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環境資源科学研究センターバイオ生産情報研究チーム

チームリーダー持田恵一（Ph.D.）

English Page

研究概要

草本系のセルロースバイオマスの量的・質的な生産性を向上させた植物の開発を目指しています。草本モデル植物を用いて植物の高生産性、環境ストレス耐性などの有用形質を付与するための遺伝子探索を進めます。また、バイオマス資源用植物への応用研究を大学や研究機関との連携研究で推進します。

研究主分野

生物学

研究関連分野

情報学
農学

キーワード

ゲノム
バイオインフォマティクス
植物バイオマスの増産
草本植物
ゲノムの倍数性

主要論文

1. Hori K., Saisho D., Nagata K., Nonoue Y., Uehara-Yamaguchi Y., Kanatani A., Shu K., Hirayama T., Yonemaru J., Fukuoka S., Mochida K.:
"Genetic Elucidation for Response of Flowering Time to Ambient Temperatures in Asian Rice Cultivars."
International Journal of Molecular Sciences 22; 3, 1024. (2021)
2. Maryam Nasr Esfahani, Komaki Inoue, Kien Huu Nguyen, Ha Duc Chu, Yasuko Watanabe, Asaka Kanatani, David J Burritt, Keiichi Mochida, Lam-Son Phan Tran.:
"Phosphate or nitrate imbalance induces stronger molecular responses than combined nutrient deprivation in roots and leaves of chickpea plants."
Plant, cell & environment 44; 2, 574. (2020)
3. Sobhy S H Abdelsalam, Yusuke Kouzai, Megumi Watanabe, Komaki Inoue, Hidenori Matsui, Mikihiro Yamamoto, Yuki Ichinose, Kazuhiro Toyoda, Seiji Tsuge, Keiichi Mochida, Yoshiteru Noutoshi.:
"Identification of effector candidate genes of Rhizoctonia solani AG-1 IA expressed during infection in Brachypodium distachyon."
Scientific reports 10;10(1):14889. (2020)
4. Yusuke Kouzai, Minami Shimizu, Komaki Inoue, Yukiko Uehara-Yamaguchi, Kotaro Takahagi, Risa Nakayama, Takakazu Matsuura, Izumi C Mori, Takashi Hirayama, Sobhy S H Abdelsalam, Yoshiteru Noutoshi, Keiichi Mochida.:
"BdWRKY38 is required for the incompatible interaction of Brachypodium distachyon with the necrotrophic fungus Rhizoctonia solani."
The Plant Journal : for cell and molecular biology 104; 4, 995. (2020)
5. Inoue K., Takahagi K., Kouzai Y., Koda S., Shimizu M., Uehara-Yamaguchi Y., Nakayama R., Kita T., Onda Y., Nomura T., Matsui H., Nagaki K., Nishii R., Mochida K.:
"Parental legacy and regulatory novelty in Brachypodium diurnal transcriptomes accompanying their polyploidy."
NAR Genomics and Bioinformatics 2; 3, (2020)
6. Keiichi Mochida, Ryuei Nishii, Takashi Hirayama.:
"Decoding Plant-Environment Interactions That Influence Crop Agronomic Traits."
Plant & cell physiology 2; 3, 1498. (2020)
7. Keiichi Mochida, Alexander E Lipka, Takashi Hirayama.:
"Exploration of Life-Course Factors Influencing Phenotypic Outcomes in Crops."
Plant & cell physiology 61; 8, 1381. (2020)
8. Hirayama T., Saisho D., Matsuura T., Okada S., Takahagi K., Kanatani A., Ito J., Tsuji H., Ikeda Y., Mochida K.:
"Life-Course Monitoring of Endogenous Phytohormone Levels under Field Conditions Reveals Diversity of Physiological States among Barley Accessions."
Plant & cell physiology 61; 8, 1438. (2020)
9. Ukai Y., Inoue K., Kamada M., Teramura H., Yanagisawa S., Kitazaki K., Shoji K., Goto F., Mochida K., Yoshihara T., Shimada H.:
"De novo transcriptome analysis reveals an unperturbed transcriptome under high cadmium conditions in the Cd-hypertolerant fern Athyrium yokoscense."
Genes & genetic systems 95; 2, 65. (2020)
10. Sato K., Ishii M., Takahagi K., Inoue K., Shimizu M., Uehara-Yamaguchi Y., Nishii R., Mochida K.:
"Genetic Factors Associated with Heading Responses Revealed by Field Evaluation of 274 Barley Accessions for 20 Seasons."
iScience 23; 6, 101146. (2020)