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生命機能科学研究センター 翻訳構造解析研究チーム

チームリーダー 伊藤 拓宏(Ph.D.)

研究概要

伊藤 拓宏 (Ph.D.)

タンパク質の翻訳は、全ての細胞が持つ最も基本的な機能の一つです。当研究室では、翻訳に関わる分子群の立体構造解析を、主にX線結晶構造解析法とクライオ電子顕微鏡による単粒子解析法を用いて行います。特に複数の真核生物由来の翻訳関連因子やリボソームにより構成される巨大複合体の立体構造解析に重点を置き、複雑な真核生物の翻訳機構の解明を目指します。決定した翻訳関連因子の立体構造を出発点としてそれらに結合する機能性小分子を探索し、タンパク質合成の制御を基とする汎用性の高い薬剤の可能性を探ります。

研究主分野

  • 総合生物

研究関連分野

  • 生物学

キーワード

  • X線結晶構造解析
  • NMR
  • 電子顕微鏡
  • 翻訳

主要論文

  • 1. Zyryanova, AF., Kashiwagi, K., Rato, C., Harding, HP., Crespillo-Casado, A., Perera, LA., Sakamoto, A., Nishimoto, M., Yonemochi, M., Shirouzu, M., Ito, T., Ron, D.:
    "ISRIB blunts the integrated stress response by allosterically antagonising the inhibitory effect of phosphorylated eIF2 on eIF2B"
    Molecular Cell 81. 88-103, (2021) doi: 10.1016/j.molcel.2020.10.031
  • 2. Yokoyama, T., Machida, K., Iwasaki, W., Shigeta, T., Nishimoto, M., Takahashi, M., Sakamoto, A., Yonemochi, M., Harada, Y., Shigematsu, H., Shirouzu, M., Tadakuma, H., Imataka, H., Ito, T.:
    "HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome"
    Molecular cell. 74 1205-1214. (2019) doi: 10.1016/j.molcel.2019.04.022
  • 3. Kashiwagi, K., Yokoyama, T., Nishimoto, M., Takahashi, M., Sakamoto, A., Yonemochi, M., Shirouzu, M., Ito, T.:
    "Structural basis for eIF2B inhibition in integrated stress response"
    Science. 364 495-499. (2019) doi: 10.1126/science.aaw4104
  • 4. Iwasaki, S., Iwasaki, W., Takahashi, M., Sakamoto, A., Watanabe, C., Shichino, Y., Floor, S.N., Fujiwara, K., Mito, M., Dodo, K., Sodeoka, M., Imataka, H., Honma, T., Fukuzawa, K., Ito, T., Ingolia, N.T.:
    "The translation inhibitor Rocaglamide targets a bimolecular cavity between eIF4A and polypurine RNA"
    Molecular Cell. 73 738-748. (2018) doi: 10.1016/j.molcel.2018.11.026
  • 5. Kashiwagi, K., Takahashi, M., Nishimoto, M., Hiyama, T.B., Higo, T., Umehara, T., Sakamoto, K., Ito, T. and Yokoyama, S.:
    "Crystal structure of eukaryotic translation initiation factor 2B"
    Nature. 531 122-125. (2016) doi: 10.1038/nature16991
  • 6. Ito, T., Masuda, I., Yoshida, K., Goto-Ito, S., Sekine, S., Suh, S.W., Hou, Y.-M. and Yokoyama, S.:
    "Structural Basis for methyl-donor-dependent and sequence-specific binding to tRNA substrates by knotted methyltransferase TrmD"
    Proc Natl Acad Sci U S A. 112 E4197-E4205. (2015) doi: 10.1073/pnas.1422981112
  • 7. Ito, T., Yokoyama, S.:
    "Two enzymes bound to one transfer RNA assume alternative conformations for consecutive reactions"
    Nature 467. 612-616 (2010) doi: 10.1038/nature09411
  • 8. Goto-Ito, S., Ito, T., Kuratani, M., Bessho, Y., Yokoyama, S.:
    "Tertiary structure checkpoint at anticodon loop modification in tRNA functional maturation"
    Nature Structural & Molecular Biology 16. 1109-1115 (2009) doi: 10.1038/nsmb.1653

研究成果(プレスリリース)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

伊藤 拓宏
チームリーダー

メンバー

岩崎 わかな
専任研究員
柏木 一宏
研究員
西本 まどか
技師
髙橋 真梨
技師
坂本 恵香
技師

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22 横浜事業所 西研究棟
Tel: 045-503-9204
Fax: 045-503-9460
Email: takuhiro.ito [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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