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環境資源科学研究センター生命分子解析ユニット

ユニットリーダー堂前直（Ph.D.）

English Page

研究概要

われわれは、生命現象の解明に向け、生体成分構造解析法の開発や構造解析の応用研究を行っています。生体成分の中でも特にタンパク質は生命現象の源であり、さまざまな生物活性があります。そのタンパク質の構造を詳細に調べることで、活性と遺伝子との対応、生物学的活性のメカニズムや活性の制御機構を解明しています。また、装置ならびに設備の設置や管理、解析方法に関する情報の整備をすることで研究支援を行っています。

研究主分野

生物学

研究関連分野

環境学
化学
総合生物
農学
医歯薬学

キーワード

翻訳後修飾
プロテオミクス
質量分析
エピゲノミクス
構造解析

主要論文

1. Kato K, Shinoda T, Nagao R, Akimoto S, Suzuki T, Dohmae N, Chen M, Allakhverdiev SI, Shen JR, Akita F, Miyazaki N, Tomo T.:
"Structural basis for the adaptation and function of chlorophyll f in photosystem I."
Nat Commun. 11(1):238 (2020)
2. Nakayama H, Yamauchi Y, Nobe Y, Sato K, Takahashi N, Shalev-Benami M, Isobe T, Taoka M.:
"Method for Direct Mass-Spectrometry-Based Identification of Monomethylated RNA Nucleoside Positional Isomers and Its Application to the Analysis of Leishmania rRNA."
Anal Chem. 91(24):15634-15643 (2019)
3. Nagao R, Kato K, Suzuki T, Ifuku K, Uchiyama I, Kashino Y, Dohmae N, Akimoto S, Shen JR, Miyazaki N, Akita F.:
"Structural basis for energy harvesting and dissipation in a diatom PSII-FCPII supercomplex."
Nature Plants. 5：890-901 (2019)
4. Nagao R, Ueno Y, Akita F, Suzuki T, Dohmae N, Akimoto S, Shen JR.:
"Biochemical characterization of photosystem I complexes having different subunit compositions of fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins in the diatom Chaetoceros gracilis."
Photosynth Res. 140(2):141-149 (2019)
5. Yoshida K, Muratani M, Araki H, Miura F, Suzuki T, Dohmae N, Katou Y, Shirahige K, Ito T, Ishii S.:
"Mapping of histone-binding sites in histone replacement-completed spermatozoa.s."
Nat Commun. 9(1):3885 (2018)
6. Kasuya G, Nakane T, Yokoyama T, Jia Y, Inoue M, Watanabe K, Nakamura R, Nishizawa T, Kusakizako T, Tsutsumi A, Yanagisawa H, Dohmae N, Hattori M, Ichijo H, Yan Z, Kikkawa M, Shirouzu M, Ishitani R, Nureki O.:
"Cryo-EM structures of the human volume-regulated anion channel LRRC8."
Nat Struct Mol Biol. 25(9):797-804 (2018)
7. Takahashi F, Suzuki T, Osakabe Y, Betsuyaku S, Kondo Y, Dohmae N, Fukuda H, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K.:
"A small peptide modulates stomatal control via abscisic acid in long-distance signalling."
Nature. 556(7700):235-238 (2018)
8. Xiao Deng, Naoshi Dohmae, Kenneth H. Nealson, Hashimoto K, Okamoto A.:
"Multi-heme cytochromes provide a pathway for survival in energy-limited environments."
Sci Adv. 4(2):eaao5682 (2018)
9. Ferry L, Fournier A, Tsusaka T, Adelmant G, Shimazu T, Matano S, Kirsh O, Amouroux R, Dohmae N, Suzuki T, Filion GJ, Deng W, de Dieuleveult M, Fritsch L, Kudithipudi S, Jeltsch A, Leonhardt H, Hajkova P, Marto JA, Arita K, Shinkai Y, Defossez PA.:
"Methylation of DNA Ligase 1 by G9a/GLP Recruits UHRF1 to Replicating DNA and Regulates DNA Methylation."
Mol Cell. 67(4):550-65 (2017)
10. Shihoya W, Nishizawa T, Okuta A, Tani K, Dohmae N, Fujiyoshi Y, Nureki O, Doi T.:
"Activation mechanism of endothelin ETB receptor by endothelin-1."
Nature. 537(7620):363-68 (2016)