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バイオリソース研究センター 植物-微生物共生研究開発チーム

チームリーダー 市橋 泰範(Ph.D.)

研究概要

市橋 泰範 (Ph.D.)

植物が生育する土壌は、地球上で最も微生物が豊富であり、菌根菌などの植物と共生する微生物がいます。植物−微生物の共生関係の理解が進めば、地球規模での持続可能な食料供給や環境負荷軽減への貢献が期待できます。本チームでは、植物-微生物共生研究に資する根圏微生物および実験植物のリソース開発と、これを活用した植物-微生物共生の実験系の確立、更には農業現場への応用に資する情報整備を行います。内外の研究コミュニティと連携することにより、共生現象の実態解明と産業利用につながる研究基盤の構築をめざします。

研究主分野

  • 生物学

研究関連分野

  • 農学

キーワード

  • 植物-微生物共生
  • 根圏微生物
  • 菌根菌
  • フィールドオミクス
  • 21世紀の緑の革命

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. Ichihashi Y, Date Y, Shino A, Shimizu T, Shibata A, Kumaishi K, Funahashi F, Wakayama K, Yamazaki K, Umezawa A, Tanoi K, Hayashi M, Nakamura R, Shirasu K, Kikuchi J, Nihei N.:
    "Multi-omics analysis on an agroecosystem reveals the significant role of organic nitrogen to increase agricultural crop yield"
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA. DOI: 10.1073/pnas.1917259117
  • 2. Goto Y, Maki N, Ichihashi Y, Kitazawa D, Igarashi D, Kadota Y, Shirasu K.:
    "Exogenous treatment with glutamate induces immune responses in Arabidopsis"
    Mol. Plant Microbe Interact. 33, 474-487 (2020)
  • 3. Yoshida S, Kim S, Wafula EK, Tanskanen J, Kim YM, Honaas L, Yang Z, Spallek T, Conn CE, Ichihashi Y, Cheong K, Cui S, Der JP, Gundlach H, Jiao Y, Hori C, Ishida JK, Kasahara H, Kiba T, Kim MS, Koo N, Laohavisit A, Lee YH, Lumba S, McCourt P, Mortimer JC, Mutuku JM, Nomura T, Sasaki-Sekimoto Y, Seto Y, Wang Y, Wakatake T, Sakakibara H, Demura T, Yamaguchi S, Yoneyama K, Manabe RI, Nelson DC, Schulman AH, Timko MP, dePamphilis CW, Choi D, Shirasu K.:
    "Genome Sequence of Striga asiatica Provides Insight into the Evolution of Plant Parasitism"
    Curr. Biol. 29, 3041-3052 (2019)
  • 4. Ichihashi Y, Fukushima A, Shibata A, Shirasu K.:
    "High Impact Gene Discovery: Simple Strand-Specific mRNA Library Construction and Differential Regulatory Analysis Based on Gene Co-Expression Network"
    Methods Mol. Biol. 1830, 163-189 (2018)
  • 5. Toju, H., Peay, K. G., Yamamichi, M., Narisawa, K., Hiruma, K., Naito, K., Fukuda, S., Ushio, M., Nakaoka, S., Onoda, Y., Yoshida, K., Schlaeppi, K., Bai, Y., Sugiura, R., Ichihashi, Y., Minamisawa, K., Kiers, E. T.:
    "Core microbiomes for sustainable agroecosystems"
    Nat. Plants 4, 247-257 (2018)
  • 6. *Ichihashi, Y., Kusano, M., Kobayashi, M., Suetsugu, K., Yoshida, S., Wakatake, T., Kumaishi, K., Shibata, A., Saito, K., Shirasu, K.:
    "Transcriptomic and Metabolomic Reprogramming from Roots to Haustoria in the Parasitic Plant, Thesium chinense"
    Plant Cell Physiol. 59, 729–738 (2017)
  • 7. *Ichihashi, Y., Aguilar-Martinez, J. A., Farhi, M., Chitwood, D. H., Kumar, R., Millon, L. V., Peng, J., Maloof, J. N., Sinha, N. R.:
    "Evolutionary developmental transcriptomics reveals a gene network module regulating interspecific diversity in plant leaf shape"
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 111, E2616-E2621 (2014)
  • 8. *Chitwood, D. H., Kumar, R., Headland, L, R., Ranjan, A., Covington, M. F., Ichihashi, Y., Fulop, D., Jimenez-Gómez, J. M., Peng, J., Maloof, J. N., Sinha, N. R.:
    "A quantitative genetic basis for leaf morphology in a set of precisely defined tomato introgression lines"
    Plant Cell 25, 2465-2481 (2013)
  • 9. *Ichihashi, Y., Kawade, K., Usami, T., Horiguchi, G., Takahashi, T., Tsukaya, H.:
    "Key proliferative activity in the junction between the leaf blade and leaf petiole of Arabidopsis"
    Plant Physiol. 157, 1151-1162 (2011)
  • 10. *Ichihashi, Y., Horiguchi, G., Gleissberg, S., Tsukaya, H.:
    "The bHLH transcription factor SPATULA controls final leaf size in Arabidopsis thaliana"
    Plant Cell Physiol. 51, 252-261 (2010)

研究成果(プレスリリース)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

市橋 泰範
チームリーダー

メンバー

成川 恵
開発研究員
佐藤 匠
特別研究員
天野 瑠美
訪問研究員
熊石 妃恵
テクニカルスタッフⅡ
臼井 絵里香
テクニカルスタッフⅡ

お問い合わせ先

〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
バイオリソース棟
Email: yasunori.ichihashi [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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