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生命医科学研究センター システム遺伝学チーム

チームリーダー 岡田 随象(M.D., Ph.D.)

研究概要

岡田 随象 (M.D., Ph.D.)

30憶塩基対で構成されるヒトゲノムには、ヒトの生命現象を規定する膨大な情報が含まれますが、ごく一部しか解明されていません。私達は、ヒト集団における大規模ヒトゲノム情報・オミクス情報・表現型情報が構成する多次元・多層的なネットワークの解明を目標としています。遺伝統計学や機械学習の新規手法開発を通じて、オミクス情報を中心とした数理システムとしての生命現象の再定義を試み、新たな疾患病態の発見、新規創薬、ゲノム個別化医療の社会実装を進めます。私達の活動に興味を持たれた方、是非とも一緒に研究を進めましょう。

研究主分野

  • 医歯薬学

研究関連分野

  • 情報学
  • 複合領域
  • 数物系科学
  • 総合生物
  • 生物学
  • システムゲノム科学関連
  • 医化学関連
  • 生命、健康および医療情報学関連

キーワード

  • 遺伝統計学
  • バイオインフォマティクス
  • 人工知能
  • オミクス解析
  • 疾患ゲノム解析

イベント・シンポジウムなど

刊行物

主要論文

  • 1.Sakaue S, Kanai M, Tanigawa Y, Karjalainen J, Kurki M, Koshiba S, Narita A, Konuma T, Yamamoto K, Akiyama M, Ishigaki K, Suzuki A, Suzuki K, Obara W, Yamaji K, Takahashi K, Asai S, Takahashi Y, Suzuki T, Shinozaki N, Yamaguchi H, Minami S, Murayama S, Yoshimori K, Nagayama S, Obata D, Higashiyama M, Masumoto A, Koretsune Y; FinnGen, Ito K, Terao C, Yamauchi T, Komuro I, Kadowaki T, Tamiya G, Yamamoto M, Nakamura Y, Kubo M, Murakami Y, Yamamoto K, Kamatani Y, Palotie A, Rivas MA, Daly MJ, Matsuda K, Okada Y.:
    "A cross-population atlas of genetic associations for 220 human phenotypes."
    Nature Genetics doi:10.1038/s41588-021-00931-x. (2021)
  • 2.Uffelmann E, Huang QQ, Munung NS, de Vries J, Okada Y, Martin AR, Martin HC, Lappalainen T, PosthumaD.:
    "Genome-wide association studies"
    Nature Review Methods Primers. 1:59. (2021)
  • 3.Tomofuji Y, Maeda Y, Oguro-Igashira E, Kishikawa T, Yamamoto K, Sonehara K, Motooka D, Matsumoto Y, Matsuoka H, Yoshimura M, Yagita M, Nii T, Ohshima S, Nakamura S, Inohara H, Takeda K, Kumanogoh A, Okada Y.:
    "Metagenome-wide association study revealed disease-specific landscape of the gut microbiome of systemic lupus erythematosus in Japanese"
    Annals of the Rheumatic Diseases. doi:10.1136/annrheumdis-2021-220687. (2021)
  • 4.COVID-19 Host Genetics Initiative.
    "Mapping the human genetic architecture of COVID-19"
    Nature. doi:10.1038/s41586-021-03767-x. (2021)
  • 5.Naito T, Suzuki K, Hirata J, Kamatani Y, Matsuda K, Toda T, Okada Y.:
    "A deep learning method for HLA imputation and trans-ethnic MHC fine-mapping of type 1 diabetes"
    Nature Communications. 12:1639. (2021)
  • 6.Sakaue S, Hirata J, Kanai M, Suzuki K, Akiyama M, Lai Too C, Arayssi T, Hammoudeh M, Al Emadi S, Masri BK, Halabi H, Badsha H, Uthman IW, Saxena R, Padyukov L, Hirata M, Matsuda K, Murakami Y, Kamatani Y, Okada Y.:
    "Dimensionality reduction reveals fine-scale structure in the Japanese population with consequences for polygenic risk prediction"
    Nature Communications. 11:1569. (2020)
  • 7.Sakaue S, Kanai M, Karjalainen J, Akiyama M, Kurki M, Matoba N, Takahashi A, Hirata M, Kubo M, Matsuda K, Murakami Y; FinnGen, Daly MJ, Kamatani Y, Okada Y.:
    "Trans-biobank analysis with 676,000 individuals elucidates the association of polygenic risk scores of complex traits with human lifespan"
    Nature Medicine. 26:542-548. (2020)
  • 8.Hirata J, Hosomichi K, Sakaue S, Kanai M, Nakaoka H, Ishigaki K, Suzuki K, Akiyama M, Kishikawa T, Ogawa K, Masuda T, Yamamoto K, Hirata M, Matsuda K, Momozawa Y, Inoue I, Kubo M, Kamatani Y, Okada Y.:
    "Genetic and phenotypic landscape of the MHC region in the Japanese population"
    Nature Genetics. 51:470-480. (2019)
  • 9.Sakaue S, Hirata J, Maeda Y, Kawakami E, Nii T, Kishikawa T, Ishigaki K, Terao C, Suzuki K, Akiyama M, Suita N, Masuda T, Ogawa K, Yamamoto Y, Saeki Y, Matsushita M, Yoshimura M, Matsuoka H, Ikari K, Taniguchi A, Yamanaka H, Kawaji H, Lassmann T, Itoh M, Yoshitomi H, Ito H, Ohmura K, Forrest A, Hayashizaki Y, Carninci P, Kumanogoh A, Kamatani Y, de Hoon M, Yamamoto K, Okada Y.:
    "Integration of genetics and miRNA-target gene network identified disease biology implicated in tissue specificity"
    Nucleic Acids Research. 46:11898-11909. (2018)
  • 10.Okada Y, Momozawa Y, Sakaue S, Kanai M, Ishigaki K, Akiyama M, Kishikawa T, Arai Y, Sasaki T, Kosaki K, Suematsu M, Matsuda K, Yamamoto K, Kubo M, Hirose N, Kamatani Y.:
    "Deep whole-genome sequencing reveals recent selection signatures linked to evolution and disease risk of Japanese"
    Nature Communications. 9:1631. (2018)

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

岡田 随象
チームリーダー

採用情報

募集職種 応募締切
テクニカルスタッフⅠまたはⅡ募集(IMS208-2102) ポストが決まり次第
研究員、特別研究員またはリサーチアソシエイト募集(IMS208-2101) ポストが決まり次第

お問い合わせ先

〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22 西棟(W319)
Tel: 045-503-7047
Email: yokada [at] riken.jp
※[at]は@に置き換えてください。

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