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生命医科学研究センター 消化管恒常性研究チーム

チームリーダー 本田 賢也(M.D., Ph.D)

研究概要

本田 賢也 (M.D., Ph.D)

消化管内には細菌をはじめとした微生物群集が形成していて、それをマイクロバイオータとよんでいます。マイクロバイオータが産生する無数の代謝産物は、宿主の神経系、免疫系、代謝系などの様々な生理機能に影響することが知られています。私たちの研究室では、宿主の生理機能に強く影響する腸内細菌およびその代謝産物を同定し、その仕組みを明らかにすることを目的としています。長期的には、腸内細菌やその代謝産物を人為的に操作することを可能とし、健康・長寿を実現、または、パーキンソン病やアルツハイマー病などの神経疾患、炎症性腸疾患・代謝疾患・多剤耐性細菌感染などの疾患を制御する方法を確立することを目指します。

研究主分野

  • 医歯薬学

研究関連分野

  • 化学
  • 総合生物
  • 生物学

キーワード

  • 腸内細菌
  • 細菌由来代謝産物
  • 健康・長寿
  • 腸管および中枢神経系
  • 粘膜免疫

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. Furuichi M, Kawaguchi T, Pust MM, Yasuma-Mitobe K, Plichta DR, Hasegawa N, Ohya T, Bhattarai SK, Sasajima S, Aoto Y, Tuganbaev T, Yaginuma M, Ueda M, Okahashi N, Amafuji K, Kiridoshi Y, Sugita K, Stražar M, Avila-Pacheco J, Pierce K, Clish CB, Skelly AN, Hattori M, Nakamoto N, Caballero S, Norman JM, Olle B, Tanoue T, Suda W, Arita M, Bucci V, Atarashi K, Xavier RJ, Honda K:
    "Commensal consortia decolonize Enterobacteriaceae via ecological control."
    Nature, 633:878-886(2024).
  • 2. Johansen J, Atarashi K, Arai Y, Hirose N, Sørensen SJ, Vatanen T, Knip M, Honda K, Xavier RJ, Rasmussen S, Plichta DR:
    "Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan"
    Nat Microbiol., 8:1064-1078(2023).
  • 3. Sato Y, Atarashi K, Plichta DR, Arai Y, Sasajima S, Kearney SM, Suda W, Takeshita K, Sasaki T, Okamoto S, Skelly AN, Okamura Y, Vlamakis H, Li Y, Tanoue T, Takei H, Nittono H, Narushima S, Irie J, Itoh H, Moriya K, Sugiura Y, Suematsu M, Moritoki N, Shibata S, Littman DR, Fischbach MA, Uwamino Y, Inoue T, Honda A, Hattori M, Murai T, Xavier RJ, Hirose N, Honda K:
    "Novel bile acid biosynthetic pathways are enriched in the microbiome of centenarians."
    Nature, 599:458-464(2021).
  • 4. Li Y, Watanabe E, Kawashima Y, Plichta DR, Wang Z, Ujike M, Ang QY, Wu R, Furuichi M, Takeshita K, Yoshida K, Nishiyama K, Kearney SM, Suda W, Hattori M, Sasajima S, Matsunaga T, Zhang X, Watanabe K, Fujishiro J, Norman JM, Olle B, Matsuyama S, Namkoong H, Uwamino Y, Ishii M, Fukunaga K, Hasegawa N, Ohara O, Xavier RJ, Atarashi K, Honda K:
    "Identification of trypsin-degrading commensals in the large intestine."
    Nature, 609:582-589(2022).
  • 5. Ivanov II, Tuganbaev T, Skelly AN, Honda K:
    "T Cell Responses to the Microbiota."
    Annu Rev Immunol., 40:559-587(2022).
  • 6. Tanoue T, Morita S, Plichta DR, Skelly AN, Suda W, Sugiura Y, Narushima S, Vlamakis H, Motoo I, Sugita K, Shiota A, Takeshita K, Yasuma-Mitobe K, Riethmacher D, Kaisho T, Norman JM, Mucida D, Suematsu M, Yaguchi T, Bucci V, Inoue T, Kawakami Y, Olle B, Roberts B, Hattori M, Xavier RJ, Atarashi K, Honda K:
    "A defined commensal consortium elicits CD8 T cells and anti-cancer immunity."
    Nature, 565: 600-605(2019).
  • 7. Atarashi K, Suda W, Luo C, Kawaguchi T, Motoo I, Narushima S, Kiguchi Y, Yasuma K, Watanabe E, Tanoue T, Thaiss CA, Sato M, Toyooka K, Said HS, Yamagami H, Rice SA, Gevers D, Johnson RC, Segre JA, Chen K, Kolls JK, Elinav E, Morita H, Xavier RJ, Hattori M, Honda K:
    "Ectopic colonization of oral bacteria in the intestine drives TH1 cell induction and inflammation"
    Science, 358: 359-365(2017).
  • 8. Atarashi K, Tanoue T, Ando M, Kamada N, Nagano Y, Narushima S, Suda W, Imaoka A, Setoyama H, Nagamori T, Ishikawa E, Shima T, Hara T, Kado S, Jinnohara T, Ohno H, Kondo T, Toyooka K, Watanabe E, Yokoyama S, Tokoro S, Mori H, Noguchi Y, Morita H, Ivanov II, Sugiyama T, Nuñez G, Camp JG, Hattori M, Umesaki Y, Honda K:
    "Th17 Cell Induction by Adhesion of Microbes to Intestinal Epithelial Cells."
    Cell, 163:367-380 (2015).
  • 9. * Atarashi K, Tanoue T, Oshima K, Suda W, Nagano Y, Nishikawa H, Fukuda S, Saito T, Narushima S, Hase K, Kim S, Fritz JV, Wilmes P, Ueha S, Matsushima K, Ohno H, Olle B, Sakaguchi S, Taniguchi T, Morita H, Hattori M, Honda K:
    "Treg induction by a rationally selected mixture of Clostridia strains from the human microbiota."
    Nature, 500:232-236 (2013).
  • 10. * Ivanov II, Atarashi K, Manel N, Brodie EL, Shima T, Karaoz U, Wei D, Goldfarb KC, Santee CA, Lynch SV, Tanoue T, Imaoka A, Itoh K, Takeda K, Umesaki Y, Honda K, Littman DR:
    "Induction of intestinal Th17 cells by segmented filamentous bacteria."
    Cell, 139:485-98 (2009).

研究成果(プレスリリース)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

本田 賢也
チームリーダー

メンバー

TIWARI Prabha
客員主管研究員
FANG Hui
特別研究員
新 幸二
客員主管研究員
田之上 大
客員主管研究員
竹下 梢
客員主管研究員
寺嶋 秀騎
客員研究員
古市 宗弘
客員研究員
TUGANBAEV Timur
客員研究員
河西 咲綺
テクニカルスタッフⅡ
ZHANG Xiaoxi
研修生
吉田 宏司
研修生

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22 北研究棟 4F
Tel: 045-503-9682
Email: kenya.honda@riken.jp

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