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生命医科学研究センター 応用ゲノム解析技術研究チーム

チームリーダー 岡崎 康司(M.D., Ph.D.)

研究概要

岡崎 康司

疾患の病態解明を目指したオミックス解析を行うと共に、機能ゲノミクスを用いて、各種細胞・組織の恒常性機能を破綻させる疾患発症メカニズムを理解することで、新たなゲノム創薬手法の開発、創薬標的の発見、ゲノム医療実現のためのエビデンス創出を目指す研究活動を行っています。また、当研究チームで培った技術を強みとし、理研独自の転写開始点解析技術(CAGE)やエピゲノム解析など、最先端のゲノム及びトランスクリプトーム解析技術を通じて医科学研究に貢献していきます。

研究主分野

  • 医歯薬学

研究関連分野

  • 情報学
  • 生物学

キーワード

  • ミトコンドリア病
  • バイオインフォマティクス
  • 遺伝病

主要論文

  • 1. Yuuri Yasuoka.
    "Tissue-specific expression of carbohydrate sulfotransferases drives keratan sulfate biosynthesis in the notochord and otic vesicles of Xenopus embryos."
    Front. Cell Dev. Biol. 11, 957805 (2023)
  • 2. Imai-Okazaki A, Nitta KR, Yatsuka Y, Sugiura A, Arao M, Shimura M, Ebihara T, Onuki T, Ichimoto K, Ohtake A, Murayama K, Okazaki Y.
    "Impact of measuring heteroplasmy of a pathogenic mitochondrial DNA variant at the single-cell level in individuals with mitochondrial disease."
    J Inherit Metab Dis 45, 1143-1150 (2022)
  • 3. Yip CW, Hon CC, Yasuzawa K, Sivaraman DM, Ramilowski JA, Shibayama Y, Agrawal S, Prabhu AV, Parr C, Severin J, Lan YJ, Dostie J, Petri A, Nishiyori-Sueki H, Tagami M, Itoh M, López-Redondo F, Kouno T, Chang JC, Luginbühl J, Kato M, Murata M, Yip WH, Shu X, Abugessaisa I, Hasegawa A, Suzuki H, Kauppinen S, Yagi K, Okazaki Y, Kasukawa T, de Hoon M, Carninci P, Shin JW.
    "Uncovering the mesendoderm gene regulatory network through multi-omic data integration."
    Cell Rep 38, 110364 (2022)
  • 4. de Hoon M, Bonetti A, Plessy C, Ando Y, Hon CC, Ishizu Y, Itoh M, Kato S, Lin D, Maekawa S, Murata M, Nishiyori H, Shin JW, Stolte J, Suzuki AM, Tagami M, Takahashi H, Thongjuea S, Forrest ARR, Hayashizaki Y, Kere J, Carninci P.
    "Deep sequencing of short capped RNAs reveals novel families of noncoding RNAs."
    Genome Res 32, 1727-35 (2022)
  • 5. Jansen C, Paraiso KD, Zhou JJ, Blitz IL, Fish MB, Charney RM, Cho JS, Yasuoka Y, Sudou N, Bright AR, Wlizla M, Veenstra GJC, Taira M, Zorn AM, Mortazavi A, Cho KWY.
    "Uncovering the mesendoderm gene regulatory network through multi-omic data" integration.
    Cell Rep 38, 110364 (2022)
  • 6. Kato T, Manabe RI, Igarashi H, Kametani F, Hirokawa S, Sekine Y, Fujita N, Saito S, Kawashima Y, Hatano Y, Ando S, Nozaki H, Sugai A, Uemura M, Fukunaga M, Sato T, Koyama A, Saito R, Sugie A, Toyoshima Y, Kawata H, Murayama S, Matsumoto M, Kakita A, Hasegawa M, Ihara M, Kanazawa M, Nishizawa M, Tsuji S, Onodera O.
    "Candesartan prevents arteriopathy progression in cerebral autosomal recessive arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy model."
    J Clin Invest 131, e140555 (2021)
  • 7. Ozaki K, Irioka T, Uchihara T, Yamada A,Nakamura A,Majima T,Igarashi S, Shintaku H,Yakeishi M, Tsuura Y, Okazaki Y,Ishikawa K, Yokota T.
    "Neuropathology of SCA34 showing widespread oligodendroglial pathology with vacuolar white matter degeneration: a case study"
    Acta Neuropathol Commun. 9(1)172(2021)
  • 8. Inaba A, Arinaga A, Tanaka K, Endo T, Hayatsu N, Okazaki Y, Yamane T, Oishi Y, Imai H, Iwatsuki K.
    "Interleukin-4 Promotes Tuft Cell Differentiation and Acetylcholine Production in Intestinal Organoids of Non-Human Primate"
    Int J Mol Sci. 22(15)7921(2021)
  • 9. Hashimoto M, Saito Y, Nakagawa R, Ogahara I, Takagi S, Takata S, Amitani H, Endo M, Yuki H, Ramilowski JA, Severin J, Manabe RI, Watanabe T, Ozaki K, Kaneko A, Kajita H, Fujiki S, Sato K, Honma T, Uchida N, Fukami T, Okazaki Y, Ohara O, Shultz LD, Yamada M, Taniguchi S, Vyas P, de Hoon M, Momozawa Y, Ishikawa F.
    "Combined inhibition of XIAP and BCL2 drives maximal therapeutic efficacy in genetically diverse aggressive acute myeloid leukemia."
    Nat Cancer 2, 340-356 (2021)
  • 10. Kishita Y, Shimura M, Kohda M, Fushimi T, Nitta KR, Yatsuka Y, Hirose S, Ideguchi H, Ohtake A, Murayama K, Okazaki Y.
    "Genome sequencing and RNA-seq analyses of mitochondrial complex I deficiency revealed Alu insertion-mediated deletion in NDUFV2."
    Hum Mutat 42, 1422-1428 (2021)

研究成果(プレスリリース)

イベント・シンポジウムなど

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

岡崎 康司
チームリーダー

メンバー

尾崎 心
副チームリーダー
安岡 有理
研究員
早津 徳人
研究員
平田 智子
技師
山本 由美子
技師
寺本 了太
基礎科学特別研究員
田上 道平
専門技術員
野間 将平
上級テクニカルスタッフ
髙橋 知登世
テクニカルスタッフⅠ
安岡 由貴
テクニカルスタッフⅡ

採用情報

募集職種 応募締切
テクニカルスタッフⅡ募集(IMS110-2302) ポストが決まり次第
研究員、特別研究員またはリサーチアソシエイト募集(IMS110-2301) ポストが決まり次第
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