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生命医科学研究センター ヒト免疫遺伝研究チーム

チームリーダー 石垣 和慶(M.D., Ph.D.)

研究概要

石垣 和慶(M.D., Ph.D.)

免疫機能の多様性は私たちのゲノムにコードされています。以前の研究によって、免疫機能と自己免疫リスクに関連する多くの遺伝的要因が特定されています。しかし、免疫機能には様々な刺激に応答する多くの細胞種が関与するため、現在の我々の理解は限定的です。私たちの研究室は、バイオインフォマティクスとさまざまな条件での機能遺伝学実験を駆使し(発現量的形質遺伝子座解析など)、免疫機能と自己免疫リスクの遺伝的制御を解明することを目指しています。私たちの研究に質問やコメントがあれば、私たちにご連絡ください。

研究主分野

  • 医歯薬学

研究関連分野

  • 情報学
  • 複合領域
  • 総合生物
  • 生物学

キーワード

  • 発現量的形質遺伝子座
  • ゲノム機能学
  • ヒト免疫学
  • 自己免疫疾患

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. *Ishigaki K, Lagattuta K, Luo Y, James E, Buckner J, Raychaudhuri S.:
    "HLA autoimmune risk alleles restrict the hypervariable region of T cell receptors"
    MedRxiv (2020)
  • 2. Ishigaki K, Akiyama M, Kanai M, Takahashi A, Kawakami E, Sugishita H, Sakaue S, Matoba N, Low SK, Okada Y, Terao C, Amariuta T, Gazal S, Kochi Y, Horikoshi M, Suzuki K, Ito K, Koyama S, Ozaki K, Niida S, Sakata Y, Sakata Y, Kohno T, Shiraishi K, Momozawa Y, Hirata M, Matsuda K, Ikeda M, Iwata N, Ikegawa S, Kou I, Tanaka T, Nakagawa H, Suzuki A, Hirota T, Tamari M, Chayama K, Miki D, Mori M, Nagayama S, Daigo Y, Miki Y, Katagiri T, Ogawa O, Obara W, Ito H, Yoshida T, Imoto I, Takahashi T, Tanikawa C, Suzuki T, Sinozaki N, Minami S, Yamaguchi H, Asai S, Takahashi Y, Yamaji K, Takahashi K, Fujioka T, Takata R, Yanai H, Masumoto A, Koretsune Y, Kutsumi H, Higashiyama M, Murayama S, Minegishi N, Suzuki K, Tanno K, Shimizu A, Yamaji T, Iwasaki M, Sawada N, Uemura H, Tanaka K, Naito M, Sasaki M, Wakai K, Tsugane S, Yamamoto M, Yamamoto K, Murakami Y, Nakamura Y, Raychaudhuri S, Inazawa J, Yamauchi T, Kadowaki T, Kubo M, Kamatani Y.:
    "Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases"
    Nature Genetics. 52(7): 669-679 (2020)
  • 3. Terao C, Suzuki A, Momozawa Y, Akiyama M, Ishigaki K, Yamamoto K, Matsuda K, Murakami Y, McCarroll SA, Kubo M, Loh PR, Kamatani Y.:
    "Chromosomal alterations among age-related haematopoietic clones in Japan."
    Nature. 584(7819): 130-135 (2020)
  • 4. *Amariuta T, Ishigaki K (co-first), Sugishita H, Ohta T, Koido M, Dey KK, Matsuda K, Murakami Y, Price AL, Kawakami E, Terao C, Raychaudhuri S.:
    "Improving the trans-ancestry portability of polygenic risk scores by prioritizing variants in predicted cell-type-specific regulatory elements."
    Nature Genetics. 52(12): 1346-1354 (2020)
  • 5. Akiyama M, Ishigaki K, Sakaue S, Momozawa Y, Horikoshi M, Hirata M, Matsuda K, Ikegawa S, Takahashi A, Kanai M, Suzuki S, Matsui D, Naito M, Yamaji T, Iwasaki M, Sawada N, Tanno K, Sasaki M, Hozawa A, Minegishi N, Wakai K, Tsugane S, Shimizu A, Yamamoto M, Okada Y, Murakami Y, Kubo M, Kamatani Y.:
    "Characterizing rare and low-frequency height-associated variants in the Japanese population."
    Nature Communications. 27;10(1): 4393 (2019)
  • 6. Akizuki S, Ishigaki K, Kochi Y, Law SM, Matsuo K, Ohmura K, Suzuki A, Nakayama M, Iizuka Y, Koseki H, Ohara O, Hirata J, Kamatani Y, Matsuda F, Sumida T, Yamamoto K, Okada Y, Mimori T, Terao C.:
    "PLD4 is a genetic determinant to systemic lupus erythematosus and involved in murine autoimmune phenotypes."
    Annals of Rheumatic Diseases. 78(4): 509-518 (2019)
  • 7. Ishigaki K, Kochi Y, Yamamoto K.:
    "Genetics of human autoimmunity: From genetic information to functional insights."
    Clinical Immunology. 186:9-13 (2018)
  • 8. Ishigaki K, Kochi Y, Suzuki A, Tsuchida Y, Tsuchiya H, Sumitomo S, Yamaguchi K, Nagafuchi Y, Nakachi S, Kato R, Sakurai K, Shoda H, Ikari K, Taniguchi A, Yamanaka H, Miya F, Tsunoda T, Okada Y, Momozawa Y, Kamatani Y, Yamada R, Kubo M, Fujio K, Yamamoto K.:
    "Polygenic burdens on cell-specific pathways underlie the risk of rheumatoid arthritis."
    Nature Genetics. 49(7):1120-1125 (2017)
  • 9. *Tsuchida Y, Sumitomo S, Ishigaki K, Suzuki A, Kochi Y, Tsuchiya H, Ota M, Komai T, Inoue M, Morita K, Okamura T, Yamamoto K, Fujio K.:
    "TGF-β3 Inhibits Antibody Production by Human B Cells."
    PLoS One. 4;12(1) (2017)
  • 10. *Ishigaki K, Shoda H, Kochi Y, Yasui T, Kadono Y, Tanaka S, Fujio K, Yamamoto K.:
    "Quantitative and qualitative characterization of expanded CD4+ T cell clones in rheumatoid arthritis patients."
    Scientific Reports. 6;5:12937 (2015)

研究成果(プレスリリース)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

石垣 和慶
チームリーダー

メンバー

河野 通大
特別研究員
波多野 裕明
特別研究員
荒川 貴博
テクニカルスタッフⅠ

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Tel: 045-503-7072
Email: kazuyoshi.ishigaki [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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