具体的な研究内容としては、

• 1.情報解析および深層学習を融合したアプローチを用いてCD4⁺ T_RM細胞の多階層プロファイリングと炎症組織におけるCD4⁺ T_RM細胞アトラクターの解明を行う。
• 2.CD4⁺ T_RM細胞アトラクターの維持に重要な細胞間相互作用ネットワークを明らかにし、ネットワークに介入することで慢性アレルギー性炎症を制御する方法を開発する。

ということを行っています。

募集職種、募集人数及び職務内容

募集職種、募集人数

研究員または特別研究員 1名

※採用時の職種は選考を通じて決定します。

職務内容

AMED-CREST「免疫記憶の理解とその制御に資する医療シーズの創出」の研究に関し、機械学習や数理科学の手法を応用して、主にscRNA-seq解析手法の開発とその応用を行っていただきます。具体的には

• 1.細胞サブセットの表面抗原同定アルゴリズムの開発と炎症組織特異的なCD4⁺ T_RM細胞サブセットへの応用
• 2.遺伝子制御ネットワークを推定手法の開発とCD4⁺ T_RM細胞におけるネットワーク推定
• 3.深層学習を用いたRNA velocity解析の開発とアトラクター解析への応用

が主要な研究テーマになります。

※本プロジェクトの終了予定日 は、2029年3月31日です。

職種としての職務内容は以下の通りです。

研究員

研究開発課題等を実施する。

特別研究員

上位職者の指導を受けて研究開発課題等を実施する。

契約期間中または契約更新時に業務変更がある場合は、上記職務内容の範囲で行います。

応募資格

• コミュニケーション能力があり、研究室内外の関係者と連携、協調して業務に従事できる方。
• 上記、「研究室の概要」に記載する研究内容や職務内容を遂行するために相応しい知識、経験、実績を有している方。また、興味を持って取り組める方。

必要なスキルや経験

テーマ実施にあたり、以下のスキルを有していること

• バイオインフォマティクス（主にscRNA-seq解析や転写制御ネットワーク解析）に関する実務経験や知識
• 機械学習や数理モデリングによるデータ解析の実務経験や知識
• 力学系やベクトル場など物理学の基本的な概念の理解と興味
• 新しい解析手法を、論文をサーベイし、導入・改良するスキル
• 解析結果を一般の人にもわかるように表現する能力
• 免疫学、分子生物学に関する学部レベルの知識
• 和文および英文での論文執筆スキル
• データを通じて現象への理解を深めると同時に、現実の問題解決に向けて貢献する視点と意欲

職種としての応募資格は以下のとおりです。

研究員

［職務内容］に関連する分野での博士号取得者で、研究計画立案から論文作成までの研究プロセスを自分で進められる方（博士号取得後5年以上経過していることを目安とするが、5年未満でも実力によって判断）。

特別研究員

［職務内容］に関連する分野での博士号取得者で、研究プロセスの遂行に上位職者の育成指導を必要とする方（目安として博士号取得後5年未満）。

※望ましいスキル

• 数理科学や他分野で用いられる多様な分析手法の知識やスキル
• 文献検索や情報収集、プログラミングに必要な情報検索スキル

勤務地

理化学研究所 情報統合本部 先端データサイエンスプロジェクト 医療データ数理推論チーム
神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22

在宅勤務制度あり。所定の手続きに従い在宅勤務が可能です。
業務上の必要が生じた場合、規程に基づき、勤務地の変更を命じることがあります。

待遇

• 1.単年度契約の任期制職員で、評価により採用日からプロジェクト終了日2029年3月31日を上限として再契約可能。
• 2.ただし、能力、契約満了時の業務量、勤務成績、勤務態度、所属しているセンター等若しくは研究室等又は従事しているプロジェクトの存続及び当研究所の経営の状況、予算状況等により、再契約可能期間については変更になる場合もあります。また、原則として70歳を超えての再契約は行いません。

原則として2ヶ月の試用期間有り。
給与は、経験、能力、実績に応じた年俸制で、固定給と変動給により構成されます。変動給額は経験、能力、実績に応じて毎年度決定されます。固定給月額は2024年4月1日時点で研究員として採用される場合は355,000円～426,500円、特別研究員として採用される場合は300,000円ですが、固定給額ならびに変動給額は、所内規程の改正によって変更となる場合があります。
裁量労働手当、通勤手当、住居手当の支給有り。社会保険の適用有り。
（採用時の年俸額の目安について）

