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理研白眉研究チーム 新宅マイクロ流体工学理研白眉研究チーム

理研白眉研究チームリーダー 新宅 博文(D.Eng.)

研究概要

新宅 博文 (D.Eng.)

本研究チームではmicro/nanoスケールにおける流れおよび物質輸送に関する研究を行なっています。我々は特に電場により生じる流れ、すなわち界面動電現象を利用したマイクロ流体システムを開発し、生化学分析や細胞工学への応用を目指しています。最近我々は、電気穿孔および等速電気泳動を用いて一細胞の細胞質および核を数十秒で分画する技術を開発し、同じ一細胞の細胞質RNAおよび核RNAを次世代シーケンシングで分析することを可能にしました。この技術を用いて細胞内におけるRNAの局在や核-細胞質間の輸送を明らかにすることを目指しています。

研究主分野

  • 工学

研究関連分野

  • 総合理工
  • 流体工学
  • ナノバイオサイエンス
  • ナノマイクロシステム

キーワード

  • マイクロ流体
  • 一細胞解析
  • 界面動電現象
  • 核酸
  • 次世代シーケンシング

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. Oguchi, Y., Ozaki, Y., Abdelmoez, M.N. and Shintaku, H.:
    "NanoSINC-seq dissects the isoform diversity in subcellular compartments of single cells"
    Science Advances, Vol. 7, No.15 (2021), eabe0317.
  • 2. Subramanian Parimalam, S., Abdelmoez, M.N., Tsuchida, A., Sotta, N., Tanaka, M., Kuromori, T., Fujiwara, T., Hirai, M.Y., Yokokawa, E., Oguchi, Y. and Shintaku, H.:
    "Targeted permeabilization of cell wall and extraction of charged molecules from single cells in intact plant clusters using a focused electric field"
    Analyst, Vol. 146 (2021), pp. 1604-1611.
  • 3. Abdelmoez M.N., Oguchi, Y.,Ozaki, Y., Yokokawa, R., Kotera, H., and Shintaku, H.:
    "Distinct Kinetics in Electrophoretic Extraction of Cytoplasmic RNA from Single Cells"
    Analytical Chemistry, Vol. 92, No. 1(2020), pp. 1485-1492.
  • 4. Abdelmoez, M.N.*, Iida, K.*, Oguchi, Y.*, Nishikii, H., Yokokawa, R., Kotera, H., Uemura, S., Santiago, J.G. and Shintaku, H.:
    "SINC-seq: correlation of transient gene expressions between nucleus and cytoplasm reflects single-cell physiology"
    Genome Biology, (2018) DOI:. 10.1186/s13059-018-1446-9.
  • 5. Subramanian Parimalam, S., Oguchi, Y., Abdelmoez, M.N., Tsuchida, A., Ozaki, Y., Yokokawa, R., Kotera, H., and Shintaku, H.:
    "Electrical Lysis and RNA Extraction from Single Cells Fixed by Dithio-bis(succinimidyl propionate)"
    Analytical Chemistry, Vol. 90, No. 21 (2018), pp.12512-12518.
  • 6. Khnouf, R., Shore, S., Han, C.M., Henderson, J.M., Munro, S.A., McCaffrey, A.P., Shintaku, H., and Santiago, J.G.:
    "Efficient Production of On-target Reads for Small RNA Sequencing of Single Cells Using Modified Adapters"
    Analytical Chemistry, Vol. 90, No. 21 (2018), pp.12609-12615.
  • 7. *Kuriyama, K.*, Shintaku, H.*, and Santiago, J.G.:
    "Protocol for microfluidic system to automate the preparation and fractionation of the nucleic acids in the cytoplasm versus nuclei of single cells"
    Bio-protocol, Vol. 6, Issue 12, (2016), e1844.
  • 8. *Kuriyama, K.*, Shintaku, H.*, and Santiago, J.G.:
    "Isotachophoresis for Fractionation and Recovery of Cytoplasmic RNA and Nucleus from Single Cells"
    Electrophoresis, Vol. 36, Issue 14(2015) pp. 1658-1662.
  • 9. *Shintaku, H., Palko, J.W., Sanders, G.M., and Santiago, J.G.:
    "Increasing Hybridization Rate and Sensitivity of Bead Based Assays Using Isotachophoresis"
    Angewandte Chemie International Edition,Vol. 53 (2014), pp. 13813-13816.
  • 10. *Shintaku, H., Nishikii, H., Marshall, L.A., Kotera, H., and Santiago, J.G.:
    "On-Chip Separation and Analysis of RNA and DNA from Single Cells"
    Analytical Chemistry, Vol. 86, No. 4 (2014), pp 1953–1957.

研究成果(プレスリリース)

研究年次報告書

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

新宅 博文
理研白眉研究チームリーダー

メンバー

小口 祐伴
研究員
金子 泰洸ポール
特別研究員
塩見 晃史
特別研究員
鳥井 孝太郎
特別研究員
土田 新
大学院生リサーチ・アソシエイト
西川 香里
テクニカルスタッフⅠ
西川 昌輝
客員研究員
森田 めぐみ
アシスタント

採用情報

募集職種 応募締切
テクニカルスタッフⅠまたはテクニカルスタッフⅡ募集(W21174) 2021年11月30日
研究パートタイマー募集(W21178) ポストが決まり次第
特別研究員募集(W21163) 2021年12月25日

お問い合わせ先

〒351-0198 埼玉県和光市広沢2-1
研究本館6階
Email: hirofumi.shintaku [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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