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生命医科学研究センター遺伝子制御回路研究チーム

チームリーダー SHIN Jay W.（D.Sc.）

English Page

研究概要

ヒトの体をつくる細胞に特定の因子を働かせると、別の機能を持つ細胞に変換することができます。これを細胞のリプログラム（再プログラム）と呼び、再生医療や疾患モデルの開発、創薬研究への応用が期待されています。当ユニットでは、ロボットを用いた大量解析や、細胞一つ一つを複数同時にスクリーニングする手法の開発により、さまざまな細胞変換を実現する技術の確立に取り組んでいます。またこの技術を次世代シーケンサと組み合わせて、（初期化を経ない）細胞変換の制御に関わる転写因子やncRNA、エピゲノム因子などが形成する分子ネットワークの解明をめざします。

研究主分野

総合生物

研究関連分野

生物学

キーワード

シングルセル解析（1細胞解析）
細胞の再プログラミング

主要論文

1.Tomaru Y, Hasegawa R, Suzuki T, Sato T, Kubosaki A, Suzuki M, Kawaji H, Forrest AR, Hayashizaki Y; FANTOM Consortium, Shin JW, Suzuki H.
"A transient disruption of fibroblastic transcriptional regulatory network facilitates trans-differentiation."
Nucleic Acids Res. 42(14), 8905-13 (2014)
2.FANTOM5 Consortium
"A promoter level mammalian expression atlas"
Nature. 507(7493), 462-70 (2014)
3.Kawaji H, Lizio M, Itoh M, Kanamori-Katayama M, Kaiho A, Nishiyori-Sueki H, Shin JW, Kojima-Ishiyama M, Kawano M, Murata M, Ninomiya-Fukuda N, Ishikawa-Kato S, Nagao-Sato S, Noma S, Hayashizaki Y, Forrest AR, Carninci P; FANTOM Consortium.
"Comparison of CAGE and RNA-seq transcriptome profiling using clonally amplified and single-molecule next-generation sequencing."
Genome Res. 24(4), 708-17(2014)
4.Kouno T, de Hoon M, Mar JC, Tomaru Y, Kawano M, Carninci P, Suzuki H, Hayashizaki Y, Shin JW
"Temporal dynamics and transcriptional control using single-cell gene expression analysis."
Genome Biol.? 14(10), R118 (2013)
5.Hasegawa R, Tomaru Y, De Hoon M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Shin JW.
"Identification of ZNF395 as a novel modulator of adipogenesis"
Exp Cell Res. 319(3), 68-76 (2013)
6.Shin JW, Suzuki T, Ninomiya N, Kishima M, Hasegawa Y, Kubosaki A, Yabukami H, Suzuki H, Hayashizaki Y.
"stablishment of single-cell screening system for the rapid identification of transcriptional modulators involved in direct cell-reprogramming"
Nucleic Acid Research. 40(21), e165. (2012)
7.Suzuki T, Nakano-Ikegaya M, Yabukami-Okuda H, de Hoon M, Severin J, Saga-Hatano S, Shin JW, Kubosaki A, Simon C, Hasegawa Y, Hayashizaki Y, Suzuki H.
"Reconstruction of monocyte transcriptional regulatory network accompanies monocytic functions in human fibroblasts."
PLoS One 7(3):e33474 (2012)
8.Hasegawa Y, Takahashi N, Forrest AR, Shin JW, Kinoshita Y, Suzuki H, Hayashizaki Y.
"CC chemokine ligand 2 and leukemia inhibitory factor cooperatively promote pluripotency in mouse induced pluripotent cells."
Stem Cells. 29(8), 1196-205 (2011)