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光量子工学研究センター 画像情報処理研究チーム

チームリーダー 横田 秀夫(D.Eng.)

研究概要

横田 秀夫 (D.Eng.)

当チームでは、理化学研究所オリジナルな画像処理技術の開発、多次元の計測技術の開発により、科学技術に貢献することを目的とします。特に、新規の情報処理技術、画像処理技術の研究開発により、理化学研究所内外の研究者に向けた、生命現象を定量化する新規ツールを確立することにより、数理生物学、バイオメディカルシミュレーション、医療診断・治療技術の向上に貢献します。

研究主分野

  • 工学

研究関連分野

  • 情報学

キーワード

  • 多次元画像処理
  • 多次元イメージング
  • バイオエンジニアリング
  • 画像解析
  • 医用工学

主要論文

  • 1.A. Sakane, S. Yoshizawa, M. Nishimura, Y. Tsuchiya, N. Matsushita, K. Miyake, K. Horikawa, I. Imoto, C. Mizuguchi, H. Saito, T. Ueno, S. Matsushita, H. Haga, S. Deguchi, K. Mizuguchi, H. Yokota, T. Sasaki,
    "Conformational plasticity of JRAB/MICAL-L2 provides 'law and order' in collective cell migration",
    Article in Molecular Biology of the Cell, 27, 3095-3108, August 2016, DOI: 10.1091/mbc.E16-05-0332
  • 2.N. Yamashita, M. Morita, W. R. Legant, B.-C. Chen, E. Betzig, H. Yokota, and Y. Mimori-Kiyosue, "Three-dimensional tracking of plus-tips by lattice light-sheet microscopy permits the quantification of microtubule growth trajectories within the mitotic apparatus",
    J. Biomedical Optics, 20(10):101206:1-18, 2015.
  • 3.T. Ijiri, S. Yoshizawa, H. Yokota, and T. Igarashi,
    "Flower Modeling via X-ray Computed Tomography",
    ACM Transactions on Graphics, Vol. 33(4):48:1-10, (Proc. of SIGGRAPH'14), 2014.
  • 4.M. Morita, T. Tawara, M. Nishimura, S. Yoshizawa, B. Chou, I. Kuroki, T. Ijiri, Y. Tsujimura, R. Himeno, and H. Yokota,
    "Communication Platform for Image Analysis and Sharing in Biology",
    International Journal of Networking and Computing, Vol. 4, No. 2, pp. 369-391, 2014.
  • 5.E. A. Susaki, K. Tainaka, D. Perrin, F. Kishino, T. Tawara, T. M. Watanabe, C. Yokoyama, H. Onoe, M. Eguchi, S. Yamaguchi, T. Abe, H. Kiyonari, Y. Shimizu, A. Miyawaki, H. Yokota, and H. R. Ueda,
    "Whole-Brain Imaging with Single-Cell Resolution Using Chemical Cocktails and Computational Analysis", Cell, Vol. 157(3), pp. 726-739, 2014.
  • 6.T. Ijiri, S. Yoshizawa, Y. Sato, M. Ito, and H. Yokota:
    "Bilateral Hermite Radial Basis Functions for Contour-based Volume Segmentation"
    Computer Graphics Forum (Proc. of EUROGRAPHICS’13), Vo. 32(2), pp. 123-132, 2013.
  • 7.S. Hihara, C.-G. Pack, K. Kaizu, T. Tani, T. Hanafusa, T. Nozaki, S. Takemoto, T. Yoshimi, H. Yokota, N. Imamoto, Y. Sako, M. Kinjo, K. Takahashi, T. Nagai, and K. Maeshima:
    "Local Nucleosome Dynamics Facilitate Chromatin Accessibility in Living Mammalian Cells"
    Cell Reports, Vol. 2(6), pp. 1645-1656, 2012.
  • 8.S. Yoshizawa, A. Belyaev, and H. Yokota:
    "Shape and Image Interrogation with Curvature Extremalities"
    Journal for Geometry and Graphics, Vol. 16, No. 1, pp. 81-95, 2012.
  • 9.Y. Okamura-Oho, K. Shimokawa, S. Takemoto, A. Hirakiyama, S. Nakamura, Y. Tsujimura, M. Nishimura, T. Kasukawa, K. Masumoto, I. Nikaido, Y. Shigeyoshi, H. Ueda, G. Song, J. Gee, R. Himeno, and H. Yokota:
    "Transcriptome tomography for brain analysis in the web-accessible anatomical space"
    PLOS ONE, Vol. 7(9), e45373:1-10, 2012.
  • 10.T. Ijiri, T. Ashihara, N. Umetani, T. Igarashi, R. Haraguchi, H. Yokota, and K. Nakazawa:
    "A Kinematic Approach for Efficient and Robust Simulation of the Cardiac Beating Motion"
    PLoS ONE, Vol. 7(5), pp. e36706:1-9, 2012

研究成果(プレスリリース)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

横田 秀夫
チームリーダー

メンバー

吉澤 信
上級研究員
竹本 智子
研究員
森田 正彦
特別研究員
山下 典理男
特別研究員
中村 佐紀子
テクニカルスタッフⅠ
辻村 有紀
テクニカルスタッフⅠ
西村 将臣
テクニカルスタッフⅠ
井尻 敬
客員研究員
大山 慎太郎
客員研究員
於保 祐子
客員研究員
曽我 公平
客員研究員
深作 和明
客員研究員
藤崎 和弘
客員研究員
船井 孝
客員研究員
古城 直道
客員研究員
向井 利春
客員研究員
森下 壮一郎
客員研究員

採用情報

募集職種 応募締切
アシスタント募集(W20025) ポストが決まり次第
特別研究員または研究員募集(W19023) ポストが決まり次第

お問い合わせ先

〒351-0198 埼玉県和光市広沢2-1
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