革新知能統合研究センター がん探索医療研究チーム
チームリーダー 浜本 隆二(Ph.D.)
研究概要

近年の遺伝子解析技術の発展は生物学以外でも様々な分野に影響を与え、医療分野では、現在クリニカルシークエンスデータを中心にしたPrecision Medicineの確立が推進されています。当チームは人工知能技術を用いてがんに関する多種多様なデータをマルチモーダルに解析することによりがんの本態を解明し、がんの診断・治療及び創薬へと発展させていきます。
研究テーマ:
- 機械学習・深層学習技術を用いたがん組織におけるヒストン修飾解析
- 機械学習・深層学習技術を用いた医療画像解析
- 機械学習・深層学習技術を用いたがんのオミックス解析
研究主分野
- 医歯薬学
研究関連分野
- 情報学
- 複合領域
- 総合生物
主要論文
「*」は、理研外のみでの成果です。
- 1.
Asada, K., Kaneko, S., Takasawa, K., Shiraishi, K., Shinkai, N., Shimada, Y., Takahashi, S., Machino, H., Kobayashi, K., Bolatkan, A., Komatsu, M., Yamada, M., Miyake, M., Watanabe, H., Tateishi, A., Mizuno, T., Okubo, Y., Mukai, M., Yoshida, T., Yoshida, Y., Horinouchi, H., Watanabe, S.I., Ohe, Y., Yatabe, Y., Kohno, T., Hamamoto, R.:
"Multi-omics and clustering analyses reveal the mechanisms underlying unmet needs for patients with lung adenocarcinoma and identify potential therapeutic targets"
Molecular Cancer 23, 182 (2024) - 2.
Kaneko, S., Takasawa, K., Asada, K., Shiraishi, K., Ikawa, N., Machino, H., Shinkai, N., Matsuda, M., Masuda, M., Adachi, S., Takahashi, S., Kobayashi, K., Kouno, N., Bolatkan, A., Komatsu, M., Yamada, M., Miyake, M., Watanabe, H., Tateishi, A., Mizuno, T., Okubo, Y., Mukai, M., Yoshida, T., Yoshida, Y., Horinouchi, H., Watanabe, S.I., Ohe, Y., Yatabe, Y., Saloura, V., Kohno, T., Hamamoto, R.:
"Mechanism of ERBB2 gene overexpression by the formation of super-enhancer with genomic structural abnormalities in lung adenocarcinoma without clinically actionable genetic alterations"
Molecular Cancer 23, 126 (2024) - 3.
Mochizuki, A., Shiraishi, K., Honda, T., Higashiyama, R.I., Sunami, K., Matsuda, M., Shimada, Y., Miyazaki, Y., Yoshida, Y., Watanabe, S.I., Yatabe, Y., Hamamoto, R., Kohno, T.:
"Passive smoking-induced mutagenesis as a promoter of lung carcinogenesis"
Journal of Thoracic Oncology 19, 984-994 (2024) - 4.
Kobayashi, K., Gu, L., Hataya, R., Mizuno, T., Miyake, M., Watanabe, H., Takahashi, M., Takamizawa, Y., Yoshida, Y., Nakamura, S., Kouno, N., Bolatkan, A., Kurose, Y., Harada, T., Hamamoto, R.:
"Sketch-based semantic retrieval of medical images"
Medical Image Analysis 92, 103060 (2024) - 5.
Igarashi, T., Mazevet, M., Yasuhara, T., Yano, K., Mochizuki, A., Nishino, M., Yoshida, T., Yoshida, Y., Takamatsu, N., Yoshimi, A., Shiraishi, K., Horinouchi, H., Kohno, T., Hamamoto, R., Adachi, J., Zou, L., Shiotani, B.:
"An ATR-PrimPol pathway confers tolerance to oncogenic KRAS-induced and heterochromatin-associated replication stress"
Nature Communications 14, 4991 (2023) - 6.
Kobayashi, K., Hataya, R., Kurose, Y., Miyake, M., Takahashi, M., Nakagawa, A., Harada, T., Hamamoto, R.:
"Decomposing normal and abnormal features of medical images for content-based image retrieval of glioma imaging"
Medical Image Analysis 74, 102227 (2021) - 7.
Matsuno, Y., Atsumi, Y., Shimizu, A., Katayama, K., Fujimori, H., Hyodo, M., Minakawa, Y., Nakatsu, Y., Kaneko, S., Hamamoto, R., Shimamura, T., Miyano, S., Tsuzuki, T., Hanaoka, F., Yoshioka, K.I.:
"Replication stress triggers microsatellite destabilization and hypermutation leading to clonal expansion in vitro"
Nature Communications 10, 3925 (2019) - 8.
*Hamamoto, R., Saloura, V., Nakamura, Y.:
"Critical roles of non-histone protein lysine methylation in human tumorigenesis"
Nature Reviews Cancer 15, 110-124 (2015) - 9.
*Sone, K., Piao, L., Nakakido, M., Ueda, K., Jenuwein, T., Nakamura, Y., Hamamoto, R.:
"Critical role of lysine 134 methylation on histone H2AX for γ-H2AX production and DNA repair"
Nature Communications 10, 3925 (2019) - 10.
*Cho, H.S., Shimazu, T., Toyokawa, G., Daigo, Y., Maehara, Y., Hayami, S., Ito, A., Masuda, K., Ikawa, N., Field, H.I., Tsuchiya, E., Ohnuma, S., Ponder, B.A.J., Yoshida M., Nakamura, Y., Hamamoto, R.:
"Enhanced HSP70 lysine methylation promotes proliferation of cancer cells through activation of aurora kinase B"
Nature Communications 3, 1072 (2012)
研究成果(プレスリリース)
2024年9月13日
マルチオミックス解析により、肺腺がんの分子メカニズムを解明2024年3月5日
機械学習技術を活用した網羅的DNAメチル化データの新規解析手法を開発2023年10月4日
卵巣がんの発がんメカニズムを解明2022年3月22日
説明可能AIを用いた超音波画像診断支援2022年2月7日
卵巣がんの新しい治療標的を同定2019年7月26日
AIを用いた超音波検査における影の自動検出2018年9月18日
AIを用いた胎児心臓超音波スクリーニング
刊行物
関連リンク
メンバーリスト
主宰者
- 浜本 隆二
- チームリーダー
メンバー
- 小松 正明
- 副チームリーダー
- 浅田 健
- 上級研究員
- 髙橋 慧
- 上級研究員
- 町野 英徳
- 研究員
- BOLATKAN Amina
- 特別研究員
- 松本 大海
- 特別研究員
- 新海 典夫
- 技師
- 近藤 裕子
- テクニカルスタッフⅠ
- 山田 滋美
- テクニカルスタッフⅠ
- 小林 和馬
- 客員研究員
- 坂口 雄亮
- 研究パートタイマーⅠ
- 金子 修三
- 客員研究員
- 山田 真善
- 客員研究員
採用情報
募集職種 | 応募締切 |
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お問い合わせ先
東京都中央区築地5-1-1 新研究棟10階
Email: ryuji.hamamoto@riken.jp