研究員

裁量労働手当を含めた採用時の月額給与は55万円以上になります。

特別研究員

裁量労働手当を含めた採用時の月額給与は47万円以上になります。

理研共済会（互助組織）に要入会。
専門業務型裁量労働制適用で、1日7時間30分就業したものとみなされます。
休日は、土日、祝日、年末年始（12月29日-1月3日）、当研究所設立記念日。
休暇は、年次有給休暇（採用月に応じて最大年20日）、特別有給休暇（看護、介護など）、ワークライフバランス休暇（採用月に応じて最大年7日）など。
その他、産前産後休業、育児休業、介護休業制度等あり。
2024年4月より敷地内全面禁煙。
その他、当研究所規程による。

• ※理化学研究所は、男女共同参画及びダイバーシティ推進に積極的に取り組み、多様性豊かで活気ある研究環境の整備を進めています。公正な評価に基づき能力が同等と認められる場合は、女性を積極的に採用します。
• ※横浜キャンパス内には、託児施設「りけんキッズよこはま」を設置しています。詳細については、横浜事業所研究支援部人事課（厚生担当）kids-yk-hr [at] ml.riken.jpまでお問い合わせください。
• ※日本学生支援機構奨学金（2003年度までに大学院第一種奨学生に採用されている場合）の返還特別免除の対象、科学研究費補助金の申請資格有り

応募方法及び締切日

提出書類

• 1.履歴書（写真貼付）
  • メールアドレス、公募番号（RIH-2402）、希望職種を必ず明記してください。
  • なるべく、上記理研書式をご利用ください。
• 2.研究業績・業務実績一覧
• 3.これまでの研究概要、志望理由、今後の研究に対する抱負（A4サイズ2枚以内: 書式⾃由）
• 4.主要論文、紀要や特許取得等の業務実績にかかる記事のコピー。ただし3報を上限とする。
• 5.現職の所属長の推薦書 1通
  • 宛名は「情報統合本部 本部長殿」としてください。
  • 現職の所属長から推薦書をもらうのが困難な場合は、第三者による推薦書も受付可能です。
  • 推薦者のサインもしくは署名捺印したもの以外に、画像化したサインを張り付けたものやメールも受付可能です（ただし、その場合は推薦者の連絡先（名前、所属、職名、電話番号、メールアドレス）の記載必須）。
• 6.「EU一般データ保護規則（GDPR）」及び「個人データの取扱いに係る自然人の保護及び当該データの自由な移転に関する欧州議会及び欧州理事会規則（英国一般データ保護規則）」に基づく個人情報の取扱に関する同意書
  • ※欧州経済領域（EEA）もしくは英国に居住されている方のみ、上記の同意書をご提出ください。
    • EU一般データ保護規則（GDPR）の詳細は、下記をご参照ください。
      Data protection | European Commission（英語サイト）
    • 個人データの取扱いに係る自然人の保護及び当該データの自由な移転に関する欧州議会及び欧州理事会規則（英国一般データ保護規則）の詳細は、下記をご覧ください。
      Data Protection and the EU | Information Commissioner’s Office（英語サイト）

応募方法

推薦書以外の提出書類をPDFファイルで作成しZipファイルにまとめ、下記リンク先へアップロードしてください。

情報統合本部 先端データサイエンスプロジェクト 医療データ数理推論チーム 研究員等応募書類

• Zipファイルの名前には、公募番号RIH-2402（研究員等）、応募者名、連絡先メールアドレスを必ず含めてください。
• アップロード完了後、アップロードしたファイル名をadsp-recruit [at] ml.riken.jpまで、必ずお知らせください。

推薦書は、推薦者より直接ご提出いただきます。下記のリンク先へアップロードしてください。アップロード完了後、アップロードしたファイル名をadsp-recruit [at] ml.riken.jpまで、必ずお知らせください。

情報統合本部 先端データサイエンスプロジェクト 医療データ数理推論チーム 研究員等応募書類

• 7日以内に受領確認のメール返信がない場合は、応募書類が届いていない可能性がありますので、adsp-recruit [at] ml.riken.jpまでご連絡ください。

締切日

候補者決定次第締切

• ※提出いただいた書類は返却いたしませんので、ご了承ください。
• ※書類選考結果は、メールで通知いたします。

個人情報の取扱について

提出していただいた書類は、国立研究開発法人理化学研究所個人情報保護規程に則り厳重に管理し、当研究所における採用審査の用途に限り使用されます。
これらの個人情報は正当な理由なく第三者への開示、譲渡及び貸与することは一切ありません。

選考方法

書類選考後、選考通過者のみ面接選考を実施します。（リモートもしくは対面面接）

※面接選考に際して発生する旅費・宿泊費等は応募者負担となります。

着任時期

2024年5月1日、以降できるだけ早い時期（応相談）

お問い合わせ先

理化学研究所 横浜事業所
情報統合本部 先端データサイエンスプロジェクト 人事担当
Email: adsp-recruit [at] ml.riken.jp

• ※[at]は@に置き換えてください。
• ※お問い合わせはメールでお願い致します。