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生命医科学研究センター システム遺伝学チーム

チームリーダー 岡田 随象(M.D., Ph.D.)

研究概要

岡田随象(M.D., Ph.D.)

30憶塩基対で構成されるヒトゲノムには、ヒトの生命現象を規定する膨大な情報が含まれますが、ごく一部しか解明されていません。私達は、ヒト集団における大規模ヒトゲノム情報・オミクス情報・表現型情報が構成する多次元・多層的なネットワークの解明を目標としています。遺伝統計学や機械学習の新規手法開発を通じて、オミクス情報を中心とした数理システムとしての生命現象の再定義を試み、新たな疾患病態の発見、新規創薬、ゲノム個別化医療の社会実装を進めます。私達の活動に興味を持たれた方、是非とも一緒に研究を進めましょう。

研究主分野

  • 医歯薬学

研究関連分野

  • 情報学
  • 複合領域
  • 数物系科学
  • 総合生物
  • 生物学
  • システムゲノム科学関連
  • 医化学関連
  • 生命、健康および医療情報学関連

キーワード

  • 遺伝統計学
  • バイオインフォマティクス
  • 人工知能
  • オミクス解析
  • 疾患ゲノム解析

主要論文

  • 1. Namba S, Akiyama M, Hamanoue H, Kato K, Kawashima M, Kushima I, Matsuda K, Nakatochi M, Ogishima S, Sonehara K, Suzuki K, Takata A, Tamiya G, Tanikawa C, Yamamoto K, Yamamoto N, BioBank Japan Project, Ozaki N, Okada Y.
    "Inconsistent embryo selection across polygenic score methods"
    Nat Hum Behav, doi:10.1038/s41562-024-02019-y
  • 2. Wang QS, Hasegawa T, Namkoong H, Saiki R, Edahiro R, Sonehara K, Tanaka H, Azekawa S, Chubachi S, Takahashi Y, Sakaue S, Namba S, Yamamoto K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Makishima H, Nannya Y, Zhang Z, Tsujikawa R, Koike R, Takano T, Ishii M, Kimura A, Inoue F, Kanai T, Fukunaga K, Ogawa S, Imoto S, Miyano S, Okada Y.
    "Statistically and functionally fine-mapped blood eQTLs and pQTLs from 1,405 humans reveal distinct regulation patterns and disease relevance"
    Nat Genet, 56, 2054-206. (2024)
  • 3. Tomofuji Y, Edahiro R, Sonehara K, Shirai Y, Kock KH, Wang QS, Namba S, Moody J, Ando Y, Suzuki A, Yata T, Ogawa K, Naito T, Namkoong H, Xuan Lin QX, Buyamin EV, Tan LM, Sonthalia R, Han KY, Tanaka H, Lee H; Asian Immune Diversity Atlas Network, Japan COVID-19 Task Force, The BioBank Japan Project, Okuno T, Liu B, Matsuda K, Fukunaga K, Mochizuki H, Park WY, Yamamoto K, Hon CC, Shin JW, Prabhakar S, Kumanogoh A, Okada Y.
    "Quantification of escape from X chromosome inactivation with single-cell omics data reveals heterogeneity across cell types and tissues"
    Cell Genom 100625. (2024)
  • 4. Ojima T, Namba S, Suzuki K, Yamamoto K, Sonehara K, Narita A, Tohoku Medical Megabank Project Study Group, Biobank Japan Project, Kamatani Y, Tamiya G, Yamamoto M, Yamauchi T, Kadowaki T, Okada Y.
    "Body mass index stratification optimizes polygenic prediction of type 2 diabetes in cross-biobank analyses.
    Nat Genet 56, 1100-1109. (2024)
  • 5. Tomofuji Y, Sonehara K, Kishikawa T, Maeda Y, Ogawa K, Kawabata S, Nii T, Okuno T, Oguro-Igashira E, Kinoshita M, Takagaki M, Yamamoto K, Kurakawa T, Yagita-Sakamaki M, Hosokawa A, Motooka D, Matsumoto Y, Matsuoka H, Yoshimura M, Ohshima S, Nakamura S, Inohara H, Kishima H, Mochizuki H, Takeda K, Kumanogoh A, Okada Y.
    "Reconstruction of the personal information from human genome reads in gut metagenome sequencing data"
    Nat Microbiol 8, 1079-1094. (2024)
  • 6. Edahiro R, Shirai Y, Takeshima Y, Sakakibara S, Yamaguchi Y, Murakami T, Morita T, Kato Y, Liu YC, Motooka D, Naito Y, Takuwa A, Sugihara F, Tanaka K, Wing JB, Sonehara K, Tomofuji Y, Japan COVID-19 Task Force, Namkoong H, Tanaka H, Lee H, Fukunaga K, Hirata H, Takeda Y, Okuzaki D, Kumanogoh A, Okada Y.
    "Single-cell analyses and host genetics highlight the role of innate immune cells in COVID-19 severity"
    Nat Genet 55, 753-767. (2024)
  • 7. Yamamoto K, Sonehara K, Namba S, Konuma T, Masuko H, Miyawaki S, BioBank Japan Project, Kamatani Y, Hizawa N, Ozono K, Yengo L, Okada Y.
    "Genetic footprints of assortative mating in the Japanese population"
    Nat Hum Behav 7, 65-73. (2024)
  • 8. Namba S, Konuma T, Wu KH, Zhou W, Global Biobank Meta-analysis Initiative, Okada Y.
    "A practical guideline of genomics-driven drug discovery in the era of global biobank meta-analysis"
    Cell Genom 2, 100190. (2024)
  • 9. Japan COVID-29 Task Force.
    "DOCK2 is involved in the host genetics and biology of severe COVID-19"
    Nature 609, 754-760. (2024)
  • 10. The GIANT consortium.
    "A saturated map of common genetic variants associated with human height"
    Nature 610, 704-712. (2024)

研究成果(プレスリリース)

イベント・シンポジウムなど

刊行物

関連リンク

メンバーリスト

主宰者

岡田 随象
チームリーダー

採用情報

募集職種 応募締切
研究員募集(IMS208-2301) ポストが決まり次第
テクニカルスタッフⅠまたはⅡ募集(IMS208-2102) ポストが決まり次第
研究員、特別研究員またはリサーチアソシエイト募集(IMS208-2101) ポストが決まり次第

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