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革新知能統合研究センターデータ駆動型生物医科学チーム

チームリーダー竹内一郎（D.Eng.）

English Page

研究概要

生物科学や医療科学の分野では、計測機器が飛躍的に発展したことで研究対象に関する大規模データを取得できるようになりました。このような大規模データを利用して科学的発見を目指す試みは、理論、実験、計算に次ぐ第4の科学的アプローチと呼ばれ、有望視されています。人工知能や機械学習を用いて科学研究のデータを分析することで、研究者の知識や経験のみからは想起できないような仮説を生成することができます。私達のチームでは、人工知能による科学的発見を行うための情報数理的な基盤技術を研究し、その成果を生物科学と医療科学において実証していきます。

研究テーマ:

データ科学

研究主分野

コンピューター科学

研究関連分野

材料科学
生物学 & 生化学
分子生物 & 遺伝学
臨床医学
数学

主要論文

1. Shiraishi T., Miwa D., Katsuoka T., Duy V.N.L., Taji K., Takeuchi I.:
"Statistical Test for Attention Maps in Vision Transformers"
International Conference on Machine Learning (2024)
2. Duy V.N.L., Lin H.T., Takeuchi I.:
"CAD-DA: Controllable Anomaly Detection after Domain Adaptation by Statistical Inference"
AI&Statistics (2024)
3. Goto K., Tamehiro N., Yoshida T., Hanada H., Sakuma T., Adachi R., Kondo K., Takeuchi I.:
"Novel Machine Learning Method AllerStat Identifies Statistically Significant Allergen-Specific Patterns in Protein Sequences."
Journal of Biological Chemistry. Vol.299-6, 104733 (2023)
4. Hashimoto N., Takagi Y., Masuda H., Miyoshi H., Kohno K., Nagaishi M., Sato K., Takeuchi M., Furuta T., Kawamoto K., Yamada K., Moritsubo M., Inoue K., Shimasaki Y., Ogura Y., Imamoto T., Mishina T., Tanaka K., Kawaguchi Y., Nakamura S., Ohshima K., Hontani H., Takeuchi I.:
"Case-based Similar Image Retrieval for Weakly Annotated Large Histopathological Images of Malignant Lymphoma Using Deep Metric Learning."
Medical Image Analysis. Vol.85 (2023)
5. Kato H., Hanada H., Takeuchi I.:
"Safe RuleFit: Learning Optimal Sparse Rule Model by Meta Safe Screening."
IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. Vol.45-2, pp.2330-2343 (2023)
6. Miwa D., Duy V.N.L., Takeuchi I.:
"Valid P-Value for Deep Learning-driven Salient Region"
The International Conference on Learning Representation (2023)
7. Ndiaye E., Takeuchi I.:
"Root-finding Approaches for Computing Conformal Prediction Set"
Machine Learning (2022)
8. Duy V.N.L., Takeuchi I.:
"More Powerful Conditional Selective Inference for Generalized Lasso by Parametric Programming."
Journal of Machine Learning Research. Vol.23(300) (2022)
9. Duy V.N.L., Iwazaki S., Takeuchi I.:
"Quantifying Statistical Significance of Neural Network-based Image Segmentation by Selective Inference."
Neural Information Processing Systems (2022)
10. Inatsu Y., Takeno S., Karasuyama M., Takeuchi I.:
"Bayesian Optimization for Distributionally Robust Chance-constrained Problem."
International Conference on Machine Learning (2022)