当サイトは、Javascriptを使用しています。Javascriptを無効にして閲覧した場合、コンテンツが正常に動作しないおそれやページが表示されない場合があります。当サイトをご利用の際には、Javascriptを有効にして閲覧下さい。

生命医科学研究センター翻訳構造解析研究チーム

チームディレクター伊藤拓宏（Ph.D.）

English Page

研究概要

タンパク質の翻訳は、全ての細胞が持つ最も基本的な機能の一つです。当研究室では、翻訳に関わる分子群の立体構造解析を、主にX線結晶構造解析法とクライオ電子顕微鏡による単粒子解析法を用いて行います。特に複数の真核生物由来の翻訳関連因子やリボソームにより構成される巨大複合体の立体構造解析に重点を置き、複雑な真核生物の翻訳機構の解明を目指します。決定した翻訳関連因子の立体構造を出発点としてそれらに結合する機能性小分子を探索し、タンパク質合成の制御を基とする汎用性の高い薬剤の可能性を探ります。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

生物学

キーワード

X線結晶構造解析
NMR
電子顕微鏡
翻訳

主要論文

1. Tanaka, M., Yokoyama, T., Saito, H., Nishimoto, M., Tsuda, K., Sotta, N., Shigematsu, H., Shirouzu, M., Iwasaki, S., Ito, T. and Fujiwara, T.:
“Boric acid intercepts 80S ribosome migration from AUG-stop by stabilizing eRF1”
Nature Chemical Biology 20, 605-614 (2024) doi: 10.1038/s41589-023-01513-0
2. Kashiwagi, K., Shichino, Y., Osaki, T., Sakamoto, A., Nishimoto, M., Takahashi, M., Mito, M., Weber, F., Ikeuchi, Y., Iwasaki, S., Ito, T.:
"eIF2B-capturing viral protein NSs suppresses the integrated stress response"
Nature Communications 12, 7102 (2021) doi: 10.1038/s41467-021-27337-x
3. Zyryanova, AF., Kashiwagi, K., Rato, C., Harding, HP., Crespillo-Casado, A., Perera, LA., Sakamoto, A., Nishimoto, M., Yonemochi, M., Shirouzu, M., Ito, T., Ron, D.:
"ISRIB blunts the integrated stress response by allosterically antagonising the inhibitory effect of phosphorylated eIF2 on eIF2B"
Molecular Cell 81, 88-103 (2021) doi: 10.1016/j.molcel.2020.10.031
4. Yokoyama, T., Machida, K., Iwasaki, W., Shigeta, T., Nishimoto, M., Takahashi, M., Sakamoto, A., Yonemochi, M., Harada, Y., Shigematsu, H., Shirouzu, M., Tadakuma, H., Imataka, H., Ito, T.:
"HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome"
Molecular Cell 74, 1205-1214 (2019) doi: 10.1016/j.molcel.2019.04.022
5. Kashiwagi, K., Yokoyama, T., Nishimoto, M., Takahashi, M., Sakamoto, A., Yonemochi, M., Shirouzu, M., Ito, T.:
"Structural basis for eIF2B inhibition in integrated stress response"
Science 364, 495-499 (2019) doi: 10.1126/science.aaw4104
6. Iwasaki, S., Iwasaki, W., Takahashi, M., Sakamoto, A., Watanabe, C., Shichino, Y., Floor, S.N., Fujiwara, K., Mito, M., Dodo, K., Sodeoka, M., Imataka, H., Honma, T., Fukuzawa, K., Ito, T., Ingolia, N.T.:
"The translation inhibitor Rocaglamide targets a bimolecular cavity between eIF4A and polypurine RNA"
Molecular Cell 73, 738-748 (2018) doi: 10.1016/j.molcel.2018.11.026
7. Kashiwagi, K., Takahashi, M., Nishimoto, M., Hiyama, T.B., Higo, T., Umehara, T., Sakamoto, K., Ito, T. and Yokoyama, S.:
"Crystal structure of eukaryotic translation initiation factor 2B"
Nature 531, 122-125 (2016) doi: 10.1038/nature16991
8. Ito, T., Masuda, I., Yoshida, K., Goto-Ito, S., Sekine, S., Suh, S.W., Hou, Y.-M. and Yokoyama, S.:
"Structural Basis for methyl-donor-dependent and sequence-specific binding to tRNA substrates by knotted methyltransferase TrmD"
Proc Natl Acad Sci U S A. 112, E4197-E4205 (2015) doi: 10.1073/pnas.1422981112
9. Ito, T., Yokoyama, S.:
"Two enzymes bound to one transfer RNA assume alternative conformations for consecutive reactions"
Nature 467, 612-616 (2010) doi: 10.1038/nature09411
10. Goto-Ito, S., Ito, T., Kuratani, M., Bessho, Y., Yokoyama, S.:
"Tertiary structure checkpoint at anticodon loop modification in tRNA functional maturation"
Nature Structural & Molecular Biology 16, 1109-1115 (2009) doi: 10.1038/nsmb.1653