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情報システム本部 データ知識化開発ユニット

開発ユニットリーダー 小林 紀郎(D.Eng.)

研究概要

小林 紀郎 (D.Eng.)

理研が産出する多種多様な研究データの整理、統合およびデータ利活用促進に資する情報基盤実現に関する技術開発を推進します。具体的には、オープンサイエンス推進のための基盤技術開発を行いつつ、集積された研究データに付与するメタデータに関する研究開発、および研究室に対しメタデータ技術やツール類の提供・支援を行います。さらには理研の研究者と連携して、自然科学の分野を問わずメタデータ駆動型オープンサイエンスを実践することで、データ科学時代を世界的にリードし、科学技術イノベーションの創出に貢献します。

研究主分野

  • 情報学

研究関連分野

  • 工学
  • 化学
  • 複合領域
  • 総合理工
  • 数物系科学
  • 知能情報学
  • ウェブ情報学・サービス情報学
  • 計算科学

キーワード

  • オープンサイエンス
  • セマンティックウエブ
  • オントロジー
  • リンクト・オープン・データ
  • データ利活用基盤

主要論文

  • 1. Kobayashi, N., Kume, S., Lenz, K., and Masuya, H.:
    "RIKEN MetaDatabase: A Database Platform for Health Care and Life Sciences as a Microcosm of Linked Open Data Cloud" International Journal on Semantic Web and Information Systems 14(1), 140-164 (2018).
  • 2. Morita, M., Shimokawa, K., Nishimura. M., Nakamura, S., Tsujimura, Y., Takemoto, S., Tawara, T., Yokota, H., Wemler, S., Miyamoto, D., Iken, H., Sato, A., Furuichi, T., Kobayashi, N., Okumura, Y., Yamaguchi, Y., and Okamura-Oho, Y.:
    "ViBrism DB: an interactive search and viewer platform for 2D/3D anatomical images of gene expression and co-expression networks" Nucleic Acids Research 47(D1), D859-D866 (2019).
  • 3. Yamaguchi, A., Kozaki, K., Yamamoto, Y., and Kobayashi, N.:
    "Semantic Graph Analysis for Federated LOD Surfing in the Life Sciences" The 7th Joint International Semantic Technology Conference (JIST). Special Track: Semantic Processing for Knowledge Graphs, LNCS 10675, 268-276 (2017).
  • 4. Kume, S., Masuya, H., Maeda, M., Suga, M., Kataoka, Y., and Kobayashi N.:
    "Development of Semantic Web-based Imaging Database for Biological Morphome" The 7th Joint International Semantic Technology Conference (JIST). Special Track: Semantic Processing for Knowledge Graphs, LNCS 10675, 277-285 (2017).
  • 5. Dumontier, M., Gray, AJG., Marshall, MS., Alexiev, V., Ansell, P., Bader, G., Baran, J., Bolleman, JT., Callahan, A., Cruz-Toledo, J., Gaudet, P., Gombocz, EA., Gonzalez-Beltran, AN., Groth, P., Haendel, M., Ito, M., Jupp, S., Juty, N., Katayama, T., Kobayashi, N., Krishnaswami, K., Laibe, C., Le Novere, N., Lin, S., Malone, J., Miller, M., Mungall, CJ., Rietveld, L., Wimalaratne, SM., and Yamaguchi, A.:
    "The health care and life sciences community profile for dataset descriptions" PeerJ 4:e2331 (2016).
  • 6. Kobayashi, N.:
    "Bio-medical entity prioritisation based on literature with Semantic Web annotations" BMC Proceedings 9(5):A6 (2015).

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

小林 紀郎
開発ユニットリーダー

メンバー

桝屋 啓志
上級研究員
RANGEL Julio C
特別研究員
加藤 雅樹
技師
武田 英明
客員研究員
山本 泰智
客員研究員

採用情報

募集職種 応募締切
研究員または特別研究員募集(W19189) ポストが決まり次第

お問い合わせ先

〒351-0198 埼玉県和光市広沢2-1 情報基盤棟
Tel: 048-467-9323
Fax: 048-462-4634
Email: norio.kobayashi [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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